Map Locations of contig_44036 (9181 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_44036

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59921 3 2449 bp MLOC_59921.1 Available Available LOC_Os12g07230.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13112.m00754 protein CAMK_CAMK_like.45 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed





CDS Structure of MLOC_59921






Contig Sequence (9181 bp)

>contig_44036 9181 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AACAAAAAATCCGACGAACTAGAGTTGCAACCAAACGTATATGCAACTTTTTTACTGAGA
CAAAATATTGTAAAAAACGCTTGCAGCAAAAATGACGCATGTTGCAACATATTTAAATGA
AAAATGTTGCATTCATTGACCGAAAAAACGCGCGGATGATAAAAATGTTGCAAGGGGCCG
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GAGAATAAGATAACCATCGCTATGCTCCCCCACATGCCCGAACAATTCATCCCCATGTGC
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GCTGACGGTTTTTCGTGTTTTTCTTATTCCTTGAAAGTCCCTCTTATCTTGGAGAATGGA
GCTCAAAGTGTATGACGCGTGGTAGCAATGTGCTTTCTGTAGGATGGACGTTTTTATGGT
TGGCTTCCATTGCAGATGGATATAATGCTTAATGACCAAGTTGACGTTCTCCTCCATTGA
TCTTCCTCCATCCATACTCAAAGGCTTCCAATTGGATGGGGTCTTTTAAAATCTTCCTAA
TGTTTTGTTTGTCTTGGCGCGATGTTTAGTATTTAGGTCGTGAAAGTTGAATACGGACAT
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CTGACTTATTGGACCGTGCCGACGAGCCGTACAAAATTAATGCCTTGAAATATTTTGTTT
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GTTTAGTTAGTCTTTTATGTTCGTTTTCCCCTGTTTTGTTTCATTTCTTATTTATTTTAT
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GGTTGATTGCGGGGAAGGTTCTGTTTCGTAACCTATTGCACATCCAAACGATTCAGAGTG
CTCTTCGCCCGGCCTGGGGGAATCCGCGGGGTCTGATATTTAGATCCTTGGGAGAGAACA
TGTTTGCAGCAGAATTCGAGTCCAAGAGGGATCGTGACCGGGTGTGGGAAGGATCTCCGT
GGCATATCAACAAACATGCAGTTATTCCACAGGATTTTGAGGAACACATGCAACCTTCGG
AATTGGTGTTCGACAGGTTTCCCGTCTGGGTTCGCGTCGTTAATCTCCCATATAATCTCC
GAAACAATAAGTGGGGGCTGGCGATTGCGCAGCAGATTGATAAGACAACGTCCGTGGTCC
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TCCGCCGATGGATCTTGATAGACTCGGCTAAGAGGAAGAGTACGGACAAATATGATATTG
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TCTGCCCTGCACCTGGTACCAAGGATGAGAAGGGAGAGCTGCCTTTCAAGCCTAGCCTGC
GGGCATCTGATGACCGAAGGAGGTCGAACTCTGGCGAGCACCAACCAAAAACTAGCTTCC
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ATGAGATCGTGGAGAGAGACACAAAGAAAAAGAGGCCTACTCCAACTTCGTCAGAATCTT
CGGCAGCGGCTGCGAGTCAGCCCTGCCAGGGCCAATGAGCTGCCTCAGCTGGAACTGCCG
G