Map Locations of contig_43151 (8212 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_43151

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_58957 2 1883 bp MLOC_58957.1 Available Available LOC_Os03g19310.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13103.m02311 protein glycosyltransferase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_58957






Contig Sequence (8212 bp)

>contig_43151 8212 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCATGCAATGTTCCCCAACACATTGCATCTTCCAACCCGCACGGGATAACATCCGAGTC
GACTGATCCAGACTAGTCAGAGTCAGATCCACTGCCCGCCATGCCGAGGAAGGTTGGGGA
TCGCTCATGGTGAGATCGAGTGACGGAGGGGAGTGCAAGTGAGTTGATTGAAGTGGCTAG
GATTTGATCCGGCGAGCGAATATGGAGGAATGTATACGGGTTGGGTGGGGCAGCATGGGT
CGGGTGAGACGTGGCAGATGCGCCCGCGCCCCCCATATCTGCCTCATATTTGGGTTGGGT
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TGCCTACCGTTTCTTGTTTGTTGTCTTCTTTTCAATTGTCTGTCGATTGTGAGCCTTTTT
TTTTCTGAAACGAAAGACAAACAAGAGGAAAAACAAATCGGTACACAATAGAAAACTTTA
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TGCAGTTGCACTCGGGTTATAACGCCTGCAGTTGCATGTTTAATGGTGGACATGCAGTTG
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TAATGTTTGCAGTTGCATGTCTTGTGATGGACATGCAACTAGCCATACAATCTCCTTTCC
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TTGTGCCCATGGGCTTGTGATCTCATTTGTAAACTCGTAGTGTCGACCCATTTTAAAAAT
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TGGATCTGTCCACCCATCTAATTACTTCACAAATGAACGTAAAAATACAGAGCAGCTAAA
AAATCCCGACCTGGACACTAAAAGCAGACCAGAAAAGACGAACCCATAACTACAACGACA
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GCGCCAGCTGACCGACCGGCCGTACTCGCTCGGCCCGAACGTGTCCGACTACGACGCCCG
CAGGGCGGCCTGGCTGGCGGCGCACCCTCGGTTCCCGGCCATGGTCGCGCCGGAGCGGCC
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CGTGCTCCTCCGCGCGTTCAAGAACAAGGCGGACTACTGCCGCGTGCACGGGCTCGACAT
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GCTGCGCGCGCTGATGGTGGCGCACCCGGAGGCGGAGCTGCTCTGGTGGGTGGACTCGGA
CGCCGTGTTCACCGACATGCTGTTCGAGCCGCCGTGGGGCAGGTACGCGGGCCACAACCT
GGTGCTCCACGGCCGGGACGACGAGGTGTACGGCGCCAGGAGCTGGCTCGGCGCCAACAC
CGGCAGCTTCGTGCTCCGGAACTGCCGGTGGTCGCTGGACCTCCTGGAAGCGTGGGCGCG
CATGGGGCCGCGCGGCCCGGTGCGCGACCGGTACGGGAGGGTGTTCGCGGCGGCGCTGTC
GGACCGGGCGCCCTGGGAGGCCGACGACCAGTCGGCGCTCGTGTACCTGCTGGTGACGGA
GCGCGGCCGGTGGGGGGGCAAGGTGTTCCTGGAGAGCTCCTACCACCTGCACGGCTTCTG
GGAGGAGATCGTCGGCCGGTACGAGGAGATGCGGAGCAGGTGGCGGCCGGGGCTCGGCGA
CGAGCGGTGGCCGCTCGTGACGCACTTCGTCGGGTGCAAGCCGTGCGGGGAGCCGGGCGC
GACCTATGATGCCGTGGCGTGCCGGGAGGGCATGGAGCGCGCGCTCAACTTCGCCGACGA
CCAGATACTCGGCCTCTACGGGTTCCAGCACGAGTCGCTCGGAACCATGGCCGTGCGGCG
CGTCAGGAACGACACCGGACGGCCGCTGGACGCCGGCGACGAGGAGATCGGCTTGCTCCT
GCACCCAGAGATCAGGGCCGCCGCCAACCAATTGTGATCAACTAGCTAGATCCTCCGGTT
GCTTTGGGTGTCAACGTGCAGTGCGGACATACATCGGAGAACGCAGCACTTCCTATTTTA
CACACAAGAATTTCTCTGTGACTTGGGGAGCATCTATGGCTCATGCTCTTCTTTTTTATT
TTCGTTTCAATCGCTTTTCACCTGAACAGTATGATTTACATCCAACGATCAACTAGATCA
TCATCATGATGTATATATATGTGCTTTGCATTAACACGCATATTTGAATTCACTCATGTA
CAACAAAATTATAAAAATAAATAGAGGGGACAAGGAGTGAATTAAGACCCAAATTTTATT
CTATTATATTTACCAACCATCATGCTAAATCATTTAATTAGAATCAAAACATAAATTGCA
TTGGTCGTATGAAATTTCTATAACATTATACACCATGCACTTTAAGATGTGGAATTAAGA
TCGAGACAACAACCTAGTTAAGAAAAAAATGTTGTAGATCAAAGTATTAGATGGAAATTA
ACATGCATTTAACAACATAATAATAAATCATTCGAAATGATAAACTAAACAGTTAAAGCA
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TTGAACTTATTTATAAATTATAATATACTTTCTTCGTCCGAAAATACTTGTCGTAAAAAT
GGATGTATCTAGATGTATTTTAATTTTAGATATATCTATTTTTACGACAAGTAATTTTAG
ACGGATCGTGTATGAGAATAAACATATACTCTCCAACATCTAGGAACACTATATGGGTAT
AAAATTTTCACTAGTGTGTACACTATATGCATTTTGGACGGTGGGAGTAGTAGTGAAAAT
TTTGCCTTCTAGTACAATGTACACTAGTGTACACTCACACCATCCAACAATTCACATAGT
GAAAAATAAAAACCGGCTCAAAACAAGAAAGAAAAAAAAGCTGTCGTGTAATCATCATGC
ACCTGAAATTATTTATAATGCTAATTGATTTTCTTTTCAGCGCTGGCCGTTGCCAATTCC
TGTCAACCGGTTCCATACTAGGTGAATGTGGAAGTGTATGACATCCTAAAGGTCAACAAT
TAGGTAGGGACATATCATACCATATATGATAGTGGAGTTTTCGTAAAACCGAAGTTTTTT
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CACACGCGTGGGCGTTGCATCTCGTCCACACCCACGGATCGGTGTCCGTTTGTGGTTGCA
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ATCCGGTCGTCCACATGTTCGTTTCACGCACGTAGAGGGGCTGGTGTATGGGCGTTTATC
AGTTCGCCCTCACGCCTGTTTTCATGCACGCAGATGAGCTGATGTGTATGCATTTATCAG
TTCGTCCACACATTTGTTTTCATGCACGCAGATGAGTTGGTGTGTGGGCATTTATCAGTT
CGCCCACACGCCTGTTTCACGTCCACATGCCCGCACGATCGCCACGCGTCTCCTCTCCCA
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TGTTTGCTGTGGCAACTGCCTAATGTGCTTAGAAGCATATGACAAATTCAAGATATTAGT
TTTGCCTTGTCTTTCAAGTGTTATATGACAACTGCCTAGTGTTAGTAGGTGGCACTCTTA
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AACTGTAGTTCAGCAACCATGGCAACTTAGTTAAACAAACATGAAAGAGGGGCCGGACAG
GTTCGGAGGTGAGGGCGCGTACTGACTGTCACGCAGGCGTGCGGGATCGTGGGGTAAGAG
ACCGGACATGTCGGCGTGTGGGTGTTACCTGTTTGCCGTCTGGGCGAGACCGCGAGACAT
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TTAGATATTATACGAGACGTGTGACAAAATCCCTTAACGCGTACACGTATGAACGTTATG
GCGACCCAAAATTAAACGTGCACACAAAATATATAAAACTTGCGATGATCCATAATATGC
AAAAACAATCATGTAATGGGGCCTCTACATCTATTTATACGAGAAAATAGGGGATGGGTT
TGACGTACAAGAAACAATTTATACATGCCACAAAATATATACTCAACAGGCACGTTCGGT
CTGGAGGTACTGGGGCCAAGGAGGTTAATTGACGAGCCGGTAAAGGTTGATTGATCAGGC
TCCATGATCATTGAGTTCTTGCTATGTGACCCAGCAATCCAAGGGGCATATATGGATCCG
ATCCAATTTCCAGAGATTGTGGCAGGTACCTGATGATGGTACTTATGGTGGCAGAGGCGA
TGCATTGCTGGAGCAGAGGGAGAATGTCCTAACACCAGTACGTACAGGGCCAGGAATTCA
GGCTTTGGTGGTGAACTTCATCAGGGCTGCAGGCAAACCGACAACATCCTCACGCCTAAA
TCAGTGGAGAATGGCGATGTTGGGCCAAACTATTCTAAACGTTGATGCTTCTTTTTCCGA
AGCTGAATTTACAGGGTCTTGCGACGCGGTGATCCGGGATCATAGTATGAAGGCTTGAAG
CTAGTCAATCGTTTGGGATGCAGCAAGCCAGCAATGTCCTCATACGCATGGATAATATCA
CAGTGGTTCAAGCTCTTAATCAAGACGAAGTGGTTGCATACCCTGTTCTTGAAGACTGTC
GTCGAGAAGGCTCTTAATCAAGACGAAGTGGTTGCAGACTCTATTCTTGAAGCTCTAATG
TACTGAAGTTTATGGTTATGTTTCTTACAGACAACGTCGCTGCTTGTATTTGAGTTTACT
AGCAAAATGGCCCGTGCGTTGCCACGGAAGAAAAAAAACATAATCTTCAATGATGGTGAC
CACATTATGTTCACATATCATCGATTGATTTAGAAATTTTGTGCATAAACGCAAGAATAT
GTTTCTTTTTTTAAATTTATTCACAAGTTGAAGCAATCTTTACATTTTCAAA