Map Locations of contig_441456 (5653 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_441456

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_60041 5 1525 bp MLOC_60041.3 Available Available LOC_Os06g39260.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13106.m04069 protein solute carrier family 35 member B1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_60041






Contig Sequence (5653 bp)

>contig_441456 5653 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTGAGAATTTTGAAATAAAATATTCAGAATTTTGAAATAAAAGTTTGAAGAAAACATAAA
ATGTTTGTGAATTCAAAAAATGCTCGGGATTTTTGTAAAAAGATTCACATATTCAGAAAA
ATATTCATAATTTTGAGAACAATGTTGGTGAAAATAATAAAATGCCATGATTTTGAAAAA
GGTTTGTGTATTATTTTTTGAGTGCAATTAGAAAAATGTTTGCTAATTCAAAAAATGTTC
ATCCATTTCAAGAAATATTCTAAAATTTAAAAACATAATATGATCAGCATCATTGAATAT
TATAATTGTTTTTTCTTCCGTTGCAACGCACGGACCCTTTTGCTAGTTACTACCTATTCC
TAAAAACATGGTGAGACATATTGTGCTAAGAGATCACCTCTTGTTTATGAGTTTCTCTTC
TTTATCTCATCATTTATTCTATATGATATTTTTAAAATATCACCATTGTTACAAACCGTT
ATAAACGGTTTTTTTTGGGCCGGGATATACGAATCTGCTTGAGATGCTCTAAACTCTGAT
CTGAAGAAAAATCGAGAAGAGTTGAGCTCAGACCCACACAGCCTCAGAGACTCGGACTGG
TCCTTCCACGCCAACCCAGCCAATACGGCGTCCCCGCTGGCACCTTCCGCCCAACCACAC
CACGCCACGTCAATCCTCTGACGCGCGCTCTCCTTTTCCGCGGTTGCGCCCAACTGCTAT
AACACTTGCCTTCTCTGACCCCCGGGAGCGTGCAACCGATCCCCCTCGCCGGCGAAGGCC
ACACGAACGAACGCGCCATGGTGTCCGCGCGGAAGGGCCAAGGCCGGGGAGGCGGGGTCC
GAAGCCGCCCCCGCGTCGACGGCGGCGGCAGCCTGGCTTCGCGCGTGGCCGTGCTCGCCT
TCTGCGTCGGCGGGATCTGGTCATCCTACATCACCCAGGGGATCCTCCAGGAGACGCTGT
AAGCACCCTCTCTCTCCCCCCATCCCCAATGGTGTTGGCTCGCGACAGAGAGAAACATGG
CTGACTTCGCCGGGTTCTCTGCTTTCCCCATCGGCTCAGATCGACGAAGCGATTCGGGCC
AGAGGAGCGGCGGTTCGACCACCTCGCGTTCCTCAACTTCGCGCAGAACGTGGTCTGCTT
CGTCTGGTCCTTCATAAGTGAGCACCCTCGAGCTGCGCTTTTGCATTTCTCACCGAATGC
GGCCGCGATTTCGCTGCTCGTGGACGACGATTGCGTGTGAAGGGGTCGTGACTTTGGTCG
GTTCCTGCAGTGATCAAGCTGTGGTCGGGTGGTAGCAGTCCTGCCGGGCGGGCGCCTCTT
CTGAAGTACTGGGGCGTCAGCATCACCAACACCATCGGCCCGACCATGGGGATCGAGGCG
CTCAAGTACATCAGCTACCCGGCTCAGGTTTGGATCTTGCTGCTTTTGCCGTCTCAGCTT
CTTGGGTGTATGGGATTCTATGTGGATGCTGTATTTGCAATTAGGTGTTGATTGGGCTAA
TCGTTAATGTAGTAAGTGGTGGTTATGGAGTACAAATGTTCTAGTCTTGAGTTAGTTAAC
TGTGCTAAGAAATTGGCCAATGGCTGATTGGAGTTCTAAGGCAGCAGTATGGGCTTACAA
ACCTAAACGGGATACTCCATTGGGGGTGCTCACTTTTTTATCCATAACTATCAGAAAATA
AAAACGAGTACTTAGTTACCACTGGATGTCACATTGATGTACAATCTTGGGTATACTGAT
ATTTTTCAACCTATGTTTAATACTATACGCAAGAGTGCATGACATTATACTAATTTATCC
ATAACTATCAGAAAACTGGTAACACGCCTGCTTCATATGATCATATCTCAACCTTGTGTG
GAATTGGAATTTGATGATTTAGTTAAATATCAAAGATGCATTTCCAATTGACGAAATATT
GCTGTTCTTTTTAATGATGCCCAAAACTACTGGAGATAAAGGATCTTGAACTATTTTCTG
TCTGTAACAGGTCTTGGCAAAATCTTCTAAGATGATTCCAGGTGAGTTTTGCATATATTT
ATGCATACAATGCAGTTTTTATTTACACTTTTTTTATATGAATGCTGCATATAATGACTT
GTGATTGGTGCGCCAGTCCACTTCATCATTTACTGAGTAAAGTTAAGTAGTTAACTACAC
CTTTTTATGAATATCCAAAACTGTGCATGTCATCAGTATTATTAACCAGGGGCTTAAAAC
AAACAAATGGGGTCTCAAGGTTATTCTGGATCATCGTCTCCCAGTCGAATGTAGAGGAAA
TTTATACATGAGCTACTATTGCTATGCCCACTAACTGTCAAGTATATGCAGCCGCCAAAA
ACGAACTAGGATTTTATTTTTGGTTCATGAAAATGTCTGAAAATAACTAAAGTAGACTCT
CAGACAAATCTCTGTACACTACTGAAACTTTTGGAACTTCATTTCCATTTTCCAATCAAG
CATGTGCGGAGAGTGGGTCATTTTGTATCACAAGGAGCATTTTGTTCCATTTTGCCACCA
TGTTATTGTTTCAGCTATCAGTACACCCTGCACACTGGAAACCCTTCTGTGCATTGTTTA
CATTTCCAATCTCAAGCATGTATAGTTGATGTCACATAGATAACTGTGTTACTGAGCAAT
CTGCGTTAAGTGTTTTGAGTAACGATTAACCTTTCATGCTTCTTAGCCTGGACAGCTTTG
TACTGGTCTTTCTAACTTTTGATTCTTTATGCACAGTTATGTTGATGGGAACTCTACTCT
ATGGTGTTAAGTATACACTTCCAGAGTACTTCTGCACCTTCCTTGTTGCCGGGGGCGTGT
CATCCTTTGCATTGTTGAAAGTAAGGAATTCTTCATTTTCATATATTAATCAACAAACCA
GCAATGAGCTTTGCATGCCTTTGATGATGCCACTGAAACCATTAAAACCTTTTGCCGATC
TATAGATTAAACTGAGAAAAAATAATTGATGTCATATTCCATACGGTTCTTTTTTCTGAT
TAAGTCTGAACTACAAGACACATCAAATGATCAAAATCATTATAACTAAGGCTCTGCTTA
GCTAGCTTTTATGTAGACCCTGAGAAAGAAGACGGATCAAAATAATTGTACTTCAAGTCA
CTCCTGAAGCTTTTGTTTGTTTTTACTGAATCAGACAAGCTCGAAGACTATCAAGAAGCT
TGCTAACCCTAATGCTCCTCTTGGCTACGGATTGTGCTTCCTCAACTTAGCTTTTGATGG
CTACACTAACTCGACCCAAGATTTAATCAAGTCCCGGTAAACATATCTATCTGTTCCACT
TCAAAGCAAAATTGTGATATATTTTTTTCTGAATGGAAAGTAAAATTGTGTTATTGCAGG
TACCCCAAGACTAACCCTTGGGATATAATGCTTGGCATGAACCTCTGGGGAACCATATAC
AATACTGTAATTATGTTTGTGGCGCCTTTACTGTTTAGTAACTGGCCATACGCAAACGGT
TTTGAGGCGGTGAGTTTTTGCCGGGAGAACCCAGAGGTGGCCTGGGACATTCTCATGTTC
TGCCTATGCGGTGCCGTGGGTCAGAATTTTATCTTCCTAACCATCAGCCGATTCGGTTCT
CTTACTAACACTACCATCACCACCACCCGCAAGTTCATGAGCATCGTCATCTCATCAGTT
ATCAGTGGTAACCCACTGTCCATGGAGCAATGGGGAAGTGTTGTGATGGTCTTTTCTGGC
CTCTCTCTCCAAATATATCTCAAATGGAAGAGAAAGAAGGGCAGAGATCACAAGGAATGA
ACTTGGTTCTTATAAGTACATTTTGATTTGTAGCTTTGATTGCACACATTTGTTGTGGAG
ATATCCGGGAGATCATTAATGTAGTCCGTTGAAATTATAGAAAAGAGGTTTACATTTACA
GAAAATGTGTGAGATGCATGGTAATTGCTGATAGGGTTGGCTATTTAAAAACGGCTGGGT
AGTCTATTCTACTCAGGGTAGCAATGAATTGTGTTGCTTCTACTCGAACTTTCTTCATTG
TTGCAAAGTATGATGTTTTACTAACAAATACATATATTGCCAATGCATATTGGTACTGGG
AGGATTATATAAAAAGAAATATTGATATCAAATGACAAAACAGAGGGGCTATACAACAAC
AACATAGACTTTAGTCCCCAAAAAGTTAGGATAGGTTAGAGTTGAGACCCATAAACATGG
ATATGACACATGGGTAGCGAGATTTCACTCATCCTTGTCCATGGCTAGTTTTTTTGGTGA
TACTAGATCTTGCTTTAGGGACTCCTCATTGGTCCATCTTGACCTTTTTAACATTATCAA
TGCGTTTAAGCCGTCCGTTATCTATTGGAGCTTTTGGAGGCATGCATTGAATAGCCAAAA
TCCGTTATCTATTGGAGCTTTTGGAGGCATGCATTGAATAGCCAAAATCATCTCAAACGA
TGTTGAATAAGTTTTTCTTTCATCGGTGCAACCATAACTCTATCATGTATATCATCATTT
CGGAGTCGGTCCTCCCTTGTGTCTTCACACATTCATCTCAACACGCGGATTTCGCTACAC
CTAAGTGTTGAACATGTCGCCTTTTAGTTGGACAATCCACAATGTCATACAATATTATAC
TCCCTCCATTCCTTGATATAAGGTGTATAAATTTTTAAGGAAAAAAAAATCTAAAATATA
AGGTGTATTGCGTTGTACCACTCGTTTGAATATTTTTTAGGGATCTGATTACATTTCCTT
ATATAAGGGAAGCTCCTCTATTTTTTTTATGTCAATTAGTCACGTGTAATCTTATCCTAA
AACTTGTGAAATTTTCCCTCCACGTGCGTTTTAAATTTCCGTGTTAAAAACTATACACCT
TATATTTAGGAACAGAGGGAGTAGGTCAAATCGTCGTCTTACATAACCTAGAACTTGCCT
TTTAGCTTTTGATGCACTTCTAAAAACATAGAGGAGTATATTATATTAAAATAATTACTC
ATGTTAAATGACAGAGTACATCAAAACACATACTTCTACATGCCTCCTGTTTCTTTGAAA
GTTCATCGTTGCTTATGATGCACTTCTAAATACTAGTAACAAAAAGGTTTATTTATTTTA
TTTAATGCATTTGTAACAAAAAAGGTAGTTAGTTGTTTTGTCTTCAAATCAAATTACCGA
GTGCATAAGTTGTACTACTGGATTTTGTAAATCATGTATAGTTGTTCATAAAGGAACAAA
ATGTGTGGTAATCCACCAGATTCCTTTTTTTTCTGGGAGCAACATTCCTCACAGTTTAGA
ATTTAGAGATTTAGGCATTTCATCCATATTTGGTGGTAAAATTTTAATTTTAAGAATACC
CATATCATGTTGGGAAACGTTGCATGAGAAACATAAATTTTTCTACGCACACGAAGATCT
ATCATGATGATGATCATCTACGAAAGGAAGATCAGATCCATTTATCTCTTCTCCTAGCCG
CATGGGCCTTTGAGAGAGGCTTTGCCCAGCCCACCAGGGTTGGTCCACCTGTTCTCACCG
CCCACAAGGCTCTTGGGTTGCCACACCCCTCCTAGTGGCCCCTCGACACCCTTCCGGCAC
TCCCCGTACACTACCGATGAGCCCGAAATGTTTTCGGTGACCAAAACGGGACTTCCGATA
TATCAATCTTTAC