| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
| No map location |  |
No map location |
Predicted Genes from contig_43291
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_59130 |
3 |
2106 bp |
MLOC_59130.2 |
Available |
Available |
LOC_Os03g59750.1, FRAME:-3, EVALUE:6e-97, 13103.m06561 protein DNA gyrase subunit A, chloroplast/mitochondrial precursor, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_59130
Contig Sequence (12834 bp)
>contig_43291 12834 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCCAGAGCCATGACTTGGTTTCGAGATCTTATGGGTTTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTGTTGTTGTTGTTGCAGATGTTCATATT
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ACCTTGTTTAACCAAACTGATGATGCTGAGTGCAGGTATGGTCATTTGGGACTCACGGGC
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AGTCCTCGCATGCCTGGAGGGGCTTCGACTATGCATCTATGACATTAGCCCATTGCCAGT
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ACGGTCGTTTTACTTCTTCTGCCAGGTGCTCGTGTGTCCAAAGGTTTCGAGAGAGTGCAA
TAGGTTGCCCATGATATAGCTAGATTGGTGTCTGGAGTTGGTACTATTAATTTGTTTACT
CGTGCTGCTCCTTCATGCATGTCAGAGGGCATAGATTCTGATTGTGATAACTCTTATGTT
GGTTTGATCAATAAACTCTCTCATTCTCCGCAAACTGGAAAAAAATGCTCAACCGGTCAA
AAGTAAACCAGACATCCTAATGATGATGCATTTTCAGCAACTGAGGTAAAGCAAGGAAGG
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TATTGTTAATACTTATCCTATATCAAGAAAAGATAAATAGAACTCAGAAGATGACAGGAT
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TTTCTTGCTTGACAGGAGCTCATTTAACTTTGAAATGCTCTCCGACAAAGAATTAGCTTC
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ATAATTTTGATTAATGGTGAGACAAATGGAATCTATATACGGTAACCTCAAGGGAAGTAA
GTTTCCTTAGTGTAATGTCCAAAAGTGCTTCTGCTTGCTTCTCAGATAGACCATATTCTG
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AAGTTGATTGCTCTTAATATAATCGCTCATGGTACTATGAAAACAAAACCAGTGTTAACT
GTTAAATGCACTACCCAACGCAACCAAAAGTCCGAACTGGTGGAAAGGGCTAGGCAATCC
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CTAGTTTTAGTTATGTGCAGAACTCAAAATCAAATCTTCATTCTTGAGTCCCCGTAGAAA
GAATCAAGGAAAAAATATCGAACAAAAACATGTACTACATACTAGTGCGTCCTTGTACTG
CAAATTTGCATGATGCAGGAATAACTCTGCATTCGGCTGCATTATAATTTGTTACAGCCA
ATTATAGCCTGAATACCAGTTTTTCTACAAATGCAACCTGCAACTAAGTTTGTTTAAGCT
TGGCCACATTACAGCTGTGAATCCTGTGAGCTAAAGATAACAACTAAAAAGAACTCAACC
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GGAGATAGTGTCAGTCACAGCATTGAACAACTTCTAGGTTTTATTACTCCATGGGAAGAT
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GCTAAAGCTTCCTTTGCCACGGTGTGATTTGATGTTTCTCTTATCACTTGAATTACAGCA
TCTAAATTGTCAAGACCAATGACAATGCCCTGCAGGACTAAGCAAATTAACCATCGACCC
TTCGCTGTCCAAACAAGGCAGAATATCCAAATGATTTACCTCCACAATATGCTTTCTTTC
TAGAGCTTGTGAAAGCTTAAACTTTGCACGCCTTTCAATAATAGAGCATCTGAAGTCAAG
GAACGCCTAGAGCACAACCAAGATTTCAATGGAAAGTTAGGCTTGAAGTTCAAAAGGACA
TAAACTGCTAGATCATTTATCCTAGTATAATCAATCATAATCTTGGAGTGTGCATGCGCA
GAGACTACAATTGCTGAATGTATCTCCTGAAAGCTTTTCCTCAAAGATAAACTACTGAAG
GTTAATTATGCCCACGGTTAGTGACTTAATATCATGGTATACAGTACACTACACTAGCAT
TTGCAACTTCGGATTGAATCAACACATATTATCTAGTGGACATGACATACAGAAATATTA
ACTTCATTGAACATGACATGGAATGGGAATGGACAGGATAGGGTGAACATCACAGCACCT
GAAGAATTTCCTTCAGTCCCATCAGTTTTGGATGCCCATCAAGAATACTGAACAAATCAA
GGAAAAAAAACAGATGTAAGAACTGAAGACAGGTCAAGTTAGTTACTGTTTAAGAATGCG
ATGACATAGATACAAATTATAGATAGTATGGTAACCATGCATGGACAATGCACGTTTAAT
TAACATAATCAAAGCATGGAGAAAACAACCCTTTTATAATTTACAAGTATATATCTTAAA
ATTTGGAGGTGGAAAAGAATTGTCAAAACATATTTGTGCACACTTTTAAGAAAGGCCAGT
ATAGATAACATGCATGTCTTGAGGGAAGAAATAGACATTTTTTATTAAACAAATATCTAA
GTGTAATTAGGAGGCAATAACGACAATAAAGAACTTAAAAGTACAGTAGTGATTAGGGTA
AGGTACATTAGTCCACAACCACTGGATGTATATTTAATTAATTGGATTAAAGATTTGGAA
TGGGAGCATCCGAACCTAAAATGTGATTTATATGGCACAGATAACCGTAATGAGTTCAAA
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GCATGCATAGCTTGATGTAAGGTACTCTTCTTCGCAGGACCTTCACATAAGCCCTTAAAT
AGCTATTGTCACATCAAATAAACAATTCTGCCTATTATTTTAGTCGTGCTGGTACATATC
ACATTTGACGTGTGTATTGCATAAAACATGGCATCCAGTTCTCCATATGTGATTGCACTT
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TGATAGTCCCCCTGTCAATTCTATTTTTGATATCTGCAGCAGATACACTTAACTATGGCA
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CCAAAGATAAATATTTGCTATCAAATTTAATAAACAAGCATATGTACCATATATTTTCTT
ATAACAGTGCATAATGCACTGGTTGACATAAATATTGAGGAAGCGCCTTAAAATAGTTAA
TTATATGGATTTAAAATAACAGCATCCTAAGTCTGAACATTTAAGAATATTTAATGAAGT
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GCAAATACTATGCACCATGTGGACAATTTACAGTCTTGCTTTTACCATAGAACACATGAC
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GCAGCTAAAACTAGACTGCAATGCTGTATGACGATACAGGTTGTTCAGGACAATGGCAGG
ATTTGCGCCTCTTTTCACCTGGAACAGTATGAAAGAGAAGGTAGTGGATTCCACATAAGC
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AGCACATAAAGTCAAAGATGATAATACAAACCTCAATAACTACACGCATTCCAGCACGGT
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TTGGTGGTACCAATGATAGAATTCAAATTAAGCTTAAGTTAGTTACAACCAGCTAGCTTA
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CAGCACGAATAATAATAAATAATACTCCCTCCATTCCTAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATAGACATACTTTAAAGTGTTGATTCACTCAT
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CTGCCAAAAAGGCATTGCTCTGAAAATACTAACAGGAACCAAACCTCATTAATTATGATA
GCCGTGCGCTTGGTTTTCTCATCAATTGTTTCAATGACGGTTTTGCCTCTCATCACAATT
CGACCACGCCCAGTTCTATACGCCTCCAAAATACTATGCATGCAGAAAAAGAAATGCAGA
ATAAAGCACCTTAGTGTATGGTAAAGGGAAACTAGACCAATGAAATATGAATCCAGTACC
CATCATTTCCCATGAGTATCCCTCCTGTAGGAAAGTCAGGACCAGGCATGTATTCCAGTA
GTTCTTGGAGCTTGCATACAACAGAGAATCGCGATCAAGATAATGAGAATAAATAAAACA
TAGAAGCAGAAGGAGTAGAAGACTTGAAGTGAACAGAACTAGAGAAATCCATTTAAGAGC
AACAGTCAACTACTGTGAACCTAAGAACTTATCCTAGAATGACTACACCAATGTCAATGT
TTCGAGGATATATTCTTTAGAGAACATGCAAATGATGCACATGTACTTTTGTTAAGAGCA
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ATTGATTCACTACGCCTTAAAGTGATTCACTATGATTGGTTCACTATGATTTAAGTAAAA
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GAGTAGCAGCTATTTAACAAATACTCCCTCCATTCCATATTAGCTGTCACCGAAACAGAT
GTATCTAGACATATTTCCATGCTACTAATGGCAATCATTCGGAAGGCTTCCCAGACACAA
TCCAAGACCAGCATGGCAGCACTTATAATTGGCCAACAGACCTGACATGCTACATCAGCA
AGTTTCGGCTGGGCAATTGCCTTATACTAGTATCCTGGTCCTGGTGTCTTCCACGAAGTT
TTAGCACAAAAGAATGAGGGCTAAGCAACTAGCATTGCAATTGTACTTCCAAAGCTTTGG
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ATTTACAAGTTCTATCACTAAAGGCCTACCAGGCATCACCCGAGTGCTTAACCAAATGTG
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AAGTAATGAACAAAGATCGATTGATCGAAAAGGAGATAATGATAGAATACTTACCGTAGC
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TAAAAGAGCTCATACTGCAATTCCTGAAGATCCATTCAACAGTAGTGATGGAACACGAGC
TGGCAACAGAGATGGTTCTTTCTGTGAATTATCAAAGTTCGGAACGTAGTCAACCTGTCC
ATGGCAAACAAGCGGCATGAAATAGGTAGGAAAAAGGAACATCCACACCAACATGTGCAT
GCACACACAAAGAGAAACACATAAGAACTGAAGCGCAAAGATTTACTGTATTCAGCTCCA
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TTCAAGTTGGTGAAAAGGTCAGCTCGTAAAAAAATTGAAGTGAACCAAAACCTACATCCA
AGCGGCATTCTGTGTATCGCATTGCAGCGGGAGGATCGGCATCTATTGAACCAAAGTTAC
CATGTCCTTGAACAAGTGGGTACCTCATTGAAAAGTCCTGCAAGATTGCATACAGAAAAG
CCTATTCAGCTGTAATGAAATAAGCAAATTTGACATATGTGATGCAGCTTCACGGGTGTA
GCTTGGTTTAAAATTGGAGAGATGTGATATGATATAGAAATTCTACATGCAAAAATTACT
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GTGTGTTTCCTTCTTTTAGCCATCCCTTCCGATGCTGCCCCTTTATTCAGTTTTCCCGTC
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CCAGTTATTGCCTCCTTGGTATGCGGGCTGGTTCTTATGTTCAAAGAAAAAAGAATCGGA
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GTCACTAAACTCTGTTTCTGGCCATGGCTATCTAAATTGACATACAATGCAAGTACCCAA
GTTTAAACGAGGATCAATCAGCATCTGCTTATCGCATAGACCCACCCAAAAGGGGAATGG
TCTGGTGAAGTGCACGAATTACATTGTATGGCATTCATTCATGGAATACGTAGACAGATA
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ATCTACACAGTAATGTTACCTGAGCCATTCGTACTAAAGTTTCATAGACGGCTGAATCTC
CATGAGGATGGAATTTACCGAGTACCTGCAAGAAGTATGAAAATTTCACGTCTGTGCACC
TAATAGGAAGAAAGGCATCACCCGAAAAGCACAATATTGTTCAAAAATGTTTATCAAAAG
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ATTTATTTACAACCTGAAATTTTCCAATTTATAAGCAGCAACTCATTCACAACTCAGCCT
AGGTGATTATAATTTTTTTGGTCCTGGCTCTAAGAGCAAGGAACTAGATAGGTGAGCGGA
AATATGCAAAGTTAACTAGATAACTCCAAATCAATGGGCAGGCTAGACAAACATGATATG
CAGTTTTGAGACCACCAGTTCTGTAGCAAAATAATTGGTGCAAAATAAACTCAAAATCTG
ATCAGAATGGTATAAAAAAATGTGCCTGCTCCAAAACAAAACTCTTTTTAGTGTATTGGT
GTAATGGTTATTGCTGCTGTTATACAATACCCTAGAAGCCCAGAAGCAAATAGTTTGTTC
GCGATGAAGATGCAATTGAACGAAGAAAAGAACACCTATTAGCTTACAGTCATACCACAA
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GAAAATGAATTTACTATTTGAGAGAGCGATTATTTGGGAAGTGCTTTGCTGGATACTGAT
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GTGTTTCTACTTATGAAGGAAAAACATGGTTTGGGGTGTGCAGTCGACATTTATCCATGT
GGACACACTTAAGACATTCTATAAAATCACAGTGGATTAAGATGTAAACCCAATATAATG
CCACCATTCCATTTTTAAACTCCATGCAGTATAACTAAGTCAACTCATTCACGAGCCCAT
TACATGGTGCAACTGCAACACTGTTATCAACACAAAATGCTTGATTACACAGGTAATGCA
CCCTTCTCCTATCCAAGTCCTATCACACCGAGACACCAATGAAACAAAAGCCTTTTAAGC
CATCTCCACAATAGTAGCAACGCAGAAAAAAATGTTCTACAGATCTATTTTGAAATTGGA
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CTGGTCGTATCAGCTTCGGCTGGCCTCTAATGGCCTCAAAGGAGCTTTAAGAGTGAGCAT
ATTATTTGTGCATTACAAAGTCTTATGCGCAACAGCAAAGTAAAACAAACCAACAGCATG
GTACAGCAGGAGGGGAATATGTGCTTCAAATCACAAATGATACAAGAGTTCCTTCATGCA
TACCTCACCAACGACTCTGGCACATTTTCTGTATGGCTTACGAGATGCGAGGCCCATTTC
ATGCATTGCATAGCTGCAGAAAAAATGAGGATATCACCCAGATGGCATGGAGTAAGGTTA
ATTACAATACTAGAATGAAACTAATCTGCAAAATGTGCTAGCGTAGCACTAGTCAAGCAG
ATAACTTCAGAAATGGGAGAATACTCGTATGATCGTCCAATATTTCTTCAGAGTAAGAAT
TCATATGTTATGTAAACCTAAGATACTTCAGACTGTAGATTAGCTCAAGAGACAGATTCA
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CATCTCCAGGCAGCTACACCTTACAAAGTTATCTGATAACTAATGGTAACAACTTGATTG
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AATTTGTTTCTCTTCAAACTCATATGACTTATTAGACAGGCTAGTATTGCCAAAACGGCC
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GGACATGTACGCGTCGGTGGCCTCCTTGTGGAGCTCCACCTGCACAATCCGCTCCTTGGT
GACGGGCGCCCCATCCCCGTCGGCGTCGCCGTCGCGGCGGCGCGCGAGGGGGAC