Map Locations of contig_43221 (9328 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_43221

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_59047 2 1214 bp MLOC_59047.1 Available Available LOC_Os05g01970.5, FRAME:-2, EVALUE:3e-146, 13105.m00143 protein NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed
MLOC_59048 1 165 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_59047






CDS Structure of MLOC_59048






Contig Sequence (9328 bp)

>contig_43221 9328 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCGTTTCGGCCAGCGCGCTGAATTGAAAATGGCGCGCGCGCCGTTTTTACGCGCCCGCT
GGAGCTGCCGCCGCGTTGCGCGCGCACTAAAAACTGATTTTTTTACGACGCGGCGTTTGT
GTAGCGCGTCTGTTGAAGATGCTCTTAAAGAAAATAGTACGTCTGAAGAGCTCACTTTAT
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CAAAAATTACCTTTTACATACATGCAAACTTTAGTTTTAATAGCTCATGGCAAAATTACT
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TTTTATTAATTGACTGACAAATATAGTTTATGTACCACAACAAATTTATTTAATTGACCT
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GCCCATAACAAACCCATCGACTCTTTCTCTACAAAAACGTTCGTTGATAAGTGTTGGACC
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TTTCGAAAAAATAACAAGACTGCGAAGAGGGATGGTAGAGGAAGGAAACAAGAACTCACT
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GGTTGATCTCAAGACTCTCCTCATCAATTGCGCACAAGCTGTGGCAGAAGACAACCATCT
GTTGGCCAGCAAACTCCTAAAGAAGATAAGGGAACACTCCTCAGCAGATGGTGATTGTAC
TCAGAGACTGGCATTTTACTTGGTGGATGGCCTCGAGGCACGCTTGGCTGGGATTGGGGG
TCAGGTTTATTGCAACCTCATGGAGAGGCAAACAAGTACAACAGATTGGTTTGATGCTTA
CAGCCTTTTTCTTGCATCCTGCCCTTTTGACAGGACGTCATACTACTTTGCCAACCAAGC
TATTCTTGACATCTCACAACGAAAACCAAGGGTGCACATTGTTGATTTCGGCATCGGCTT
CGGCTTTCAGTGGCCATTAATGATTCAGAAGTTTGCACTGCAAGAAGAGGGAGCCCCTAA
GCTTCGGATCACAGGTATAGATGTTCCCCAGCCAGGTTTCCGCCCCTGCGAAATGATTGA
GGAGACAGGGAAGCGGTTGGCTGATTATGCAAACATGTTCAAGGTACCTTTTCAGTATCA
GGGCATTGCCGCTTCAAGATGGGAGACCATTAAAATTGAGGATCTTAACATTGATGAGGG
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CATAAATAGCACAAGGGATAAGGTGCTCAAAACTATGAGGAGGATGAACCCAAAGATTTT
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GGTTATGATCCATTACTCTTCAATGTTTGACATGCTTGATGCAAATGTTGTTCCACGGGA
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GTTGCAAGGATGGAAAGGGAGAGTACTTTATGCCATATCTAAATGGCAACCTAATGAATC
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TGATGTTCACCCATGTTAGTTCCACTACCTCCATTCCTAAATATAAGACGTCTTATATTT
AGGAATGGAGGTAGTAGCTGCTAAGCTACATGATGTTTCATGTACCAGAGCTTCTCAGTT
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TGTTTTGTACGACTATAAATACGCAATACGGATAACCCTGAATGTTGTATGGACTAGCTA
ATGAATTAGCTTGAAAGTAGATCAAGTAGCCCCCAGAACATTATGGCAACATAACCCCTG
AAGGACAAGGATGTCCTACCTTTATTTACCAAACAAACTATCTGCAAACACTAAGTCCAT
ACGTCCATATTAGGACCGATCAACCAGGTAACAGAACGACCATAAACATTTTATGCAGAA
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TGCACAAGTTGACATATATATTGCTGATGTGAGTAATGCCATTGCCAGGTGGTTTCGTCA
GTGAGTCACCTGCTCGGGATCAGACCCTTCCTCGAAGTAAAACTCGGGCCGACCGCCTTT
GCTAGGATCGAACCCGGGCTTCATCTTCGGGACCCCGCTGGTGAGGATGATGAGAGCGTC
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TGATGTGCGGCGACAGGACGCGGATGGAGAGAAGCTAGAAGTATGTGTGGTACGTATCTA
CCTGTCCGTCCTCCGGCGCCGGTGACGAGCACGGTGGGGGGCGACCCGGCGGCGGCCGCC
GCGGAGGCGAGGCCCGGTGGGGCGGGCG