Map Locations of contig_43156 (8025 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_43156

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_58960 3 1608 bp MLOC_58960.1 Available Available LOC_Os01g67134.1, FRAME:+3, EVALUE:4e-167, 13101.m07281 protein ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_58960






Contig Sequence (8025 bp)

>contig_43156 8025 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGGCGGGGCGCGAGGAAGCCGGCCCCGCCGCTCCCATGGCCGCGGCCGCCCTGCTCTTAG
GGGAGCTTGGGGAGGTGGTCATGGCATGGCATGGATGCGAGGAATTGTGAAGGGGTGGGG
AATGTACATGCATGATCTGATCTGATGCTAGAAAGAGCTAACTAGGACTTTGTGCAGATT
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GAGTACCGTTCTGGAGTTCTGGATTATCTTAAATTATACTAGGTGCTGGCATTTTGACAT
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TTGTTAGCTTATTTATGTTGATACATGCCTATCGTTTAGACTGTAGATGAACGTCACTAG
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TGCTGTTCCCCCCTGGATGACAGAAGTAATTCTCACTGCAGAATCCAGTCTAGCTGCTGG
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GGGGAATCCACCAAGGAGATCCCATTTCCCGAACCTGTTCTTGTTGGTAGCAGTCGTCGC
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TGACAGCCTGCTGTTTGTCAAGGCCAGTGTGGATGGAGCAAATGAGTTGTCTTCTTTGTT
GGAAAATTACTGCAATGCCTCGGGCTAAAGAATTAACTTATCTAAATCTTAAGTTTTCTT
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TGAGTCCCAGTCCCATTTAGAAAAATATCTGGGTAAAATGGAGCCTTTAAATTCCTAAAA
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TGCTGTGGACTAGGATTCAGGGACATAGAGTTGTTCAACCTAGCGCTTTTGGCTAGACAA
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AGCCTTGAGCGCTGTCTGTCGCGATGAGGCAGGCAAATTACTGGGAGCATCAACAATAAA
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CTCATAGCCTTGCTAAGCATGCTTTCGGTCTGGATTTGGAGGGTCATTTTTGGCTCCTTA
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GAAGAGAGTTAACCAATTTATAAGAAAAACTGGCCGAAAACCGATACATCAAAACACACG
AGACAACGAACCTGCCGCTCACGCGACCAAATTTGACACTCCACAACACAAAGGTGCTCT
CCGGAGCCGCCGCTCCGACTTGCTCGCCGACCTCGAGGACGTGCTCCACCTGAGCTGATG
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TCCGACTTCCTCACCGGCCCCGAGGCCGCACACACTCCTGGCCGATGATGAACCCGCAAA
GCCACCTGAGCCACCGCGAACTCACGAAGGACCAGACCTCTAAGGCGTCGTCCCCAAGAG
GAAAGCGATGATATCGTCGCCGACGCCCGCTCCGACCAAGGTCGAAACTACGGTTTTCAC
CCGAAGAGCCCGAGACCGAGGTGAGAAAGGTGGTGAAGGGGCTCCCACGATGACGCCTCC
AAGGAGGGAAAGACGTCCTAGGACGCCGTCGACGCCGTCAACGACCGAGGTCTTACAAGG
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GCCACATGCCGACTGTCCTTGCCCAAGCCGTCAGCTCAAACACGCAAGGCAGCTCACCGC
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CAGCAGCGCTCCTCGCTTGTACGTCGAGCCCACCAGTGCGACGCCACCGCGTCGCCGTCC
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CCGGGCCAACCACACCCCAACCGTCACGGCACCGCCGCGCCGTCA