Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_438378 (6294 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_438378

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59703 1 3292 bp MLOC_59703.1 Available Available LOC_Os07g27180.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13107.m02706 protein tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_59703






Contig Sequence (6294 bp)

>contig_438378 6294 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCTCCTGTCCTGACGTGGGATGGGGAAGGCGTACCTGGCCGGCTCGACGATGNNNNNNNN
NNNNNNNNGCTCAGGCACGGGTGCTCCAATCATGTCGATGAAGATGTTGATCTTGTCGAA
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GGAAAGAGTATGGTGAACTTTTGATAAGTTGTGGTTTACTTGGTGAAGCACTTAATGTTT
TCAAAGAACTCGAATTGTGGGATAATCTAATCTATTGCTATCGATTATCGGGTAAAGTTG
CTGATGCGGTCAGTTTAATAAATACCCGGCTCTCTGTTACACCAAATGACCCAAGGTTAT
GGTGTTCACTTGGTGATGCTACAAATAATGATGATCATTATAAGAAAGCACTGGAAGTCT
CAGATAACAAGTCTGCTCGAGCTCTGCGCTCTCTGGCTCGCAGTGCATACAACAGGAATG
ACTTCCATACATCCAAAATTCTTTGGGGATCAGCATTGGCACTGAATTCTTTGTATCCAG
ATGGCTGGTTTGCCTATGGTACAGCTGCATGGAAGGATAAAGATCTTGAGAAGGCAGTGG
ATGCTTTTAGTCGTGCTGTGCAGATAGATCCTGAAAACGGAGAAGCATGGAACAACATAG
CCTGTCTGCACATGATTAGAGGAAAGAGCCAGGCAGCAGTCCAGGCATTCAAGGAAGCTG
TAAAGTTCAAGAGGAATAGCTGGGAAGTTTGGGAAAATTACAGTAAGGTTGCTTTGGACA
CATGCAACATGCGACTGACACTTGAAGCTGTCAAAATGGTATTGAATCTGTCCTCGAACA
AGCGCTTCAATGTTGATCTATTGGACAAGGTGATGGTCTCTGTCGAAGAACAAGCTAGAC
ATCTTAGTGATACTCAAGAAGCTAAATCCATAAGCAACGCTTCAGATGATGCAAATAAAG
AGACCAGGCTACCAAATCAATTGCTAGGTGTAATTGGTGATATCCTTCAGCAGATTGTAC
GGAGTGGGGCTAGCAATGCAGAGATATGGGGATTATATGCAAGATGGCATAAAAGCAAGG
GCAACCTCATGGCATGCTCTGAAGCTTTGTTGAAGCAAGTTCGATCCCTCCAGGGTTCAG
GATTATGGCATGATCAGAAGAAGTTCACGAAGTATGCTCAAGCTTCTCTGCAACTTTGCA
AGGTCTATATCGAAATTTCCTCCACGACTGGAAGCAGACGAGAATTATTGTCAGCTGAGA
TGCATCTTAAAAGCTCCTTAAAACAGGCAACGGACTTCTCAGGTACGGAGGAGTATAAAT
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ACAAGCATCGTCAAGTCGCATCATCCGATGGTCTATACTCAAGTTCGGCACGAAGAGTAC
ACCAGACCCTTTATTTACTCTTGTTCTGTTATTCATGTTGGTCGTTTGCTGAATGTTTCA
GCACACAATCCAGCTCGTAGCTGTGAGCACTCTGTTAATCAGGTTTATCATGTGTAATCC
CAGACTGTATTTGGGAAAGTATTTGTACTATTGCCTCTGTTTGAATGAAAGTGTTGTCGT
GCTCTCAATAAAAGAATACACCAGCATATATAACTAAGAAAGTAGGCCTGTAAGGATTCA
ATTTTTCTGGATTTTTGACTTTTTTTATGATTGTGCTCCTTTTTTTACCTGGCTGGGTGT
TTTGCATGTTACGTTTTGATGTGGCGGTCGCCGCTTTACCTGGTTTTGGCATGAATACAA
TGATGTTCTGCAGTACCAATTTATTTCTGAGATACATATACCATTCTAAGAAGGATTGTT
ACTGTCGTCATTTGATTTTCACTACAAATATCAATATAACTGGTGATTTTGACTCTTGCA
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GCCGTCGTCGTGATGGTTCGACCTCGTACGACTCCCACTTCCTCCTGCTAGTGGTTTCAC
CGATTTTTTCCATCCCTTCGTAAACCAATCGATAAACCAGCCGATTAAGATAAA