Map Locations of contig_43458 (10821 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_43458

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59307 4 2786 bp MLOC_59307.1 Available Available LOC_Os02g14120.1, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13102.m01574 protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_59307






Contig Sequence (10821 bp)

>contig_43458 10821 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCTGGCTTGTAATATGAAGCATGTATGTTTTTATTGGTGTCTAGAGTTGTGTTGTGATA
TCTTCTCATGAGTCCTTGAGCTTGGTCGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGCGTATGATC
AAATCGAGGGTGTCACACATGTCCTCTAAACTATTATCACGTACGATTCATGTATCCTTT
AATGCTAGCCCTCCAACTACTATTAACACATTATTTGGGATGTGGCATAAGGAGTGGAGA
CAAGTATTGTAAAACATATTCAAGTAGGAGTATGTGCATTACTTTGGGTTATATGAAACT
ATAGAAATGACATAATTTTTAACAAAGAAACTCTGACAAAAAATTTCCCCGTTATTTACA
AAGCCACTACTTGGATATGTACATGGTCGTTACTCACTCATACGAAAGCCAAAGAGCATT
TGGCTATTTGATGTAACCGGTGGGAGATAGCAGCACGAGATAGTTACAACCGGTTTGAAT
GACGGTCCAATAATAGGCTAGGTGTTTAGTCATCTTGTTCTATTTTCGCCGATTATGACA
ATTTTATTTATCATTTCACCATGACTCTTTTGAAAGCGGCTACTGTATGACAAACCTTTT
ATGAGATCTTTTTCTTAATAATATGACTCCATGAATCATTGAGATGCAAAGGCCGGACCC
GGGAGTGATCCTACTTTTCTAAAAAAAACACTGATTCTCTCATAAGCTCACATTTGTTAC
ACGTGTGCCCAAAATCTAGTGTTGTGGTGTGATTTGCCCCCGATGTGGTACCAATCGGTT
ACCCTAGCACTAAATGTGATGTTTTATGTAAGGCGAGTGCTAGGCGCTGGCTCGTCGGCT
CAAATTTGGGTCGGTTGATCCCCATCCATCTGATCTGGTGGACCGAAACCGTCGAATGCC
TTCGTCTTCCTCACACGCAAAGTTTCTCTTGCATCTCGCCGGTCACACAGACTGATGGTT
GTCCCTTGCCAGCCGTCCTCATCGCCTATCACTGCCCCCACTGACCTTCCTCGTCGCCGT
TCGCCGCCCTCATTGGTCGCCCTCGTCGCCGCTCGCTCACCCAGCCTATGTTTGTAGCAA
AAAACGAAGCCGGTAGTAGCAAATAAAAGAGTCGGTTGTAGTAAAAAACAAGTTGTCGTG
CACGGTCACCATGCTCGCCATCCTTTGTTTGTACCAAAAAAGAAGCTAATTGTAGCAAAC
AACGGAGCAAGTTGTAGCTTTTCGTTGTCGTTTATGACTTCCGTTGTCTATGGTTGAAAC
TTTCTTGGCCGGTGGTTGAAGCTTGTCTCGTAGCCGGTTGCAGCTTTCGGGTTTGCACAA
TGCCCCATCTCGAAAAATCAGTATTATGGTTGATTCTTGTTCATTGCAGCTTTCTTATGA
ACGATTGTAGCTTTCCAATTGCACAATTTTGGTTTAAGCTTTCGAACCAAATAGTGAAAG
CTTTCGTATGAACGGCTCTGGCGACAGCATCACCCGTTGTCGCCGCCATGGCTGGTAGTG
CGCCATTGATGGGCACCAGCGACACGCGTGGCCCTCTTGCTGCCCCCTTGCCTCGCAACT
TCTCCACCCTCGTCGTCTTCTCCGCCCTCGCCGTGGCTCGCCGCAACGGCAAAAAAGGTG
AGTTGTGCGCGACGACGGAGATGGGGGGAGGAACGGTTTCTCCGTGTCATGGGGGAGAAG
AAGATGATGCAAAAAAATGATTTAAAGGAGGAGTGCATCATTAGGGACAAGAAGATGATG
AAAAAAAAACGATTCAAAAGAGGAGTGATCACGTGGCTTGTGTGACGCAAAGTTAGGGAT
GTAGGCGGGCATCCCGCATAAGCCCGCATAACATAATATTAATTTAAATTAAAGTAAATC
TAGTAGAAAAATTATAACTAACCTAAGATATTTTAACTTGAAAGCAGGGCCGATCGGGTG
CCGCTCTAAATTCCCACGCAAGGCACACGACCTTCCGGCGCTAACGGCTCTCCAGTTGTA
AACATTTCCGTCTTGTAATTACCTCTATCCAACCCTAGTGGATGCATTTTGTGGTGGAAT
ATATATTTGCAGTGGAAACTTATGACCTTCCTAGTTTCTTAGAAAACTCCTCCCAAGTTG
GATTAAATCCAGTCTATACATGTTTTGTACAACTATCATCACTTTTCTCTGTTTTCTCTC
GTGAAACCAGCATTTCCCATCATCTAGGACCAGATAGCTCAATTGGCTCTATTATGAAGG
ACGATGAGTCGTGAGGATCCTCGTGTCTCACAGAGAAACTGCAAGAGCCTCCGTAAGGCA
GCGCTTCTCTATTCAAGTCTACACCATTCTCTGCCAGAGTCACATTAGATTCAAGGGCCT
GGAGAACTTCTGACATCTTGGGCCGCAGAATAGGATTGGTCAGCGTGCATTGGAGAATCA
CGTCGACAGCGCACTCTAGCTCGGCTACATCGAACGAATCTTTGAGATCCCTGTCAACTA
GTTTGTCCAGTTTCTTTTCCTCGTTGAGTTCTCTAACCTGCAGAGGATTAAAAAAATTGA
CATTAGGTGATAGACAGTATTCCTAGCATTATACTAAACGAATGTGTTATCCACAAAAAT
CCGATGTGCCCCTGCTTATGCCAGGAAATCAACTAGGCCTTTGCTAAGCATTGTATTAAG
GATATACGATAAACTTATTTTATCACCAACAACAAATCTATGATAATACGGGGAGAAAAG
TTACAGTATTTGATTTGGATCTTCCCTATTTATGTTAGCTAAACTTTGTTAGAAATGGCC
ATCATATTACTCCAGGTTATGCCATCAATTATAGTAGCATGTAAAGATTTGAGCAAAAGA
AGTTACCCAATCTATAATCATGCCCTTCTGGGACTGACCATGTCCGTTGCTCAAGGTTTT
AGGTCCAGTTATTAGTTCCAACAGTAGAATACCAAACCCATAAACGTCAGTCTTTTCTGA
AGACTGCCCCGTTGAGAGATACTCTGGAGCAATATGACCAACAGTGCCCCGAACTGCAGT
AGTAACATGTGAATCTTGTCGATCAAGTAGTTTTGCCAATCCAAAATCCCCAACGACTGC
TTCAAAACTTCCATCAAGCAATATGTTTGCTGCTTTGACGTCCCTGTGAATGATCTTAGG
ATTGCATTGTTCATGAAGATATAGTAGTCCTCTTGCAGCCCCAATAGCAATCTGCATACG
TTTACTCCAATCAAGGCAAGGTTTTCCATGATGATACTCTGCAAAAAAAGTCATTTTACA
TTAGAAAGAGAAGGAGGTAGAAAACAAGGGAATAATAGAATAGCAAAACACAGGGCAAAG
AGAGCAATTCTTAGTAAGGAAAACACAGACTTCTATCAGACACATAAAATGGTGTGGACA
TATGAAACGTTACCTCTCAAGCGGTCAGCAACACTGCCATTTGGCATATATGGATATACG
AGCAACCGTTCTTTCGAGGTCATGCAAAACCCATACAAGCGCAAAAGGTTCCTGTGCACA
GCTAGGCCAATCAACTCAAGTTCTGTCTGGAATTGGACTTCACCAGTAACATCGGGATCT
TTTAACCTCTTGACTGCCACTAAAGTTCCATTTCTGAGACAGCCTTTATAAACAACACCA
AAACCGCCTTGACCTAATATATTCTTTGAGTTAAAATTGTCTGTTGCACTTTGCAGGCCG
TGAAATGAAAAATGCTTCAGATGACCCAGTTCCATTTCAAGATCTTGATCTATAGTTCAA
CAAATAAGTGGTCATACAATCATATATTTCCGATAGTATGGTCATAGATGATTAGCTAAT
TACCAGAAGAAGCAAAAGGCAAACGCCATCTGCAGTAGTTTAGCCAGCACACGAAGAACA
GGACAAAGATTGTGGCACAGGTGACACTTAAGGAAATTGCCAATGCCAATTGATGATGGT
TCTTCGTTTTATTTGACGGTCTAGACACGGTATCTGCAGTCACAGGTAAGTTAGTTCCAC
TCCCGAAAAGGTAAGTTAGTTCCAAAGGGTACACTCGTAGTAAAGATAAAAAACAGATGA
TGTCAGGTAAAAAAGTTACCGTTAGTTCCTCCATTAAGATGTGTGCAGCCATGTAGAATT
GAGGAATTGCAAAGGAACTTGTTTCCCACGAGACTGGAAAGCATAGGTACAGTAATATTC
AGTGAAGTATTGAAATAGAAAGGAAAGAATTATGTGTGTATGACTATGACCAGTTTTAGC
ATATGAAGGATGACACAAGCACTACTTCACAGCTACGCAAAGAATTTGGATGAGCAAATG
GAGTTTAAAAAACTGGAGCATATTATGCATACTCTCGTACCCACTTACCTGTAATCATGT
GCGTAGATTTTTGGAACTGTGCCACTTAAATTGTTGAATGATATGTCACTGAAACATATT
TCCCACGTCAGTTTAAACACCAAGAGTCACTTTTAACCACACCATTTGTCAAAAAAGAAA
TAAACATGTAACAGGAGACATACAGGAATGTGAGACCTGGAAGCTTCGCAACATCTATAG
GGATTTGTCCAGACAAGTTATTCTTATCAAGGCGCCTGAAGGATTTGCAAAGCAACAGCC
ATAAAAAAAACTAGTTCTCAACCCGTGTGTTTTCTCAGGCTAGCAATTTTAAGAACATAT
AGTAAACATTTTTCTAACATTAATTGCATATGAAAATGTGAATTACTTAGAAATATAAGA
AAACCATACAAATAGGTAACTGGAAATATTACTAGTACAAACATATAACAATTTCACTTC
GTTGCCATGGGCAAAAAAGGAAAATTATAACTAGACATAGTTCCTAATATGGTTTATGTG
CATGTATCACTGTTGTGTTACAATTGTATGCATGCTTTTTTTTTAAACAGTGATATAGCT
AAGCAAACTTATATGCATTGTGCCATCAAGCTTGTACAACTTTGCTAGCTTTATAATTGG
AATTGCTTCAATAGATTAGTATCGCAGGCACAGTGGTTATGGCTTAGTTGTACATGATCT
ATCTGGCATTGTACGACCAAACTTAAGAGTTCATTCAGATGTGTTGTATTCACAACACAG
GAGTTTTTGTTCTTGGGCAGGCATACACAAGAAACTTAATCAGAATCCACCCTGTTCTAT
CCGTAACATATGCATGTAAATTTAACAGACACAGTGGTGCTTTAGACAGCAAGACATAAA
CAATCCAATAGATAAGACTATCAATTTGAGGTAATAGATTAGCATATACTTACAGATAAT
TTAGTTGAGTCAGCTGCCCCAACGAATTCGGGATTTCACCAATAAATTGGTTACCTGAAA
GATCAAGAGCTTTCAGATTGGCCAGCTTCCCTGTCTCTGGAGGAATTTCACCAGATATTC
TGTTATTCTGTAGTAACCTGAAGGGGGGCAACAGAGAAAAAAGTTGAGCAACAAAGCATT
GGTAGTAAATTTCGTTTTCGTTAGGACAGATGGGAGTCAATGGAACAAGATCTACAAACA
GTACAAAGAATACAATCCCATGACTGAGGGAGCACAAGTAATAACAAATATTATGCATAC
ATACGTGTTCTAAGTAGGGTGGACACAGTATGATGGGTACAATAAGGAGTAGAAAGTCTA
GCTGGACTGCGCTGTCAATCATACAAAGTAAGCTTGATTTGGCCGTGTTGAGTTCTGAAA
GAATAGGGTACGCCCAATAGCATTCATTCTTGCCAAAAAAGAAAACAAATTTTGTTCAGG
GGGGCTTGTACCGCCTGTGATCTCTCAGCATTATTCTATTCACCAGTTCTTGTCCTGGCC
TTGAGAGTTTGCACACACGGACCCTGCTTGGGATTTTCATAAATTCAACTATTAAGGCAA
GACTTATATTGTATAGTTCCCCACCTTCAGCTCGCTAACTATCCTGATACTAATGAGTCA
CCGACGGAATAGCCTAAACAGTAATATTGTTTGAACCTAAACAGCAGTTGTGCTTCATAT
TTTCCAACGGCTAGACACACAAGTACGAACCTCCTCATTTTGAAGCGATTAAGCTCGGAA
GCTTCAAACTTGAACGGTGTTGCAAGACACACCGTGTCAAAGGAACTAAGGAAACAGGAA
CTGTGATTGGATAGGTGAGTTCGTTTCCAAGGCCTTACATTGTCTGCAGGTAACTGAGGT
TCCCGATACTCGGCGACAGAGCCCCTGACAATCCGTTGTTAGCCATCTGCCTGCACTCCA
ACATCCAAACAAAACAGCACGGCATCACCAACAGCAAAACAACAACGGGCAGAAGGAGCA
TCCGCGCAGGCGCAGTCCAACAGCAAGACAACAAATCAGGGAGCGAGATCTCACAGCGAG
ACGACGAATCCGTCGGGGGAGCAGGCGACCATTGACCAGGTGCAGGGGTCAACGGAGTTG
ATGTCCCACCCGGCCATCACCCCCTTCTCGTCCCGCATCCGGCTCTTCACCGCCATCAGC
GCCGCCACTGAAACACCGCGCAAAGCGCACCGAGCGCAATTAACACGAGAACATCCTCCA
CGTAGTACCAAATCCCCAAACCCTAGCCTCGTCCCTAGCCCAGCCACCCCCGCCCAACGC
CAGCCGCAAGCGGCGCACATACCTTCATAGTTGAGACCTTTGGGTGAGAGCGGCGGGTCC
CCGGCCGCTACACTACAAGCGGCGAGGAGCCACGCGGTAGCCACCACCACCACGGCGCCA
GCTCCGGCGGCGAAGGTTAGTCTCGCCATGGAAAGTGGGGGCGTGACTGAGAGCGTCTCT
GCACGGGCTCCGTGGCCATGGGTGCTGCTGTTATCGAGCGCAGTGCGTGCGCTGAGGAGT
AGAATTAGGCTCGCCTTAAATCTTAATTAATGCGAGTTGGTCTGAAAAATGGGAATCTTA
AATTAAGAAAGGGAGAGGCTAACTGGGCCTTAATTGCTGAGCCCGTGGAATGGAGTGGAG
GACCAGACGGGTGGCTCTCGAGGCTCCGGAATTTGTGCCCAGTGTTTTGTTTCCGTTCTG
TTTGGTTGGTTTTTCTTACAGGAGCCATGTAATTTAATTTAAGGTATATGACCTCTTAGA
GTATGGTTAATAGTATAGCCAACGGTCGGCTATAAGGCTGTTCATAGTGGGGAGTAACAT
ATGGTAGTATCATGCATATGTTACTATTGTATGATAGTACCTTCATAGTGCATAGTATCA
TAAATTAGTATCATAGATGATCTCATTTATTGACNNNNNNNNNNCATAGTAGCATAGCAT
TTAACATGGTACGGTATCTACCTATGTTACTATAACCCTCTCTCTCTTCTTTAATTACTT
GCCACATCACCATGTTTACTAGTTCCAAGACTATGTTACTAGCTATGATACCTCCACTAT
GGCCAGCCTAAGGAGTTGCCATGTCATATACTCCCTTCATCATGGTATATTGGACATATC
CCAAAAACGATAATTTTTCATAATTAGAAGAAAATAAGGCGCATGACATTAATTAGCCTA
TTAATTAGGATGTTTTGGAAACCGTCTTCACCAATGCATGCGAGGAAGTCGTTCGTTTAG
TGGACGGAGGTTGCTAATGCGTCAGTTTTACGATTAATTAGGCGCTTCTACAGCTCGTCG
GCTCGGTTTTTCCTACCAATAGAAAAACATCTTGGTCCCAGAGCCCTGTGAGATACGTCC
AATATACTGTCATGGAGAGAGTATAATCGATCTAATAGTTAACACGTATAGTAACAAATT
GTTAAGAAGTACTCCCTTCGTTCCTAAATATAAGTCTTTTTAGAGGTTCACTAAAAGACT
ACATACGGATGTANNNNNNNATACTTTAGAGTGTATATTCACTCATTTTGCTCTATATAT
AGTCTCCTAGTGAAATCTCTAAAAAGACCTATATTTAGAAACGGAGGGAGTACTACTTTA
TAAATACATGACCCACCTTACATCCTCACAATGTTTCTTGGAGCCTCTGCTACAGCCGAC
TGTTAATCTGTAGTTCGCTTCCCTTCTCTCTCCTCTTCTCTCTCATCCAACTCAACAAAA
ATATAATGTTTTAATCCTTACAGTCTTCTCTCTCCTCTTCTCTCTCATCTAACTGTATTT
TATTATACCTGCTCTTATACTACCTTAATTACACCCGCGATAAAACAACTTGCTTGAAAT
TAACTAATTCATACACAAATTTGAAAATCCCATAAAACTCATACACGAACTCGATTGTTG
TAACAGTTGACTATAAAACAGCTCCGCCTGTGACATGTCGGCTGCCACATCGAAAAGGGC
CCGCATCTCAATTATTGCACAAACCATTGCAGCACATGCTTCTGGAGTTTGCACATCGTC
CAAACCATCTACAAGTGTTTTGCTAGGCAAGCACCGGTACACATGAAGTGTAGGATCTGT
AACATCATATCAAGTTCAGTTTCAATGCGCAGAAAATTAAGTCACATAGTTAATTGCAGG
GCACCATAACTTGTTCACCTCAAAACGAAACTACTCTATGACCGACACTTAGTGCAATAC
TGATGCATGGTTAATTTGCAGACGATACTTGATCCGGCGGCTGTGCAACACTAAATAATA
CCGATGCATGGTTCGATTCATAGTGACGTTCAAAGATCAGTCAACCAGTATGTGACATCC
TTGTAGCAACGCTCAACTCAAAATTCAGTACTACAAACTACAGTTTCGTGTATATGTTCC
GTGACATAAAAACCAGATTGTTGCACAAAAAATTTAGAGATAGCCAATGTCAAATTTTAG
TAAATTTCAGTCATAATTAGTGGAAATCTAGAGTTTTCTTCAAAAATCAATAGTTTTCGT
ATAGCAATACTGAATCCACAGGAGTACTGTTCATATGATAGTCACGTATGGCACTGTCCA
ATATAAACAATATCTATCATATCTACTTCGCCTTCCCATACAGTGAGGCGTTCATCACAC
TGCCCTCAATTCCCCACTGAAATCGGGACAATTAGGCGTTCACGTGCTGGTCAAGATCAC
CAATCGATGAATCCATGCGCAAAAAAGTCCCCAATCATCGAATCCATGCACACAAAAAAA
GATGATCGTCCCTACCTTCAAAACCTAATGAAACGGGAAAAAGAAGCGAAGCCTCAAGGG
CGTGGGGAAGGGAGGGAATCGACACTACCATACGCCAGCAAGAACCCAGTCGCCGCTCAT
ATGACCGGTCACATGTCACGTCCCTCTCCTTCAACGGGTTCAAAACAGCGCATTCTTGAT
TGCCTCGGAGAGCTCGATGAGCGAGACGACCAGGCACGGCTTTGGGGGGGGGGGTAGCGA
GGCTGATTCATAGAACTGTGATAATATGAGGTTGCTCTTAAAATATTTCCATCCGCACAC
TCAACTCGGGACCAATAATACACACTAATAATCCACCTTTCAGGTTTATTTTGTAACACA
CACATGGCTTGGCGCATGCCAAATTCTGACGTGGTGCGTCATGAGTGCCGATTTAGGTTA
TTTTGTAGTCAACTGTTACAGCAAACGAGTTCGTGTATGAGTTTTATGTGGTTTTCAAGT
TTATGTATGAATTTGTTAATATCGAGCAAGTTGTTGTACTATGGGTGTAATTAACTATTT
CTAAATATAAGTTTTTTAGAGATTTCATTAGAGGACTATATATGGCGCAAAATGAATGAA
TCTACATTTTAAACTATGTCTATATACATCTGTATGTAATCCCCTAGTAGAATCTCTAAA
AAGACTTATATTTAGGAACGGAGGAAGTATTTTACTAAAAGGGGTTTCTAGTCTATCTTT
CTAAATTTAACTACTTGAAATTTATGTTTGGCTTATGAATCTCATCGAACACTTGCTATG
CGCCTCCACTACGAGCAACAGCGATGGTGAACAACGCGCCACCAATCGTACCGTTGAGCC
CCACGTTCTGGCCTCCTCACCATCAGACGTGAACGACATGATGATCCTCCTTATGCAGCG
TAATTGCATACCACACAAGCCTCCGGTCTGTACGTGTGTGCACCTATGTAGTTAGAAGGG
GGTGTCAATAGCTACAAAATCAACTAAAGAACACTAAAATCAGAGTTCGGTATCAAAAGT
TAGGATGAAAACGGTGATCGGTGCTTGGTTGAAACTGAGGGTGCGGGCGTCGGGTACCCG
GAGTACGCCGAGACTACACGGTTTCGAGGGAAACTTCATGATGTGAATATTTGAGTGGAA
AACTTCGATTACTATGTTGAAAATTGGTGGGTAAAAACAAAAAAATGGATGGATTTCATG
GTACGAGGGTGTGAGGGGTTGGGGAAGGCTAGATCCACTTGCCAAACAAAAAATCATGGG
TCAAAATAAAAAAAAATCTCACAAGAACGAACAAAATGAAAAACAATAGTAGGGCTATTT
TTGGTGGGGATTTTTGACTTAGGACAAAAACAACAAAAATATGCTAGAAAGTGGGGGTGG
ACTCCAAGATGTGAATCAACCTATGCTCTGATCCAAGATGATGTAGGGTGAAACCCTAGG
TGGTGATTGATACTTGTGATCTACGTTGGATTTTCCGTGAAAAGGAACGGGTTATCGCAA
AATGTGGGTAAGAATTTCCCTCAATTATGAAACCAAGGNTTATCGAACCAATAGGAATAT
GAACAACAACCGTCTTCAGCGGTTGCACACAAAAAAACAAACAACTTGCACCCAACTCGG
GCAAGAGGGTTGTCAATCCTCTTGGTCTCGTTATTTGCAAATAAGTGACATGTGTAGATA
ATTATGGTAATTGTAAATTGAAAAATAAAATGAAAACAAGTAAATGGCATCAAGGTATTG
AAGGTTTTGTAAATATATGGTGAATAGACCCCGGGGCATAGTTTTCCCTAGTGGCATCTC
TCATGAAAACATCATACGGTG