Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
![](/morexGenes/blast_net_images/contig_434148_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-MorexXBarke_maploc.png) |
![](/morexGenes/blast_net_images/contig_434148_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-OregonWolfe_maploc.png) |
No map location |
Predicted Genes from contig_434148
Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
---|
MLOC_59260 |
1 |
399 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_59260
Contig Sequence (3105 bp)
>contig_434148 3105 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGGACTTCCCGTCGCTTCAGTGCTACCCTCTAGATCGGATTAGGGTTAGGGAGTGGGGAA
CCAGTGGCGGCGACGAACCTCGTAACCCGTGCCATGGTCCCCACCTTCTCTATATATAGC
ATTGCGCGACACGTGCCCACCAGCCTTACTTGGGCTGGACGCCCCCGATCAGGGCGTGAG
TCAAGGTCCAATGGGCCGTTGGGCCCATTGAGGAAAGAGATCAACCTAACAAGATTAACT
ATGAGAATTGAAACTTAGATCCATATAACTTATTATGCTAGATGATACATCGCACATTGT
TGCAGAAATGTTTTGCATTATATTTCAATGACATTTGATTCTATGGGACATGAATAATTG
GGGTGATAACATTTCAATGATGCCCCGCACGTTGGCCAATGTGTCGTTTGACCGCACACA
TGCAAGGCTTATCGCGGTCGAGAGGGAAAGAGACAGAAGAGACAGTGTGAGAGGGGTATT
TGACGACGCATTGACGCGTTCAAGACAAGGCAAATAGGTGAGGGGAGCTCGTTCATGCTA
TGAACAAGCAGATCGAATGATTCCATGTTGAGGTTGTAAGGGGACATGCCCTAAGATTCG
TGCATCACATCCAATGCTCCTCAGGCCACTCGCATGGACGACGCAAAAAAAAAAGTGACG
TCAAATATTTAGCATTTGGGAATACAAACATAGTAGATAAATCTAACATTCATAACCTGC
TTACGTTTTCTGCATGCCATTAAAGTTATAAAACTTGTCTAAAATTGAGAAGGAAAATAA
TGTTACTTAATTTATGCTTTTAATGAGGATTCCTACTATGGAAAGATATTAAATAGTTCC
AATTTTATTGCTTGATGTTTACTGCACGGGATAAGGATGACCTGTTCTCTATTCTCTCAA
TCTCTCTATATATATGATCGAGTCATAAGTTGATTGGTAGCAAAAAAAAATTATCATCGA
CAACCAAGTGACTGAGTGGGGGTATGGGCAAGCACACGATTCGCATCCTTGCACTAGCAG
CCCTAGTGTGTCTACATCTCCTATGCTCTGCTACTATTGCTCAATGTAAGGCAGCTAGCA
CACCAATATTTCTGTATCTTCACAACACTTATTTTTTCTTCACTTCCCCTGGCTGGAAGT
ATGTACGTCATATAGCTAGTGAAGGCCTTTCTAGCTATTTTGCTTCTTGTCTAATTTGTT
GGGTCATTTATTTATACCAATGATCGTTCGTTTGTTATTATTCCATAATATACAGGCCGA
ACCATGGCTGACACGGATAGCGAGAAGATCGATTTACCACACGGGTTATGCGTTGAAGTA
GCTTATGAAGATTGTAGGTCAAGAAGTGGTTGCTTCCATTGTTTAGTAACTGATGTCTTC
TACCCCACTATGGATGACTGTACGAGCAAGTGTAACACATCATCGTCTTCACAAGACATT
CTAGTGGCCATGACTACGTCCCCTCCTCCTCCTTTACCCGCTCCTTAATTTTTCAGCCTA
GATAGTCAAATTGGCTTACATATGTACAAGATTGTCCCCGAAAAATAATGTCTGATGTGC
GGAAATGCAGTTATGCAATAAGAGTGATGCTCTAGCAGTTGTTTAGTAGTTTCGTTCGGT
TAATTGCATTTGAACTTCTATTAGTAATTGTTGGGAATCGGGAGAGCGACGAAATGAGTA
GATGCTTATGAAATATCAGTGGTACAAATTAGCTTGGGATCTGTATCAATTAACTTGTTG
CCAAATGTGAGTGCTCCCAGTTTTCTCTACTCTTTTAAAAAAACTATTCATGTGTTTACC
ATTCTAAGCAATTTTAAAAGGTACAGACTTTTTTGTAAAATTTATGTAATTTTTTTTAAA
ATGTGAATAATTGTAAGTTATGAACAAAATTTCAAAAGGCGAACATTTCTTGGAAATTTT
TGACAAATTTTATAAGGGGGGTATATATTTTCTAAAAGAAGAAAGAAACGAAAATCGAAA
ACAAAAAAAGGAAAATAAATAAATAAAACTAACAAAAACGTAGTGGGAAAAATACCTGTT
CTGTACATGAAACCGTGCACTGAAGAATAGTTCTAGTAGTCAGCATTTTTGCAGTTAGAC
ACTCAAGCTTATCATGTTTCCATTTCTTTTTTGATATCCTTTTCCATGTTTCCACATGCA
CCAATGGGCCGGCGCAGTCGGGCGGCCTCCTTTGCCTAGCGTAGTCGATACAAATCTACT
ACCTGAACAACAGACCCTATTTGCCGCCCGTGGGCGTCAAACCATCTCGACTTCGCGGAA
GCGAGCGACCGATGTGACACGGGCCGGCCGGCTTGGAGCGAGCAACCGATATTGGGAACT
TTTAGATGGTTCCCCGAGTTTTTCTTTTACGTTTCCGTTTCTTTTCTTTTTACCTTATAT
TTCTTTTTTTCTGTTTCCTTTTTGTTTTCATAAATTCAAAAATTTAAAACATGTTTGAAT
TTCCAAATTCTGTACATGTCTTCGCAATTGCTCTTGTTTTTAAAATTTAATCACATTTTG
AAAAAAGTTTTGAATTCCAGATTCCAGTAATTTTGTTCATTTTCCAAAACAATGTTCACA
AATGTGTTCACCGGACATTGAAAGTGCTTATAAAAAATGTTCATCATGTATAGAAATTTT
GTTCAGGGTGCATTTCAAAAAAGTTCAGCATATATTTTAAAAATTGTTCAGTGTGTATTT
GAGTAAAGTTCACCGTATACTGAGAAATCTTTGCACTTAAGAAAAGAATATTTGAAATTT
GCTTACGATTTTGAAACACCTTCGCATTTCCAACAAATTTTGTACACATTGTTTTCCAAG
AAATAATGAAAAGGTAAAAAAAAAGGGATCTGCCACTTTGATTAGTACTTTAAACTTTAG
GGGTTCTTAAGTAGTCCTGAGTTGCTAGCATCGCTAGCATTCATGGACACGTTGGTTGTT
CGAATCCTGTTGTATGCGTTTTTATATTTTTCACAAAATTCCAGCATTCGCCCCTTCTAT
CTCAAACTGGACTATTATGTACGTGTATTAATATGTACTAGCAAAAGGATCCGTGCGTTG
CAACGGAAGAAAAAATACCACACGCTTTTAATCTTTTTATAATCA