Map Locations of contig_44290 (8627 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_44290

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_60337 1 1007 bp MLOC_60337.1 Available Available LOC_Os02g25780.1, FRAME:-2, EVALUE:2e-55, 13102.m02789 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_60337






Contig Sequence (8627 bp)

>contig_44290 8627 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TACGAGATTCACTCATTTTGCTCCGTANNTAGTCTATAGTGAAATCTCTAAAAGATCTTA
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GAAGAAGATCATTCACATTGAAGCTAGAAAGCTAGCCAGTACGTTGCGAAGTAATTTTAA
TTTATAATTTTATTAAAATACATGTAGATGTGAGATAAGTATTAAACATTTAAGTCTTAT
ATCACTTTTATTTATTTACACCATGGCTCACTTCCGTATTACAAACATGCCGGCAGATTC
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GAGGACCTCGACGCCCTTGTCGACCGGCAGGTACACGGACCGCACTACCCTCGTCCCTGC
CGCCATGGACGCTTCGAGCGCCTTCGTGCCACGCCGCCTCCCGTCGCCGTGGCGCACTAC
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CTAGGAGCGGAGAGCTGTCGAACAGGGCCTAAATATCCATTGTAAATGTTTATTAGTGGA
GCTGCACTATTCAGCCTTCCCAAACGCACGAGTTGAAGCCGTCCGATCACGCGGATCACC
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TTATGAAAGGGGTGGTTATATTTCATGAAACCCTTAATTTTATCCACAATCGGAAACAAA
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GACCTTTAAGGGATTGAAATAGGGGAATTGATGCGGCGCATCCCATGATCATCACCATGG
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GTTGAAGACCAAACAGCCAAGTCTCAGGCGACCCCAGGCGCACGGCCTTCAAGGACCCCA
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CCCACGGGTGACTTAGCCGTGAGCATGGGCCTCACACGAGGCTACGACGGGAATTGCCCA
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GTTAGGGTTAACTTATGTTTAGCACTTGAGATTGTTGAGCATAGCTGCTTCTACTATCCT
TCTTCCATGGAGATGAACACCTCTATGTGAGAAGATCCTAGTGGATGCCAAGGCCCCCCT
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TTGTATCCTTATGTTGACTTTGGATCTATGTATCTCGTGTGTTTATGTGGATCTAGTGGA
TGTGTGATTGGAGATCGTTCTTGAGTTCGTATTTTCTATTTGATTTTTTCTTTTTTTTCC
TCGAAGTGTGAAAAGATCGACACCCACGGGTTTGCCCCGTATTAGGGATGTGGTCTCTCC
TCTGTTTTTGACATTATTGTTGATGCACTGAACGTGATCATTAATAAAGCTAAGGAACGC
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CTATCTTTCTATTAGAAGATGATGTGGACAATGCAGAAAATCTATAAATGATCTTGTGTG
GTTTTGAGCAGATGTTCGGGCATAAGATCAATTTTCATAAAAGTGAGCATATGATGTTTG
GGGATGCTATTAACAAACAATCCATATACCCAAAAATATTCACTTGTTAAATGGGAGATA
TACCTACTAAATATCTGGTGATGCCTGTTTCCAATGACAGGATCAGAAACAAGCACTGGA
CTTGTGTGACTGATAAAATTGAAAAAAGATCCAGTTGCTCACACTATTGTGGTCTATTGC
AGGGAGGATTACCTTAGTTCAGTCTTGTTTGACAAACATACCCATGCTTATGTGTCATTT
TATCCTGTGTCTGCTGGTGTGGTTAAATTTTTTGACTTGTATAGAGCCAAATTAGTACGG
CAAAAGGATGAGAATCGAAAAAAGTACCACTTGGTTAATTGGAAAAGGTGTTTTAGACCA
AAAGAATTTGGGGTGCTCGGGATTCTAAATTCAGAAATTATGAATAAAACATTGTCAACT
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TTAAAGGTCAAATACATGTTCTGTAAATATGCTAAGAAAAAATTAGGGGACGGGAAAATA
CCAGTATCTGGGAAGATATTTGGGTAGACAAAAAGCCTTGAAGGATGATTATCCTAGATT
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NNNNGAATGCCGGCAGTTGGAATTCTAGACTAGAAAATGAGAAAATCTGAGAGACCTATT
NNNNNNNNCTCCAAAAGTCCTGAAAAGTTACAGAGAATTGTTTTGGGATATATAAAAAAT
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