Map Locations of contig_43750 (9022 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_43750

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59600 1 1061 bp MLOC_59600.1 Available Available LOC_Os09g32230.1, FRAME:-1, EVALUE:2e-107, 13109.m03201 protein vignain precursor, putative, expressed
MLOC_59599 3 1150 bp AK372467 Available Available None





CDS Structure of MLOC_59600






CDS Structure of MLOC_59599






Contig Sequence (9022 bp)

>contig_43750 9022 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGCTTAGGGCTTTCGGGCTTTCTGTGTTGGGAGGGCCTGGGCCTGAGAAACGTAGTATT
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CGCGTCGACGGCCACCGACACGGGCTGCTTGGCGGCGGCCCGCAGCAGGTCCGGCTCGCT
GTTGGCCGTCACGTTCTGGTAGCCGGCGATGCTCACCGTGGTCTCGTTGAGCTTGGCCGT
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GTCCATGACGAACTCGTAGGCCCAGCTCATGAACCCGCCGGCGCACCCCACCGCCTCCGC
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CTTCACTGCCACCACCGCCCCTTTCTTCCTCCAGTCCACCTCCTTGGGCACAGTGCTGTT
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AGCGTGTAGCTATGGCCGCCGGAGTTGAACTCCTCGATGAGCTCGACGTTCTTCCTGTAC
ACCTCGAGCCTCCTCTGCTTCTCGCCGGCGTCGGTGTAGGCACGGCCGTGCTTGCCCATC
CACCGCTCGAACCTCCTCACCATCGGATCATCGTCGGCGACGGCGAGAGCAGCCCTCCTG
ACCATCGGATCATCGTCGGCGACGGAGAGAGCAGCCCTCCTGACCATCGGATCATCTTCG
GCGACGACGAGAGCAGCCCTTCTCGCCATCGGATCATCGTCGGCGACGGCGAGAGCAGCC
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TCATCGGCAATGGCGAGGGCGGCGCAGGCCGAGACAAGCAGCAGGAGAAGCAGGGAGGGC
CTGGCCATTGCTGCAGCTCTTGACCTTCGAGAGAACTGAGGTAGGAGTATGCATGAGCAG
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AAGAGCATCACATCATCTTCAGATTCAGTAAACTGCATGCGTCGAGCAATAGTAACTCTC
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TCCCATATGTCAGAAGGCTAACAATAACAAACAGGGCAGAGGCTAGAATGCATAAGTTTT
TAATGTTCAATCGAGCAACAAGAAACAGTATCAAGGAAAAACACAGCTCTTCGAAACAGG
TAACCCACGTAATGCGCATAAACAAACATTGGCAATGGGGTTCTGCTTCTGACCGTGCAT
ATAGCAGCTTGTTGCATCTAGAGTTCGAGACCATCACGTCGGCTCGAGATCATGGCATCG
GCGGCAAGGCTCCACGACATTTAGCTTGACTCCGTCCGGAGGGAACCTTTGGCTCAACAT
GTGTCCTGATCCCCCTTACGAGCTTCCGCCAAAAAATCCAAGTGCAACAGCAAGCACTTG
CACTTGCCAGTACTGTTGGATGAGCAGCTGCCCCAAGGATGCCCTCGTGTGACGTCCAAT
GTAAGGCATTCGAGCGACGTCGCATTCTCAATGATATGGCATGTCAGCTCAACCAAGCTC
TTCGCGCATGAGAAGCCGATGATCTTCAATGTCTTAAGGTTATCATGGCGGTGTCCTGGT
ACCTGCCTCAAATTCGAATTGTCTCCCACGATTGACTCATGGATGTTCCTTCACATGATT
TTTTGTCACAATGCATCTATTCTTGGATTAGTTTCTAACATAACTTCTAGGTAAACCCCT
TATCCTGTGGTATTGTGCTTTCTAATCTCCTAGGACAATACTTTTAGCTTGCTTTCTTGC
CATGTAGGCCATATGTATCGATACTTCTATTCCATGCTTTTGCTGCAAATTTGAAATTAT
AGTCTGGACATGTGTGTTAGGGTGTGTCCTCAACTATTGCTCACATTCATGTGTCAACCA
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TTGACAAGTGGAGGATTAGGACTAGATATAGGTGTATTTGTGAGAGCATGGGGGGGGGGG
GGGGGGGGAGGCGCCCCCGACGGGGGTGCCCCCGCGGGGGGTGGCCCAGCCGCCTCCCCC
GCGCTGTCCACAGCCACTAACCGCAGGGCCCCGCACGTCAGTTTCAAACCTGACGACGCA
CGCGCCTTGGCATGCTGTCGGG