Map Locations of contig_43912 (11712 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_43912

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59788 20 3399 bp MLOC_59788.6 Available Available LOC_Os02g17700.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13102.m01977 protein pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_59788






Contig Sequence (11712 bp)

>contig_43912 11712 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATAGCCATATTGTTTATTATCATATATCTTGCTATCACTTNNNTGTTTATCTTGCTTAGC
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GCCCAGGGAGAAGATCACCAGATGGAATGAGCTCCTGGAAGCTGCAAGGGAGGGTTAACT
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GAGGCTCTTAAGTACTGAACTGCACTAGACATGCAAGATGTCTCTATAACTTACCACCGT
TGTTCAAATCTGGAAGAAACAAACCAATATGTTCTTAGTAGCTACTCCCTGTTATCCCTG
TTAGGTTAGGTTGATCTCTTCCGTGTGGGCCCAACGGCCCACTGGACTCCTGATCCAGCC
GCCCTGACCGGGGACGCCCAATTTATTATGGTTGGTGGGCTCCTGTGATCCATGCTATAT
TAACAGAGATGGAGGCCGGGGCACGAGCCACGAGGTTGACCACCGCCACTTTTTCCACCT
ACACGCCCTATCGATCTAGGGTTATTGCGGTGCTCACGGGAAGCACCATCACCTCATCAT
CTCTCTCTTTGCCCCACCACCGTTGCCATGAATCGATGGCCACCGGCGGCAGTACGTCTC
GCCAGGGAAAAGGTAATCATCCCATCTCCAACCCTACTACCGGAATCTGCTAGCCGAGGC
GATCTAGTGGATCTAACACTCCCTCTATACCTAAAAAATACTTGTAGTCGGGGAGAACTG
GACTAGTCGGAAAACGTCCGTTAGCAGAGCACGGTATTGGATCTCTTTTCCCTCCAGTTA
CATGTTGCATCATCAGATCAAGCACTACTATCAAACATGCATTGCTACTTCAGTTCCAAG
ATGAAAATGGAACGGCTAGTAATTAATTAAGCCCACCTCCTTCAACCCAAGCTGCACGTC
GAGCTTTCGGAGCGTCCTGACATCCGCGACGCCGAGGGCCCGCGATCAACCAGTTCGTCG
TCCGTTGCGATGTACCTCGAGGGCCTCGAGCGCTCGTCCAGCCAATCTTCACGCCGACGT
TTCGTTTCAACCACATAATTGTTCAACCATCATACGATAGGCAGACCACGCACAAAATTT
GCAGATTTTTCATACTACATCCATGACCAGTAATCATCCATGGCTCGCAGGCAAATAGGA
ATTTGTAAGATCTCAGCAGCATGCATCACACGGCAGGAAAACCTGGTTCACTAGCTCCAT
GTTTTATCGAGCATTAGGAACCGTTCGGTTTCTCTCGGCTCCCTCGACTCCGTTCCTGGA
GCGGGGCAGGGTACCACTCATTTCAATGGAGTGGTTCACACCCAGCTCCACAGCTCCGGG
AGTGGAGGGAAAACGAACGGGCCTTAATCGTGTCAATTAATTCAGGTACAAGTTGTGCTA
GACGCAATAAGTCTCATTAACTCTAGCCTGGGGATCTAGTTACTGCTCCAAATTTATGCG
GAAGAACCATCTCCTATGCGTTTGACCAGTCCATGTTTCATAATATCCCTTCCTTGGCCT
TCAAAAAATATATATTAAAGACCTTAATATCCCTCCTTCGAGAAATCATCTTCAGACCTG
AGATGGGTGATTTCCAAGATTGGCATCAAGTATAGAGCAAGAGAGAAAGTACACGATTTC
AAAATACGAGCACTGAGAGTGTTAGACTACCCACAATGAAAGTAACATAGATGCCACCTA
AGCAAGAAATATGATGTGACACCTAATTAATAAGAAGGGAGAGAAATTGAGTAACTTAGA
TGCAAGGCAAGATGACTCTATAAGCTAATAAATGCAAGGCTCAATGTTACCACCCCTATG
TTACGGATTTTTTCACTGTTTTGATCCTAGGGGTGCAAGTTAATCACGCAACGAACTCGT
TTGGAAAGAATTTCATGTTTTGACCCTTTTTTGAAACGCCATAGTCCGTGGCGTTGCAGC
CCTGTTATGAAACGCCATCTATTGTGGCGTTCAGACGTTCGCTGAAACGCTTGTGTAATG
TGGAGTTGCAGACCTGAGGTGAAACGTCTGTCTAATGTGGCGTTGCACACCTGAGGTGAA
ACGCCAATAGCTATGGCGTTTCTTGCCTTTATATTTTGTCACCCCGACCCCCTCGCCCAC
CAACNNNNNNNNCTCCTCTCCTCTTGTTCTTGTTAGCCCAAAAAAGCTCTCCCTTGTCCT
CAAGATCCCCCC