Map Locations of contig_43520 (8661 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_43520

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59370 6 3836 bp MLOC_59370.2 Available Available LOC_Os03g52840.1, FRAME:-3, EVALUE:0.0, 13103.m05763 protein serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial precursor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_59370






Contig Sequence (8661 bp)

>contig_43520 8661 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGCAGCGTGGTGTGCGCGCGGGCGCGCGGTGGCGCGCCGAGCCCGCACAAAAAACCCCC
CCCCCCCCCCCTGCGCGCACTGCTGAAACTAGGTGGAAAGAATATGACGCGGGCGGTGGA
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AAAAAGAAAAAAGAAAAAAAACAGAAACCAACAAGAGTGGACATAAGTTACTGCAAGGAT
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GGATCATGGAAAGGAGCTTCCAAAATATCGATATGTACAGGGAATGACTATTTACATTTT
ACAGCTTTACCAATTTTGAATCCCCGTGGGTGAGCGCACCGCGTGTCCATGCAAATCGTG
CATGCTTGAGGTATTTTCGATCATACCATGCCAAGCTTCAGCATTCCACAATGTATGTGA
ATGGCAATGTAACATTGTAGATACAGAGGCCAACAGTACCAACGTGGTGCACCTCCTCTG
CTCGGAGAGCCATCCGTAGCCGTCCATGCCACACGCTGCGGAGAAGTCGAGCCGCACTGT
CTTATAAATGAAACCTGTAGATCTGGATCAAATGGAAGCAGCCATATTTAAAAAATGCTT
AAACAGATGGCCATAGCCTTGGTTCAGAAACAGTGAAATAGTAGGTGCGGGGCCAAACCT
TTAACTTGGCTCGACGTCATTCATAGCAACCATACAATTGCTTGACATGCTATCCTGCTT
TTGCCATGGAATGTCTTTTGCCTGAAACTCTGAAAAAGGGTAACATAATTTGGGTAAATC
ACCTGTATTTTAGAGCTAGTTCTAAAAAACAAGTGTCAAGATTGAAAATGAGCATGAAAG
GGAATTTCAAGAGGTGAAAGCATAATAAGGAGAATGTTTCAGTTGCAAGTCAAGCATTAT
CATGTACTCCCTCCGTTCCATAATTCTTGTCGTGGTTGTCATGGTTAAACCACGACAAGA
ATTATGGAACAGAGGGAGTAACAAATTTTAAAATGTAACTACGTAAAACACATATGTCCC
TTGCAAAAGAAAGTAGTAAAACTGATTGGTACAACCAAAACTATAGCCAGGCAAAACTAT
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ATAGTACTCCCTCCGTAAACTAATNNNNNNNCGTTTAGATCACTACTTTAGTTATCTCTA
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