| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_439078
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
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| MLOC_59783 |
2 |
1241 bp |
AK373752 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_59783
Contig Sequence (2899 bp)
>contig_439078 2899 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGGAAGTGGAGTGCGGGTTGGGAGGAGTTTCTCCTCCCAACCCTCACTTCTACAGGTTC
AAAACAAGTTTGAGGGTTGGACCTCTAAATTATTTTACGGATTTGAGGGTTTAGGGGTCT
ATCTTTTTTTCCGACAAAAACTGTAAAAAAACGGTTATTTTTATGGGTTTGAGGATTTGA
GGGCTCTACTAGACTTGCTCTTAGCTATGAACTGAAGAACGTATTTTTTTTCAATTATTA
CTCCAGTGCACCTTTCAGTTACCTTTGATAGTAAAATTACATATTTTTTTGGCATAATTG
ATTCTCCTTTCGTCTTTTAACAATTTTGTATACTTCATTATGGCTACTGATGAGTGAACC
TGCACTTGCAAAAGGGATATGGACTGACCGAGACTACAGCTGGTTTTTGCCGTTCCATTG
GAGTAGAAGAAAGTCGACGAATCGGGTCAGTTGGGCGTCTTTCGCCGGGTGCTGAGGCGA
AGATTATTGATCCTGGAACAGGGGATGCTCTGCCTCCCGGTGTGCCAGGCGAGCTCTGGG
TCCGAGGACCTTTTGTAATGGAAGGTACAGCCATACGAACATGTTTTAGCTGAAACATAA
CGACCGCCATTACCATGTTTTTTTGTAAAAAGGATGTTACGCCATTACCATGTACAGTAC
TACTCCCTCCGTTCCTAAATATAGGACCTTTTAGAGATTATACAATATGGACTACATACA
AAGCTAAATAAATGAATATACACTCTAAAATATGTNNNNATACATCCGTATGTAATCCAT
AGTGAAATCTCTAAAAAGTCTTANNTTTAGGAACGGAGGGAGTAGAAAGCATGGGTAGCA
ATATATCTGGTTCATATCAGCAATCATGCTACCTTGCTGCAATTTTGTTTTGGTAGCTGT
GCGCTGTGCGGTATATACCGGCATGCATTTGCGTGGTGAATTGTTGATTTATTGTGGGTG
AGGGCACATACTTCTTTGTGGTTCATTTGTTGGCTTGGTGAAAGCATGATATGCCAGGCA
GACAAAGAAGGCAAACATTGAACCGGTGTAAATCATTGATGACTGCCCTTGGAGCTACAT
AGAATCGCTAGCCGTACCTTCTGTTCTGTGTATATAATTTAAGGAACGCAGCAGACATTA
ACAAGTGAAGGCAATTTGCATTTTACTACATGATAAACAAGCAAGTCAACATCGCATCCT
AACCTGTTAGTCTTGATGGACATTGCTTTCTGCCAGGTCAGCATCATCTTTTGTCGCAGC
ATTCAGCAGATTTGTCAGATGTTAGGTTTCTGTTGCTATCGCATAATAGTGGATATAAAA
TTTCACTGAAAAACACTCAATCTATTGTTAAACATTGGTACAGGTTACCGTGGTGACAAG
GAATCCACCTCCGAGATTTTGGATTCTGAAGGGTGGTTGAGAACGGGGGATGTTTGTCTT
ATCGACAAAGATGGATTCCTCTTTGTGGTTGATCGGCTGAAAGAGATAATTAAGTACAAT
GGCTACCAGGTAGTACCTATCAGCATTTCAAAATTGCTGATAACCACTTCAGGATCTGGA
ATGGACCGTGTACCCCTAATGTAAACTCTACCTTTGTCTACTGCAGGTTGCTCCTGCAGA
ACTGGAGGACCTGCTTCAAACGCACCCCGGTATCGACGAAGCCGCAGTTGTTGGGTAAGT
ATGCACCACAACATGTAGCAAAAGTGTTGCACATCTTCCTTGCATATCAACCATCATAAC
TAGCACATGTTAACTGTTTCTCATACAGATACGCAGATGATCAGGCTGGTGAGTTGCCGG
TAGCATTCGTCGTACAGCACTCCGGAAGCAAAGTGCATGAGGCCCAGATCAAAGACTTCG
TCGCTAAACAGGTAGGAACTAGGTTGACACAGCTACTTCACTCTTTATAATGTGTAGCCA
TAGTTGAGCCTAATGGCTGTCGTGTATCGCAGGTCGTGCACTATAAGCGAATACACCGTG
TTTTCCTTGTGGATTCCATACCGAAAAATGCCGCGGGCAAGATCTTGCGCAAGGACTTGG
CTAAGTTAGCATTGCATCGGATTAACGCCAAATTATAACATGTTTGGCAGGTAGAAGAAA
ATAGCTACAGCATGCTTTTCTGTATGTAGGGAACATTAAAGTCAATCTTGCTTGCTTGAT
AAATAGATCAGGAATAGTTCCGATATCTCCCGGTTGTGTATAATGGTAGGAGTGTGAATA
AACTGATGAGACGGCAGGATGAAATATCAGATATTGTTGCCTGTTAAACCCCGTTGCTTG
CATCAAAGGAAAATAAGACCGCAGCCAAAAAAGCTGCCATGGCAGCCCTTTTTCGGTTAG
TGTTTTCTTTGAAGTAAATAGCATAAAGCTACCAAATTACAGGCTAAGTCTACGAAAAGC
TACATGTTTTTTAATTAAAAAAAACCCAAATTACCGAACTGTTAACTTTTAAGTGGGTTT
ATGACAAAGAGGGCTCGCAAGTCAAATCGCCGTTATATTGGGCTGTTAGTTGATCATTAT
GACATTGTGAGCCCATATGTTGGTCCCTAAAAAAAGGCAATCGGGTCCCTATAAGTTTTT
TTCAAAAAGCAACCGGATCCCTCGTCCCTCTACTCCCCGACCCCCCTGCCGTTGCTGCGG
GCCGTTGTTCCCTGTCGCAGTCGTCGCTCCTCCCTGTCGCTGATGGCCGCCACCGCAGCT
GCTTCCCGCCGCAGCCGTCGCTGCTCCCCTCTGATGTTGCGGGTTGCCGACTTATTGGGG
ATATTACCTGCGGTATAACCCGCCCTAGCTAGACCGGGTCACTAAAGGGGCGACTCATTC
ATTGGTAATGCAGGCCTTGGCCCAGGAGCCGGATGACGGTTCAGGAGCTATACAGAGGAT
AGACCGCCAAGGAGGCTTC
