Map Locations of contig_43453 (9461 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_43453

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59304 9 3925 bp MLOC_59304.8 Available Available LOC_Os08g32100.1, FRAME:+1, EVALUE:9e-43, 13108.m03333 protein transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed





CDS Structure of MLOC_59304






Contig Sequence (9461 bp)

>contig_43453 9461 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTGCAGTGTGACGCCGGGGGCCGCTGTCCCGTGGCCCTTCTACCGCACGTGGCGGCCGCC
GGTATTTCCGCCCGTCTTGCCACCCGGCGCTTTCCGCGGGCCTCGCGTATACCAGCCTCC
GCCACCACCGTCGGGTGGATTTCGGCCACACACAGGCACCCCCTTTAACCCGTTCGGTAG
GTTTAATTATTGCGGCGAGCATTGTTGACCCCTTTTGCTGGAACACAATTTTTGGAACTG
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AGGCGAGCCTTGTTTGTTTCAGAAGATCTAATGATCTTACACGACCTTTGGTGTGTTTTG
GTTTGCTTCCACGACCTTTATGTGTTTGGTAATGCTTATTGTCTGTCTTGTTACATTAAA
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TTGGAGCCATGACTAGACCACCTATCACACCTGTTCCTCCAGCTAACGTTTTTGGTCCTG
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CCATGACTAGACGACCTATCACACCTGTTCCTCCAGTTACTGATTTTGGTCCTGAAGCCG
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TGTTGGCTTGACAGTTGACAGAACTATTAATGATTCTATTCTTCCAGTGTTGTTTGAAAC
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CTTTAACATTTGTATGCTCTTCTCTTTAAATGAGGAATTTGCCACCTTTGGAATATTTTT
GGATGAAGCTAATGGCGTAGGAGAACCTGCATTTGGAAAAAATGAACCTTTTCATTTCCG
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TGCACCCCCTCCTCCCCACGGGTCCTCAATCTCGTGAAATGCTTATTTTGTTCTGATCCA
TGCTTATTTGTTGGGTTTATAAACAGCTTAATGTCAATGAAGCCACGAGAGAGCACCTTC
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CTCTGCAAATCGATGCGATATCATCAATGTATGTTCCCATGGAGTGTGAATCTACAGTTG
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GAGTGAGTTTTGAATTGCAAGCTACATCCAAGTCAGGGAACAAGGAAACTTTGGATGAAG
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GTTTGTTCTCTTTTGAACTTTGTTTTGTTAAAAAAAACACTGTCAATTTTGATTGTCTTC
TCCTGTTTCCCACTTTTAAGGTCACCTGTGACTTGTGACATTACTGAAGCACTCCCAAGT
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TGTGCTGCCGCCTTTCTTAGTTCCTTGTTGCTCAAGATCGGTGGGTAATCTCAAAGCAAT
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GGCGACCCTCCCTGGCTACCTATTAGCTGCAATTGTTGATATCTTGGAATGAAGCAGTCA
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TAGGCCGTAACTACAAGTTTCAAATGGGTTCAGAACTATATATTTCCAAATGAGGCTGCA
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ATTATTACTACTAGTATTCGGTCGATTTTGTCTTTTAACTTTTTTTTTTCAATCAAAAAT
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GCCACCCAACCAGACCCCTCAAACTAGCTCTATACGTTCGGGTTGCGTGTTACCCCCCAA
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TGTCACGTGGAGCCCGCACAAAGACCTATCACTTTGAGGGGCCTCTTGTCCGGTTTGGTG
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GGCAACCCTAGCCCCGTCCCAATTCTAGTCCTCTCCCTCCCGTCTGTCACCCCTGCCCCT
TCTCTCCCTCTTCCATTTCCAACCCGTACTCGACTCCCGCAGTAGTCACCCACCTCCACA
CCAAGATGACACAAATTGCTGACCCCGGAGCGTCGGGCATAAGATCCTCGCAGAGATGCT
CGTTGCCAAGGCATGCCACCCAGTGTTCATTGCAACCCGCTTGCCTCAAAACTCCACGGA
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GGTGGAGGCACCGGACAAAGATATGGAAGAGGCAGAGGCGTTGGAGCAGGAGGAACCAAT
GGCAGACGACGAGGAGGAGGAGATTGCTACATGTGATGCGTTAGGATTTCCCCCGAAGAG
GAAGGGTGTCGTAGTAAAGTAGCAAAAAGTATTTCATGTTGTAAACGAAAGTAATGTCGT
TGATCTGTCGATGATTACAGATGCCCTTTTATATGTCCTGCAGAGACACGACGGTTGGAG
GACGCGTCGGTTCCAGACGGACGCGACCGTGCGAGAGACAACCGCACAGCGGTTTGTGCA
AGGGGAGATTTACCCTAGTTACATTTGTAATTAATCTTAACACTCCCCTAATCTATGCTT
GACCATGTAGAATCGTCTCACGATCATCTAGGCAGGGCTATCATCTTGAATAAATTCTCC
TCCAAAAGTTCTTCATGAAAACTTGATGAGAACCTGAAACATAAACTCACAAAGAGATAG
CATAATGTGATGTTATTAAACAAGGATATCTCAAGAAGAGACTCCCCCTGTTGTCTGCAA
GTCTCTATGTCATCGCATACCAATTCCATGAACATATTTCTGGAATGTTGAGTTTGGTAG
AGACTTAGTAAATAAATCAACAAGGTTGTCGCATGATTTGACTCGCAAGATGCTTATTTC
CCCGCTTTTCTGAAGATTATGGGGGAAAAACCATTTAGGAGAAATATGCTTAGTGATATT
GCTATCGATATATCCTGTTTGCATCTGTGCAACACATGCCACATTATCCCCATAGGTAAT
GGTGGGTGATTCTATTGAACCAATTCCACATGACTGTTGTATGTGGNNNNNNNNNNNNCG
AAGCCATACACATTCACATGACCAGAGTCTCTTTTGAAGACTTCCATGATATAGCTATAC
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CGGCATCTGCATACCCAATCATATCAGAGTCTAGATTTCGCTGGAACTGGAAGAATAGGC
CAAGATCCTTTGTGCCTTGGNNNNNNNNNAAGATATTCTTTACTCTAGACCAATGGCGTT
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