Map Locations of contig_44069 (10070 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_44069

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59964 3 4159 bp MLOC_59964.1 Available Available LOC_Os01g05670.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13101.m00549 protein 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_59964






Contig Sequence (10070 bp)

>contig_44069 10070 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TAGGAACGGAGGGAGTATAATATAGCGACGCGTACGTGCAGGTGGGGCGGGTGTGGATCG
GTCGCCGGTGGTGGTAAAACGTGGTAACGGCGAGGGAGCACGTGACGGACGGTGTGCGAC
GCGATGGGTGGAACGGGAGCACGGGAAGATGGTGCGCGAGGAATTACGGCCCGGCCGTCG
CGCGTTCGGTCGTTCGGGGCCGTTGGGCCGCCCGGCCTACCCCCCACCCAACCCAGCTGA
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GGCAGGGGCCTTGTGTCCCATGTGGGCCAGGCCGTCTCCCATGTTCTCTCCTCTTCCTCG
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AAAAAAAACACTATTATGCGAGTATTTCAATTAATTACAGTCACATGCTTTGTGGCTTCC
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GGAACATAGTGATAATCCATGTCCTGATCTTGGTCAAATATTTTTTCTAGAGGACTTGCT
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GCTTTTGAGCCTGCACCATAAGCTGCTAATGTTGAGAACAATGTTATCATTAGATCTTCC
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TGACATGATTGATCGTATTTTCCTTTATGCTTCTGTGCTTTCTGTATGAAGAGCACATGT
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CGGCATCGGGGTCGTGTGCCAGATCGCAAACTTCTACTGCCACATCCTGCTGAGGAACCT
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TGGAAAGCACAGCCGCCTGAGGAAGGCAAGTATACCTCTCCTCTGCACACTGAATTACTG
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CTGTTCCAGTGTTCAAAAGTTGAAAGCCATCATTCGATTTCACGCAAACATTCCTACTAA
TCGTGCCCTGTACCAGCTGTCAAACCTCAATTATGTAGCCCAAATGTTCTTATCCGAAGG
ATGTATTTTCTTATCCTATTGTTGAAAAAAATTCTCTGGGGTTTGTCGCGTCGTGTTGTC
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TGCTCATCTACAAAGTCATTAGAAGAAGAAGTCAATTAGGGCACGGCACATTAGAAGATG
ATTTGCTGGTCAATTAATTTATGGTTGGTGATGGCACGGCCACTCTGCTCTTGCTCTCTA
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GGACGCAGGATCACAAGCTTAGTTTGTCACTTGTCCTGCGACAGTGAGAGGCAAGGGGTA
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TCTAAAAAAATAATAATAATACAGTTTAGCATGTGAACAAAAATGACATTTCTTGATATC
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GTACCGTCGTGAGGCTTGTGATAACTTTTAGAAGTCTCGAGCTTGGATCTGTGCCTCTTC
TGACGGTGATTTCTTCTTTTTCGGGGCGTAGTTACGTGAGGTTGTGGCCTCAATCAATGG
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TTCTTACCTTTTAGAGATGTTCATACTATTGGTTTGGTTAACATATCTCAAGGTATTTTT
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GGGTGTTCAATTTCAAGACTCACATGGCAACTTATTCGGATACAAATAATTTTGAGCAAA
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TTAACTTGCTCAGATCCTAGATATATATTCTTTGGTACCGAGTAAAAGCCAAACATACCC
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TTCTGTCACCATGTGTACTTGGTTGCACCGTGGTGGTGGGTCATATGAAAATCAAAGTTG
GTGTGAATTTGATTTGACCCCTCCGTCCCTCCGACGAAGACCGGCGATATTTTATTTTCA
CTAGGCATATATTAATTTGTGTTGTATCTGATCGTGATGTGCAAAGAACTTCTCCACTTA
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ATAAGAACTTCGGTACTCAATCAATGCAACAAGATATAAAAAGTTTGGCACACAATTAAT
TGTGCAAAAGCTAGAACTTTTTATACTCGATTATTAGTTGTACACGATAAAAGATATATA
TGGACGGATTAATTGTACAAGATTTGCTTAATCAAATGGTTGAGTGTAGTGCATGCAGCA
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TTGTTCTAGGTCAAGAGGTACTATATGCCACTGGGAAATAAATCTTTACCTAATAATAAA
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TAGGTAATTAAACCCGCAGTACCTTTTTATGTGTTACGAACAGGAAAACGTTTCATTTTT
GCAGAGAGCCCCTTATGGCATTGGATAAGAGAAACGCATCTGGGCTGACA