Map Locations of contig_440426 (10335 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_440426

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59926 1 1052 bp MLOC_59926.1 Available Available None
MLOC_59925 1 1808 bp MLOC_59925.1 Available Available LOC_Os01g37910.2, FRAME:+3, EVALUE:6e-26, 13101.m03866 protein vacuolar-processing enzyme precursor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_59926






CDS Structure of MLOC_59925






Contig Sequence (10335 bp)

>contig_440426 10335 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTGTGAAGTGGAGGAAGTGGAGTGCAGTGCGGGTTGGGGCGGGTTGGGGGGGTTGGGGGG
AGTTTTTCCTCCCAACCCTCACTTCTAGAGGGTGGGAAGGGGTTTGAAGGTTGGACCTCT
AATTTTTTTTACGGGTTTAAGAATTTAAGGGTTCTAGTCTACGCCGTTNNNNNGATGAAA
ACTGTAAAAAAAACGATTATTATTAAGAGTTTGAGGGTTGGAGGGTTCTACTAAAGATGC
TCTAAGTTGCATGCAAGGCTAAGAAAGAGAGTTGTCTGCTGCATGCGAATTTTTAAAGTG
AAAGCATGAAACACGCGGACATAGTGTAAGTTGCATGTGACTGTGTGAGTGGATCTGACG
TACAGTGTTTGCACCTGTTTTATCGCGGTCAAAAGTAGCTGTGCTGAAAGGCTTTCTGCT
GCCGAATTATGCGCATGTAGCCTGCAAATCACAATGGGCAGTAAACAGGGTTCGAGTCGC
GAGAAATAAGAATCTATAGCCAACGGTGTGGATAGAGGGGTGTCCCTGCCCCGGGAGCTA
AAAAAACCAGTATCATTGTGTTTTGCTATTGCCTATTGGTCATGTGTTAATTGTGTGGAA
CTATTGGGACAAAGTTTTGTAGATTTGCTTCCAGTACTACAATAGTATACTCTTGCAGAT
GATACTATAGTTATTGGTTGTCTGACAAATAGAATTGTGCCTATCGTCTCCTTGTGCTTC
ACTACAGTTGTCCACAACTTACGATTTTCCTATTCCTATGATATTCATATATCCTATGAA
GCAAATGAGGTCTTAGTGTTTGTTCCAGTTAGGCACTTTATGTTTTTGAATATGTCAAGT
GGTTGTGTTGTGTCGTGTCATTTTACTAGAGGAACACGGTGTCATTCCTCATCAACTCTT
CCTTAAATCTAGTTTTGTGTTGGTCTATGCACATGATGTGTAGAGGACAATTATACATGT
GTCATATGGGGTATAATTAATGCAGTTACAACAAGTAATTTCTTTTGCCCTTGTTGTGCA
TGACTAATATTTTGTCCTCCCTATCTTCAGGTGCATACTTTTGAATCACAATGTGGCTCG
TTGGCGCAGTATGGGATGAAGCACATGCGGTCCTTTGCAAACATCTGCAATGCCGGCATC
CTTCCTGAAACGATGGTAAAGGTCGCTGCTCAGGCGTGCACGAGCATCCCAACCAACCCA
TGGAGTGGCACACACAAAGGTTTTAGTGCTTAAACCATAGGTGAAGCAACCTAGTCACAA
TTTCAGCTATTGCACCATACACCAAAGTTTCTTCCTATTCACATAGGGCTAGTATTACTC
CGTAGTGCTTGAACGAACATTAATTAGATGGAGAAGAATTATGCCGTTATTCAGCTATTC
CACTACACCAAATTACCTTCGTTGTGCCAGCTTATAATGTACATATACTATAGTAGAAAG
GTGATTTCATGAGATTTCTGTACATAATCATGATAGTTTGTGATCAGATGTGCAGCTCGC
AATTCCATATACCAAGAATACAAGAGCTACTATTTCTATGTAGACTGAGTAATCTCATAC
TATGAGCCGATATTTTCCCGTCCATTTAAAATCCCGCAACTACTGATTGAGCTTCTTGTT
CAGATGGAACAACATGATTTTCAAACCTTGGATAGAATGCATCACATTCTGATTCATGTG
TTTTGTTGTAACATGCATTTCTTATTTTCTGGTTGTGAAGTACGGAGTATGGCACAACTA
TAGCTATTCTTGGAAACAAATATATCTACAAATATTATTAATGCATGCTGCTATCGCTCT
CGGTGGGCTATTTCACACACAAGAGTGTTGCACTTGCACCGACAGTTACACGTGTGAACA
TCTCTTTTTAATGTTTCACAAATCTAAACACTCATGAAGTGAAGAACTCTTAACCATAGC
ATGGTACCTAGAGACATTTTCGCATAAATCCTCACTCAAGAGAAACCAATAACCAAATAC
TCATCCCGTGAGGATTTTCCAACCTTGACAAACAGAGTTACTGATCAAACCTGAATGTTT
TGTGACATCTGTAGAACTATGAGTTTTTTTAGGAGTAAAGACAACAGTTACTCAGGACAT
ACTGTTACATTCAATTCTCATCAGGTCGTGAAGGTCCCTCGGTGCATCAACAATCACCTC
CTAGTCACCATCTCTCCTAGCTAAGGGCGCCAGCTCGTGGGCAAACTTATTTCGGTCTAT
ACCTACAATACCAATCTGATTTTTCGACAAAGTATGGACTTTTTTGGCTCAAACGGGAGC
ATATCAAGAGGATACAAACACCATGAGCACACATCCAACCTCTTCATAGATAGAATGCAC
ACAACCAACACTAACACGCACAAAAAATGTTGATATCACTGATCTTATATGATGAGAAGC
CGACAAGAACCATCTTGGTGTCTCACATGAGAGGAAAGTAGGCCGGCAGAGCTATCTCCT
GAGTTTGTAACTCTTTTGCGACTACCGAACACTGTAGCTCCAGTATTATTTGTCTTCCTT
TATAGACACGAGCCAGCAAAGATAGGCCGATGATAAGAGCAGCGCATGCTTGCATGTAGA
AACACAGACATGGCCCAAATGGTTACGAGCTACAACGCTAATTGTTCTACTGGCAGTTTC
AGGAATAAAAGATGCATCAGAGTTTACCTTCACCAGTTCCATAATCGCTTCCCTAGTATG
CTCAGGAATTAGCATTACTCAAAAATTGGACGGAGCACCTTTGGAACAAGGTCAAAGCTT
GTTGAATGATTGTAGCTTCATCCATGAAGCTTAAAAACATCAAATTATCATTGGCAAAAA
TAATATTAAAGATACATGGACTATTTGAGGCAACTTAATGATGTCAATCTCCCAACCGAG
ACCTTTTGTTCCTAACAACGCCATCAACAATGAATAAAAAGAGGTACAAACTTAAGGCAT
CTCTTTGTCGCAACCCTCTAATAGTCTTAAAAATAGGTCACCATTGCACCTGATCGAGTA
TCTCACCGAGCGGACACTCCTGATAACCTAATCAACCCATCAAGGTTGAAACCAAATTTC
TGAATGCAGACCAAATTATCTCCAAAGCACCCTATCATTTCCTTACGCAAGGTCCAACTT
ATAAACAAAGTATGCACTAACGTAGATTTTATTATACTGAATCATATGAAAGTATTTGAA
AACAATAACCACGTTGGTGGACATAAATCTACCACAAATAAACTTTTAGTCCGGATATGA
GATCCTCAAGACTAGTAGGCATATAATTTTTCAGGCTCACAAACTTGGTACCTAAAAAAA
CTATCATTATATCATTGATTCCTTCAATTATAATTATATTCTCAAAAAATAATATAGTAT
ATAAAACAGCAAACAACCATTTTCAACATATCCATTTTATGTGGAAAATCTCAGCAGGGT
CCGGGTATTTTTAACAATTTGAAAAAAACATTCTTTATTAGTTTTTTAAGAAAGATATTA
TTAAAATTTACATTAATATCAATATTAAATTTAATAAAAAAATATTTAGTGAGCCCATTC
ATTATATTCCTTAAAGTGAAAAAACTATATGTTAAGTCAAGTATTTTGTTTACTAATTAC
TTAATATAAGAATTTTTATAACAAACTTTTATACTCCTTTATAAATTGTGTTTTTCTTAC
ACAATCTTATTTAAAATATTTATGTAGAGAACGATACTTATGATAATATTATTATACAAT
TTTATTTTTCATTATTATAAGACACTCACAATGCACGGGAGATATATTTAGCTGGAAAAG
TTACGCTTTTATAGTTGTTTTGATTGAGATGTCTCTAATAATATATACTTTAATAAGACA
AAATATAATTTATTTTCAGAAACTAAATTTACTGATGCACTATTGTATATTTATTTGTAT
TGTATCCATGTAGAGAGAGATATAAATGTACATGTCTACAAAGTATCTGGAGTTTAAGGC
ATATAAAGGTCTGCCTCACGTGTAAGTAAATAAATAATTCTGGATTGTCTCTAGAAGCAG
GCCCGGCCTCTGATCCAGGCAATAGTTTTTGTTTTTAAGAAAATGGCACGGGGCCTCCCA
TGCGCTGCTTGTTCCGCCCGACTGCCGAATAGGCCCACAGGCGGGTCGCCCCACTGGGCC
GGCCCAGTTTGATTTCTGGCTTAAGTAAATCTGATATTTTTCTTTTTTTTCTTTTCTGCT
TATTAACTTCCTTATTGCTTTTTTGGTTCCTGTTTTCTTTCCTTTTCCCTTTTATTTTAG
AATTTGAAGCAGAAAAATTTTGTGAAAATCAAGAATATTTTTTGAATTTATGGAAAATGT
TCAAAACGACAGTGTTTTGAAAGTTGAAACATTTTTTAGAAGAAAGAAGATTTTCTGAAA
TTTAAAAACAATTTTCAAACACGAACTTATTCTAAAATTGAATAATTCCGAAATTTCAAA
CAGTTTTTGAAAATACGAAACATTTTCTAAAAGAACATTGTTTTAAAAAAATCTCAATAT
TTTTGTAAGTTATAAATATTTTTTAAAAACAGCAAATATTTAAATTTAGAACATGTTATA
AAATTAAAAACATTTTTTGTACTTGAAGAAAAAAAATTAAAATCTAAAACATTTTATAGA
AAAAAATAAAAAGAAAAAAATAAACAGAAAAAAATAAATAAATAAGCAAACGATAGAAGA
AAAACCGAATCGGGGAACCTTTTAGAAGTTTTCAAAAACTAAAACAAAAAACGGTTGGGA
ATCGCTAGAAGGTTCCAAAAACCAGGATTAGTGAGACAAGCTAATGGGCCAGCCTATTTA
AATCGCTCTTCTCTCTCTCTACGTGTTTGTCAGATACTTTAACGCAACAAGCATCAAATA
GGATATTTCTAAAAAACTAGTGTTTTTTCAAACGGACGCATGAAGCGTTCTCACCCTGTG
CCGGCCAATCTATAATTTTTTTTCTTCTATGCTTTAATCCGCAAAAGTAAGGGTGTTGAT
CGTGATTCAAACCAGCAGAATCTGGCAAGATTGAATATTTTCCTTCGTTATTCTTTCTTT
TCCATTTTTCTTTTTTTGGTTTCCTTTTCTGTTTTCGGTTTCTTCTTATTTTTTCTTCCT
GGCTCGATGAATTGTTTGAGAATACGTGAACTTTTCTTTAGGTTGATGAAGTTTTTTCTG
AAATTGAATGATTTTTTTTTAAAATTTGATGAACGTTGCTACAAATCGACGAACTATTTT
ACAAATCTGTGAACTTTTTATAAAATTCGACAAACATTTTTCAAATTACATGAATTTGTT
TTCTAACTGGAGAACATTTTCAAATTTGATGAACTATTTTTCAGATTTGGTGAATTGTTT
TTAAAAAATTCATGAACTTCTGTTCAAAATCCATGAACAATTTTTATACCATGTGTCTAA
ATATCGAACTGTTTTCACCGTTGGGTTTCTCATGTCGAGATCTTCAAAATTAGATCCCAT
GTTGATAGTTTTTGATGAACTTTTTTTCATGAAAAAACCGAACGGAAAAACTGTACCTCT
CGCGATAGAAAAAAAACAGAAAATACATTTTTTTCGCTTCCAAGAGGCACAGTTGTGCCT
CTCGCGAAGGCAAAATTCTACCTCTTGTGTCAAGCCTCTCGCGAATAAAAAACACTTTTT
TTGTTTCCAAGAGGCAAGGTCGTGCCTGTCGCGAAAGCAAAACCGTGTCTCTTACGGAAG
CAAAACCAAGCCTCTTGCGATAAAAAACAACAACAGAAAACACACGCACGGCCGTGCCTC
TCGCGAATGCAAAAACGGACATCTGACGAAAGCAAAATCATGCCTCTCGTGATAGAAAAA
AAATCATATTTTTTTTTTGTTTTCGAGAGGCATGGGTCGCAGAAGCATAACTGTGTCTCT
CGTAAAAAAAACACAAAACACATATTTTTGGGAAAAACATTTTTTAGTTGTTTTTTCATC
CAAAAGGTTAATACCGATTAAAAACTGGAACACCGAAAAAGAACCGGAAAAAATCATTTT
AAAAGCCAAAAATGCGTGCGGAAAATTCAAAATAACAAAATCGAAAGGAAACACTCAAAA
CACGACACAAGGTGGCGGGTGAGAACGCTTCAAATGGCGACGCGCGTGAGTGATCGTTGA
AAGGCTCTCGAAGGGGTGCTCGACAACTAGTTGCTCTTTCGGTGGAACGATCGAACCTTG
CCTGTATGGGCTGGCCGACGGGCAATGGTGCGTGGGCGCCAAATTAGAGAACTGGCGCTT
GTCGCGCCAATTTGGAGCTCCCTCTCGCTCTCTTAAAAGAAAGAAGCTCCCTCTCGCAGT
TTGGGAGAGCGATACTAACTAGCTACAAGTAGACTCGTCGGGCCAGCCTACTTATTTTCA
CCTATGAAGCATGTCTAGTTGTTTTAAAAATAACATGTGGGATCTCTTATTGCTAATTTG
GTGTGGATTAAACAGGATTTACTATTTTCTCTAGCTTTTTCTGTTTTTTCATTTTATATG
TATTTCAGAATTCTTTGCAAACATATACTATTTGGTAAAAGTAATAAATAAAAGTATTCT
TGCATTAAAAATATTAGTCTTGCATTAATAAAATCATTGCTCATTTACAGAAATTGTTAT
TGCATACTAGAAAAATGTTTATCACAAGCCAAATTTTTATCATTAGATATTGAAAAGGGT
ATGGTCATGTATTATTGAAAAACAATTGTTATAAAAATGATTATGGTGTATTAAAAATAT
GTATTACATAATAAAAAATAATTTAATTTTAAATGCATTCTTTTATTTTAGAAATATTAA
TGTCAATAAAAATATTATTTTAATTTAAAATTGTTTGCACCCTTATAATAAATGTTTGTG
AGTTTGAAAAAAGTGTTTGCATAATTTTTCTTCGAAATTTCTATAGTTTTCAAACAAACA
ATATTTATGCAATTTTAAAAAATGTTCACGTACTTTTCAGAAAATGTTCACATTGTACAT
AAAAATGTTCCTGATCTCTTAGATAACTGTTCACATATCTAAACAGGGTGTAAATATATG
TTACAAAAATATACTGTATTCTTGCGAAGAGAATAAAATAAATTAAATAAAGTGAAAATT
GAGAATAGTGAGAATAGAAAGGACTGGAAAAAATACAAATATTACCAAAAATGGAAAATT
GTGAAAATATGTATAACTAAAAAACGGATCAGAAAAACAAAGAAAACTAGGCGAAACCTA
ATGCAAGAAAAACCCAAACATGGAAAGGTTGATCCCTAAAAAAATCCAAAAACAACAGTA
GGTGGAAACACCCAAACCAGGTGAAACCCGTCACAAATGTCGCTACTATATGAAAGGCCC
ATCCGAAACTTCGCTGAAGGCCGACGGTTGCTATACCTTGCCATAAGCTAATATTGCTCT
TATGATATATTTGTAGTTACATGTATAGCAATGATGCCGATATTCAATCCATGAGACATC
AACATATATGTTTCATGAATATTTATTTCCGAGTCGAGGCTCATATGCTCCTGATGAACC
ATACACTGGAAAACAAATACTTGAAAAAAAATTAAAACATCTGATTTTTATTTGGCATGG
AAGACACTCAAATGTGTGATGTTCATGCTAAATTTCATCATGTTTTGACATCTGAGGAGC
TCGTGGCAAAAAAGAACAAAATTATGCGTGAACAATAAACTTTCTCACGGACCCCAATTT
TCTTCTTTTTGATGAGAGATACTCAGATGTCAAAAAATCATCAAAATTGACATGGACATC
ACACAATCAAATATCTTCCATCTAAAAAAAAGAATAAAGATTCCTTTAAATTTCTTTAGT
AATTTTTTGAATTTACTATTCATCCAAGGGAGCAGATGAGCTCGGGTCAATGTGGAGGGA
TGTCCATGTTAGGAGTTGTGTGTGTTAAGCTGTCTTGTGTTAGTGTTTTGGGTCAATATG
GTAAGAATTGATTGCGTGAAAGAAGGTCTCTAGAGGTTTGATATCATGGACATGACATTA
GATCGAATTGTGCCATGTTTTAGTTGTATTCAGAGATTCAGAGCTGTGAAGGTTAAGAAT
CTGGCTCTCAAGGATGCCATGTTCATCTGATGGTGTTTGTTTTTCGGGATAAAAGTGCCA
GCGCGTGGTCTTCTCGCTTAATTACGCCTTATAATAAACATATATGCATGTAGGGGATGT
TTTGGCTCCCGGTAGCATTTATTCCCAGATGAACTTTTCATAAAAGAAAGTGTTAAACTG
TTTTTAGAAAAATCTGAATTTTTTGTGGATGTTTGGGTTAGAGTCGCAAGTTTGTTTGAC
AATATTCATGCAAAACAGAACGGTAGTGTTTCGTTGGTGAAAAAAATAAATTTCAGGTGA
CATCCTCGGAAAATGTTTGGTGTTTAAATCTTTTTTTCTTTTGTATAGGCCAAAATATTT
AAACTTTTTTTCTAAAACTTCACAGATAGCATAGGATGTGACTATAAATACATAAAAGTT
GGACACTGATAAGTGTCATACGTGTGACATGAACATATGACAATTCTGAACGTCTTTTAT
GACAAATTTAATGACAAGAGAACAACAACTTTTTGTCTGGATGACAAGTTTATGTCTTTT
TTATTTATTTATTTTTTGGTTGATAATTTTAGTTGTAAAAAACATCAGGATAAAATTGCT
TCGTGTCATACATGTGACACTTATTATTTGGATACATGTTTTGTTGGGATTTTTTTGGCA
TTTCCAAATTATTTTTCGCGCTTCTGGAGCCAAATTCGATTCCAACGCATACGATACCAG
CATTCATTCTGTTGATGAGTAAGCAACGGCATCAGATACTGGGTGATGTAGGTGCTTGAA
TGCTTGAGAAGGAAGAAGAAAGAGCCGGATGGTCATGGTGGAATCTCGGGCCGGCGAAAA
GGGGAGCAGCGAAAAGGTGGACGGTGGCGGTGGCAAAGCCAAGGCAGCAAAGTCGTTGAG
GCTGCTTCACGCTGCTCTTTGAATATTGAACTCAACCGAATGAATGGATCTTGCTGGCTC
GTGGGATCTGGACCGGACGGTGTTCTTTTTCTTTCTGTTTAATCTGATACAAGATTCTGT
TTTTGTGATGCAGAGTTGACACAGTGCACGTGGCCTGCTGCTCTGTCATCCCGGATGAAA
TCCTGGATGGCCTACTCCTTTGCTCCTCTGTCATCTCCTCTGATTGGACGACGACAAACT
CCGTCCCTGCATCCACCATGCTTAAGTCGAGAGCCTTCTCCTTCGGCTGCTCCTCCTCCT
GCTCCTCCTACTCCTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCCTTCGTCTTCGACGAGTACGGAG
GGAGACCCGTAGCGATGCGGGCGACGAAGCGAGCCTTGATCTCTTCCTCGTTTTGCAAGC
GCCACTCCCGGAGTGAGCTGCGCGTAGGTGGTGATGAGCCGTCTGACTATCCTGACGGAG
ATGGAAGTGCGAGATGAGCACCAGCTTGGGTGGCCACGGAGAAAGGGGAGGGGGCGAGCT
AGGGCTGGGGTCGCCGACCGTCTGAAATAGCTGATCCCGACCTCGGGCGGGGAGCCGAAG
CGGTGCCACGTGGTGTTCACATTGCACCGACGGTCGAGGTGCTCATCGGACCATCGGGTT
TTCCCGCGAGTCCGCATAGGGCCAAGCCATCAGGCTGACATGCCGGGCGTGCCCGGGCTC
CCCAATATTCGCCCCATATTTGGGCTGGAAATGAGGGGCGTCGGTCAGCCCGGGCGTTTG
AAGTCGGTTCGAGAAGCCTGTTCGGATCGCATTTTCGTGACCGGGCATTGACGGGGCGAC
CTGTCCGAGCGTTTGAGCAGGGCTTGAGGGATCCGGTTGTAAGAGCATCTACGACCGATA
CTTACAAATTTAGCCCCTCAAACGCCCGCGGACAAGCCCGAACACGTTCGTTGACACTGA
CTGATCACGTCTCAAATCTATTCATCCACACTCAACTCTCTCACATTTCATTCCTAGATC
CATACAAAAGCATGTAAAATGAATAGCACATCGTCGACGATGTCCTGAGCCGCGTGCGCC
GCCTCCTGCGCAGTCTGCGTCGCCTCCATCTGTTGCCAGCGGAGACGTCTTGCCTTCGGA
GCCGACTCCGAACGGATGGAATTCAGGACGATCAGCTGCTCCAGCCATAGATCCACGTCC
TCCATCGCCGGAGCCGACTCCGAACGGATGGAATTCAGGATGATCAGCTGCTCCAACCAC
AAATCCACGTCCTTCATCGTCACAGCCGACTCCGAACGGATGGAATTCAGGATGATCAGG
TGCTCCAGCCACAGATCCACGTCCTCCATCGCCGGAGCCGACTCCGAACGGATGGAATTC
AGGATGATCAGCTGC