Map Locations of contig_441084 (8396 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_441084

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_60006 1 3252 bp MLOC_60006.1 Available Available LOC_Os08g12820.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13108.m01368 protein proteasome/cyclosome repeat containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_60006






Contig Sequence (8396 bp)

>contig_441084 8396 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGAGCGGCGGGGGCGTAGGAGCGAGCGACGGGGCGTGGGAGCGGTTCCCAATCGATAACA
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GAGCTTGTTGTGCTCACCGATGCCCCCGCAACGGGGCAGCCGGTGTCGGGTGCCTCTGCC
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CGGGAATTTGTTGTTTGTCAGAAACTGTATAATCATCAGAAGGTGAGAATTTAGCTCGAA
TGAGAATCGATCGGTTGGCAACTTAAATCTTTTTTTTTACTGTGATCGTAATTTTTGAGG
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ACATAGTTTCCTGAAAGTACCTTTCTACCCCCAGGAGCAAGTGCTCCTGATGAACAGTAA
AATAAAAAAAATTCAGAAATTTCTGAATTTATTGTGTGACCTTTCATAAATGTTTATTGT
GCATGCAAAAATTTGATCACGAAATCACATTGGTGAAAGTCATGCCAAAAAAACAAAATT
AGAGCTCCAAAATGATTTTGTAAGTAACATTTTCATAGCATCGATTTCTTTTTTTTAACC
ATGCCTTTCACCAATGTGATTTTGTGATGAAATTTTGCATGCACGACAAACATTTGTGAA
GTACGTCACAAAAAAATTTTACGAATAATTTTTGATTTTACTGTTCACACTATGAGCATT
TGCTACTGGGTGTAGAAACTCCACGTCCATAGTTTCCTGGTATAATCTCTAACTTGATGT
TATGATCTGAGTTCTGAGATGTCAATGCTTAATGCAACCTGCTCATTCACTTTGATGAAG
TTGTATCTCCTCAAGTCGTTGATTGTTATTTCTTCTTTCAAAATAAAAGTCTCGGAGTCA
TATTTCATTGGTAAATTATGTGCAAAAGCTCTTCCCATATCAGCCCTGGATGAAAGGCTT
GATTGTTAACTAGCTGGAGGTTATCTATAAATAAAAGGTTAATTAGCCAGAGGTGGTAAC
GTGCGTTCGAATTCATCATTGTTTGAACGCTGAGTACATTATGGAACAATTATCTTTCAT
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CCCTTAAATCCTTAAATCCTCAAAATTAACCGTTTTTTACGGGTTGAAACGAAAAAAGGG
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CCTACTGGTCGACGCGCGGGAGGGAATTTTCCATTCCTCCCGCCGAGCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCATGCGCCGGTAGTCGAAGCACAGATCGCGCAGGTGCGTCTCCTTCCTCCG