Map Locations of contig_44319 (12694 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_44319

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_60367 2 1197 bp MLOC_60367.1 Available Available LOC_Os01g46040.1, FRAME:+3, EVALUE:2e-60, 13101.m04726 protein bromodomain domain containing protein, expressed
MLOC_60368 3 3032 bp AK354378 Available Available None





CDS Structure of MLOC_60367






CDS Structure of MLOC_60368






Contig Sequence (12694 bp)

>contig_44319 12694 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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TTGTTATGTTGCAGCTATGGTAGTTATTGGCGAGGCACAAGGATCGACCATTGCTTAGCT
ACACTGACAAGCGTTGTGTCAAATGCCGACTTCTTCGAGAGGCGTCTTGTCGAGCTGCCA
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CCAGTAGCGCCGCCCGGTTTCCCCAAGAAACCTATGCACTACCTTCCCGCCGCCGATCTT
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TGGGTGTTCGCCAAGCCGGTGGATACACACAGCCTCGACCTCCGCGACTACCTCTCCGTC
ATTGCCGAACCCATGGATCTCGGCACCGTCAGCCGCCGCCTTGAATTGCGTCGCTACCCG
AACCTGCTCTCCTTTGCCAAGGATGTCCGGCGTACCTTCAGCAACGCCATGACCTACAAC
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TGGGCCTCCATTTTGGCGGCGCTCCCGTCGCCGCCGCCGGTCGCTGAGCGCAGGGCAAGG
CTCAAGGATGAGCTGCCGCAGCTGCCGGTGGACTTGCAGGGGAAAGCGGTCGTCATTATG
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GCCGACGAGGCGACTCTTGACAAGCTCGAGTGGCTGCTCGCTCTCGCCGCCATGAAGCTG
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GCTCGGTAGCAATCTTGTCCAAAGCGATCATCTTTATTGCAATGCTGTTTAGCAATCTTG
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TGAATTTCGTCATTTCGGAATTGGTAGTGATATTGTCACCATGCCTTTCTGGAAGAGTGA
ATTGCATTGTTGATACAAGAAGTTCAGTTTTATACATCAAGTATCAAATTTTACACCTGG
GTAGATGATGCTGCATATCCGATCAAAAAGAGTGTCGTGGTTTTATTTCAAATTTGTAAT
AAAACCACGACACTTATTTTTGATCGGAGGGAGTACAAAACAGCCCGACCCACTCACGCG
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TGATTAATCTCTCTGTAATTGGTAGTTAATGGCACAAATTTGTAGTTGATTTGCGAATGC
TGTATGGTATTAAGTGGTAAATGTATCAGTAGTTTCCTGTTTTCGTAGATTGCTCTGTTA
GGATTACAATTCCCTTTTTCACATATGTTCATGCAAATACTTAGAAAGTTAAATCTTGCA
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GGATTTGACGTCCAATTTGAGAATTTAGGTCCAGTGGCTATTCTGAAGATTAAATGATCA
AGGAGGACCAAATTAATAAGTTGCAACTGCAAGTTTTCAAAAAACTACATGGCGTGCCAC
GTTGGCTCACGTGGTTGGACTGAGCTGTTTTGTGCAACCTCTGTTCATTAATATAAGACA
TTTTTTAGACTTATGGTAAGTAAAAAAAATGTCTTATACTAACGAACAGAGGGAGTACTC
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TGATTGTTGGAGTTTGTGCTTTGTGATTCTTCCCTCATGTAGCTAATTGGACGGTGCAGG
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ATGTAACTGGTGCACCACCCATTTTTTCTGATCAAAGATGCGGGTGGAGGTTTTCGTTGT
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TTATGAGCTATCTAGAGAGACGCAGTAAAATATGTTATTCCAGCCTTTAGAATGCCATGT
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AAAGCTGTGAGAATTGAGGAGTAGGCATATTGTTTTTGGCTTATTCACGAGATGTGAAAT
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TCTGGTCTGGTAGTTTTCCTTAGCTATCAAGATAAGCTTGCTGCCTGACAACTAGTAGCA
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AGAACACTAAGTCACTAACCATCTCATCAACCCACAATTTTAGTCGACCGTGAATCTGTC
ACAACTTCCAATGGTTGTACATTGTGAACGAAGGGAGCTTTTGACATAATGTTTCACTTC
AAAATACTAATGTTGCTGAGTATAGTCTGTTAGATTTTGAACTGAGAGTTTGTGGATGTC
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TTTGAGCTTGAAAACCTACTGTTCTTTTGTACGCACTGATGGAAAGGAAATCTACCTCAA
ATACCAGTTTGTAGTCATATTATGCACGGGGAGTTGCTGCATGTCTGCTACTCGCATTTA
CAACTGCTGTTAGAATGCTTTGAAGCATTAACCATACTAATTTTTGTACTTGAGATTGTG
ATTCTTATGCTTAGGTTTCTTTGTTTCCCTTATTTTGTGAAGTGCTCTCCTGATAGTTGA
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CATATCTTTGCTTCTAGTTGTAATATTTTGTTTTGCCTTGGATCACGATGTTGCCCTTTT
TGGTTGCAGGAGGCAGGAGCGCTGGATAATCAAATTTGATGCGGCGCTGCATGATTTTAC
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TCTGGGTTATTCTGTTTGTTGGTATGATGGAATTAGACTTTAGACTTGTGATGATACTGA
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TTAACTTTCCTAACTCTCCATTTGAAATTGTCTTTGCTTCCTGCGCTTCTTTCTTAAACA
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GATGAGGATCTGTGCAGCAGCACAAGAGAGTTCAGGCTAGGCTGATGGCAGGATGTGCAA
CTGATTTTGTTACTGGTGATGGTCTTATTTTGTTTCAGTAGGTGGTCTTTTGTTCCTGGG
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GGCACTGCAGTAATCAACGTCCCGCGGAACAAATAAGGGCTCAGCACCACCTTATGGGAG
GATACGGACACTCTTCCACCAGAATGCAAAGTCATACTCTTATTATTGCTGATGAGATGA
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CATACACTGGGTTTGCTCGGCCAACTGAAGCTGCACTGTCTATTCTGGTCCACTTCAGCT
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TTGAACGTCAGGCTTGGGTACAGGAGCTGGTGCAGCTTTCTTGCGATCACCGCCTTCACC
ACGTCCAGTTGCACTAGCATTCTGGTCTACAAACAAGTTAAAGAACTTTATACGCAGACA
GATTCGCATATAAACAGCGAGGTTTCCTTTTATGATGGTTTGACCCATAACCGCGATGCA
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CCACTATATGTGATCACTATAACGACATGCTTAAGAGATTATCAACGTTATCCTTATCAA
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TCTCATCAACATTGGGAAACAAATATGGCGGAAGGTTAGTCAATTCATATACACTCAAGT
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TGTATTCAACTCCTTCTGGAGCAGGATCATCTTCTTCTCTTACCATTACCATCTGTTTCA
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AGACCATTGCATTTTACTACTACTGTAAATGAGTGCATAAGCTGACTATGCACATAGACG
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TTGAGCTTTGTCGATGTTAATCGGCGGCCGTCCGGCCCTGGACCATTTGCTTCAAAGTAC
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CCTAGTTTGAGCAGTTGGTCAAACAGCGCGCGGACGTGCTGCTCTGCCAACTACCATCTG
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CCGGGAATCCAACTCTGTGATAAGATCCCTTCCCCTTTTGTTTGCCCCGGAGAGTCCAGT
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TTGTTAAATACTTTCATTCTCCTTCTGTTATACTTGCGGTTTGGACGGCGGCTTCGGCCG
AGACTTGTAATTTTGAATTCCTCTGTTAGTTGTTGTGAGGGTGGTTGGGCGGAATCACAC
GCAACTTTATTGCTGCGACCTAGCTAGATCGAGAGCTACCTTACACTTGATATCAGATTT
GGTGGTCCTGGAGCTGTCATGGCACCCGTACGTGACGCGGTGCCGTGATCGGTGGCGAGC
GGCGGTGATGGACAAGCTGTCGGAAGAGGGGCGCGGCGTGTACTCGTTGGTGTGGGCGGA
CTTCACCGCCAATCTGGATCAGCGTTTCAAGGAGCACGGTGAGAACCTTCTTCAAGTCGT
CGACAAGCTCATCCAGGCCAACACCACTACGCTCGACGGGCTATTGACGGCCCGTGTCGA
CGGGGTGCGGGAGGAGCTTGTGCTCGAGCTCTTGGCCGTCCGCGCTGACTGGCCGAGAGA
AGCGCCTGGGCGGCGTGAAGCTTCGGCCATTCGACTTGCTAGGGGTGGCCGCAATTCTGC
CGTCGACTCCCTTGGCTTCTGCCAGGATCATCGGGTGAAGGCACATGCTCCGTATGTCCC
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TGATGCGCCTTACCCTGATGCTGCTGATGCACTATCATTTGGTGTGCGAGTGGATCTCCC
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CTGGTGTACTCCTCAACATTGTTGGATTTCGTTAGCTACATCGCAATTTGAAGGTACAAC
TGCTCGCTGGCTTGAATCGATGCAACTCGCTGTTCCCAAGCATCCTGGTCTGAATTCTCT
TCAAGTTTGCAGAGCCGATTTGGTCGTAATCAGCATCAGACATTGTTGCGTCAGTTGTTC
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CAACTATCTGCTTATGAGGAAGCCCCCAATCATCTCCACTACACCACTCGCTTCCTAGAC
TGTCTGAAGCCTAGTGTTCGTGTGGTTGTTGCTTTGAAGAAGCCCAAGGATTTGGATGCT
ACATACGATCTGGCACCGTTACATGAAGAGCTTGCTGGTGGTCTTAGATCTTTGAACAGT
TCTACAAACCAGAGATCATGTGCTCTTCATCTTCCTCTTCCACCTAGAGCTAGTTTTGCT
GATAGCAAACGATCAACTGAAACTCTCAAAACTGCTCCATCTGAGGATAAGTGATCTGCA
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GGTATAATTGGGTTGGATTGGCTTGCTCAACACCGTCCAATGCACGTTGATTGGGTTCAG
AAGTGGATATCCTTTCCTTATTAAGGTGAAGTGGTTACTTTGCAAGGCTTGTTACCTGAA
AATGTGGTTGTTGCGGTGTTTTCCATTTCCTTGTTAAGACCTGTTGAGAAGCAAGTTCAA
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TTACCTCCTAGAAGACTCAAAGATCATACAAATCTTTTAATTCCAAGTGCAAGACCAATT
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GCAGGAGCTTCTTGGTTTACCAAATTGGACCTCAAAGCTGACTATCATCAAATCAGGTTG
GCACCTGGGGAAGAGTACAAAACAGCATTCCAAACCCATAATGGACATTATGAATTCAAT
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TCTCAAACTGCAACCATATGCTCAAACTTATGTTTATTCCATGCAGAATCAGAAGATGGC
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