Map Locations of contig_43844 (8968 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_43844

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59709 4 3463 bp MLOC_59709.1 Available Available LOC_Os01g03070.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13101.m00256 protein transposon protein, putative, unclassified, expressed





CDS Structure of MLOC_59709






Contig Sequence (8968 bp)

>contig_43844 8968 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TACCGCGGAATACGTCTGCAGGCACTGTATTTGAACCACGGGACAAGTTGCGGCACCACT
TCTGTGTATTTTGCAAGTTTAGGCACTAAACTGACCGCATAGGACAAGTTTAGGCACTCA
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TCATTTTTATCTATTATATTATAGATGAGAAATAGGTGCAGCATGACATGAGTGGGCTTT
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CAATTTCATCACAAGTATTTGGAATTTAACCTGCTTGTCATCACTTGTTTTCCATTTCCA
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TATTTGACTTATTTCTCTTTGCAGGACATAGAATCTGATGCACTTGGTAGTCACCTCTGC
GTCTTCACTGATTCTCTAAACAAAGCAAGGAGTCTCATCCATCCACCTGTGCATAAACCA
TCCAAACTCACTGAAAACTTCAGTCTCGCTGGAGTGGTGGAGAAAGAACATAAAAGGCTT
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GTGGATTTACCCAGATGGAATGTTGAGTATAGTTGCTGCAGTGATTATACTTTCTACCCT
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TGTCAACCGATAAGCTTTTTTCAGTATTTATCTGTTTTCTTGTCAGAAGACTACCTTCCT
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TATTGTTGTCGCGTCATTGATTTGCAGAGGAAGAAAGGAAGAAGACAGAGGCAGCGGAGC
TTAAAGCCTATCTGGATGCAGTTGCAGCCAAGCAGAGAGAGAAGGAAAGGGAGGTGGAAG
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GTCCGCGCCAAGAGGCTCCACTTGCACGGGATGTGCGCCCCCTCCGCCAGGAGGCACGCC
AAGAGGCTCCACTTGCACGGGATGTGCGGCCCCTTCGCCAGGAGGCACGCCAAGAGGCAG
TCCCGGCTGTTCTGCCTGAAGCAGACCGCTGGAGCCGCAATGCTGTGCGTCCCCTCCGCC
AAGAAGCTCCTCCCGCACGCCAAGAAGCGCCCCCTGCCCGCCAGCCGGATGGTGCTCCTC
CAGCTGGTGGTACTACTGACCGCTGGCGTCCTGGTGGTGGATCTAGGCCCTCTGCAAATT
CTTCATCGGCTTCTTCGTCCACAGGCTGGAGGAAGAACTGAAGCTGCCCGCCCTGAAATG
CATGCCTGTGCCCTGCCAGCAGGTTAAGATTTTTGCAGTTACTTGAATTTGTCTGTCTCG
CATCAAATTTTGTTCCTAAGCGTGGACTCTTCTTCTAGGCTCCCTTCCATTGCACACCTT
TGCACCGTTTCAAAGTCGGTGTTAATTTTGATCTTTTGAGACATCATACTCCATCCATAA
CGTGTTGCTGTTTGTTACTTTTAACGAGAATTCAGCTTAGACCTGTTTTCAATATACTGC
GATTGGTGATGATGGAATTGGTTATGTTTTACATGGAAACATGATTATAAATTGTATTAC
CTCTGTCCCGAATACGGATGTATCTGACTGGAGATGATGCACACAAAATCATTACAATAT
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GCTGAGCATTGCTTAGTTAGGTTCCCTTTTGATAATAAATATGAGAATGGGCTAGTTCTT
TTGGCTGGCTTAAAAGAATAAGCTGTCCCTTCTTAGCTTGAAAAATAAGCCGCCTTCTAA
ATTAGTTGAGGCTTTTAACTTAGTTATTTCAAAACTAGTTTAGAAGTTCTAATGAATAAA
AGATGCGGCTGGCTTATGGGAGAAGGTATGTAGGGAGTGGCTTATTTTTTTTAAGCTGCC
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AAAAAAAGAAGGGAATTCAACGTCCATT