Map Locations of contig_44194 (9860 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_44194

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_60101 3 1862 bp MLOC_60101.1 Available Available LOC_Os07g46440.1, FRAME:-3, EVALUE:5e-161, 13107.m04899 protein ribosomal protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_60101






Contig Sequence (9860 bp)

>contig_44194 9860 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGGTTGCTGTTCATTCAGATACTCAAATCTGATTTAAACTCCATCAG
AGAGAAAATAAATTCTTGCTCAGGAATTTCCGAATTGAGTCGTATTTGTAGCACCTGCTC
ACTTTATTTCACTGTATGGGTTCTTGTAGGGGAGCCAAATAATTTCTGAAGGGAGTCCTA
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TTTACGATACTTATTTTGGGACTATTTTGGGACGGAGGGAATACAACATTGTTAAGTTTT
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AATTCTTTTGTAGTCGTGTAAAAAAAATATCTCTCTCCTGATTGTCTATATCTCTTTCGA
CCTAATTGATTTACTTGTTGCTAACTAATGAGTTAGTTAAAAGTAATTTCGTCCTAAATT
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AGAGGGACATTTTCCTTTTACTGATCACACCCCCTCATGCGTTTTCTTTTTCTTTTTCTT
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TTTTTGTTATCAAACGGGGCGGGCTAGCGGACAATACCATTGTACAAATGTAGTGTTAAT
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GGATCGTCTGTCTCATCCTTCAAATCCCACGACCACGGCTCGGCCGGGGCCGCCTTCCTC
GCGCTAGGCGCTGCCGCGGCCGCGTCCTTTCTCGCGGCGAACGGATCGTCCTTCTCATCC
TCCGAATCCAACTTCCACGGCTGGGCCGGGGGCGCCTTCCTCGCCGTGGGCGCTGCCGCA
GCCGCATCCTTGTAGATCTCCTCGAACACGTCGGCCTTGTCGCCGTCCTCCGCGCGGAAG
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AAGGCCCACGGCCTTCTGGTGTCGTCGTCGCCGCCGGAGGTGGAGAGGAGACGCGGCGAG
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GGCGCGGCGGCGGCGTTGGTGGTGGTCAGGGTCTGGAGGCCGCGCCGGAGATGGTGGGAG
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GCTTCGTTTTCCACGGAGCGGAAAACACTTGAAGGCTTGAGCATGCATTCCAAGTTTCCA
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TGTTGTCTCTTTGGATCTTCGGAGCTGGTGCATCTATCAAAGGAATCGGCTAGATAGTTA
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GATGTTCTTCTAACGTCTATTAGATCTAGTTGTTGCGGTCTTCAAGACCTTGTATGGCAA
GAACATTTGCAAGTGTCACTATCACTTACTATTTGTTCAGAGTATTTTTCGAGCTAGAAG
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ATACATCTCAAACGTATCTACATTTTCAAGCAATTTTTCTCTCGTTTTGGACTCTAATTT
GCATGATTTGAATGAAACTTATCCGGACTCACGTTGTTTTCAGCATAATTATCATGATGT
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AAATNNNNTTTGGCTCCCCTTATGTCGAATCAAATAATTAGGGTGCAATACTACCCGTGA
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GCTCTCCAAACAAATATTATATGACTGATGTACCTGAGGGTTATGTTATGAATGGGGAGA
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AATCTGATCCTTTCCATGGTTATGANNCTAAAACTATTGTGGCGCACCTTACTAAATTGC
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AGAAAAACATGCAGTAAAAAGAATGTCACTTTTAACAAAAATGTGAATGTGAACTACATA
TGTATGGTACATGCGACCAACACATATATTGTCAATACAAAATCTAATGCAAAAAATAAT
TTAAGAGTAACATGCATGAATTAATGATGTGGTGCTTCCATGCATAGAGTAATGAAAAAA
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