| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
 |
No map location |  |
Predicted Genes from contig_43090
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_58897 |
1 |
370 bp |
AK354769 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_58897
Contig Sequence (5993 bp)
>contig_43090 5993 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCGGAGCAGGCCGGCGGCGAGCGCCACCTCCCGCTGGAGCGCCGCCTGCACGGAGGAGA
ACACGATGCTCTCCAGCTGCGGGCACGTCGCCGAGTGGAAGCCGGCGCCGTCCAGAGGGG
CGGACAGGGCAGGGGAGACTAGCACTGCGACGGTCAGATAGACCAGAACCAGTGTACTAC
GGCTGCCCGTAGTCGCCATCGTTGATGTGGTGTGCTTTGCGCACTGTGGAGTAAGCTAGC
TAGCTAAGGCTAAGCTAAGCGTGTGGCTTGCTCAAGTCAAGCGAAATGGCCGCTATTTAT
AAGCTAAAGGGAAGGAAACGGGAAGCGAAATGCCTTCCTTGTTTAAGATGGCTCTGCCCT
TGTATTTTGAAGATTCAAGTTTGTTCTACACTTGCGGACAACTTATATATGACAATACAT
ACGGTGTTGTAATGTAGGGTTATACTTGTAATTCGTCACCCTGAATGAGGAATAGTTATT
CTTCACCCCCTTTATTTTTAATATCAATGCACCGTAATTTTACATTTCATAAAATTTGTC
TTATTTTATATGTAAAAAGAGACCTAAAAAAATATAATCAACGTAAAAATATTTTATGTC
TCGTAAAATTACGAACAAACAAAAATAGTGCAAAAAATATAAGAAATTCATTTTTTTTCT
AGTCTTGTGACCTATGTTTTTGTTTTTCTTTTGTCAAATTTTACGTTGTGCATCAATATA
AATGTAACTATTTGTATTTTAAAAGTAATTTTTTGTAAATTGATCGTAAAATTATCTTGG
ATGAAGAATAAACTATTCTACACCCTGAATGATGAATAAAGTTTCTATATATATATATAG
AGAGAGAGAGAAATGACTAGGTATATATATACTTGACCGTTTGATATATCTTACACCTAA
GAGAATCTCAAGCCACGATGCACAAATCTTGCTCCCGAGAGCATCTGCAATCACGATGCA
CAAATCTCGCTCCTCAAACATCCGTCGACGCGTCCGGACAATGTCTAGGTATATTCATTT
TAGTCTTTATTTTTTGATGCACATAATCATGCCTCTCATTGTTTTTCTATATGTCCGGTC
ATATGCATATGATTGATAAAAAAAAGAGAAGGAGAAAATAAAAAAGAAAAGAAAATATGA
TTCATGGTGGGCCAAATCTTATGGGCACACCATATGATCACACTCGTGCATATTTTTATC
CTCCCCATATATGCCTTCGATATGAGGATTTGCAAACAATTTGGACATATGAAGACAAAG
TGTGGGTTCGAGTTGGGTGTCTCGTTTCCATCTTTCTTCTATCCCGGCAATGATCAGGAT
GTCCGCTAATATTTTTAAGTTTGGAGGAGGATATGAGTGCTCCGATTGTAGATGCTCTAA
CACGTAAAATTGGGGGGGAGGGGAGGGGCGTGATTTTACTTCCACAACACCTAAGGATGC
ACACAACCTTTTAACTATGAGTACTACGGTTTTTAAACTTGGTTATGCGCCAAGCCTAGT
CCGCAAGAATAAATGAATGAGTACCAGAAAATCCTGGTCCTCAAGTATAAACATGAACCT
GAATTGTCCTTCACGAGGATTTGGACTCAAGTATTGTGTTTGTACATCCACTACCTCAAC
TAGTTGAGCTAGGCTAGACACCTGCTCACTCTGAGGAGGGGCCACTCGGCCGAAACCATA
GCGCAACCGCCACCCCTCCCCTCTCTGACCTTGCTCCCCCCTCCCCCGCTGCCGTCTGAA
GGATGATTCCGGTCAAAGGCCACGAGGCTGACGGTGACGGTGGGTCCTCATCATCCTCGT
GTGACTGATGGCGATGGGTGGAGGGCCCATCATTTCTCGCATTGCGGGATCTCCGACCGG
AGCTTCATTACGGCCTTGGACGGCGTGTTTCGTCCGAAGGAGATGGGAGCCGGGCGACAG
GCCTGGATTTCTTTGGTGACCTCGATTGACGCTGTGGCCGCGAGGGCTGCACGACGTCTG
GTTCCGGGGCCCTGGTGCGGCTCAGCTACTCACCTCCAAATGGTGCGAGTGGTGGTGGCG
GTGCCCACTGATATCTCTGGCCTGCCGTAGGGAACCGGTGGATGGCGCGGTCCTTGGGTT
CTCTTTGCTCTAAGATCATGTTCTGCCGGTTGCCGGCCCTCATGGATCTGGCCGTTGGCG
AGTTTGGAAATGCTCCACTGGAGATATTCATTGGGTGCTTGATTCCTGTAGATTGCTTGA
TCGGATGGGATTCGGCCGTGTGCGTCCCTATTTCAGCCTGAGTGTCTCGTTAGGTTGTGA
CGTGAAGCTTCAGTATTTGTTGACATTATGGGACAGATCGGTATTTCGATTTCCATGGTG
AAGACAGTGGCAGAGAACGTCATGGCGACTCCTGTTTGATGCCGTGTAATGACGGATCGA
CTCTACGTGACGATGAGTACTTCACTTGGTGATCCGTGTCTCATAGCAATAACATCGACA
AGTGGGGGTGAAAGCACAGGCGGAGACAGAGTCTTAGCTTTTAGAGTGAAAACCCAAGGC
CTGACCTGTATTGGTTATGCCTCGTGGTGACTTTGTGAAGGCATTGTTTTGAGAGCGCAG
ATCTTCTTTAGGGTGAAGAGCTACGATCTAGGATCACGCGACGACGATGCTTGTGCACTG
TTTTCTTTTTGGAGGCATTGCTTTTGGGGGAATTTAGACTTTGGGTGTTGTCTAGGTGGT
GGCTCATGGTGCAGTTACGAGGAATTGTTCACTTTAGAGGGGATTTTTTTTGTATTTTTG
TTAGTTGCATCCGTTATGTCTTCACGACATTGTGTTGTTGCATAGACTGAGTGTAATCAG
TATCTTTGTGATATTAATATATTTTACTTGTCTAAAAAATGCTCTAGCATGTCAATATAT
TCGTTGTGGTAATCTTGATTGGCACGTGTCTTCCAACAAGGGTGCTAAATAATTAAAAAA
AGTTGCTAAAGTCCTTTCTTCATTGATAATATTTTTCACTCTTTACTGAAATTTCATGAG
GTACAATAGTTTTTGTCCCAAACCGTACGACGGGGTCTTGGAGGTGATGGAGACAATCAT
GTGTTATATGACTTTCAAGAGTAGCAATGATTTGTGGCGTGGCAACAGTGGAGGATTTCA
TCTTAGTGGTACTCGTCGGGGTGTCGAGTCGTGACTTTCAGGGTGAAAACCTAAGGTCTG
GCCTTCATTGGTTGTGCCTGGTGATTACCTTGTTGAAGGAACTGTTTTGAGAGCGCGAGC
TCTCTCCTGGGTGAAAACCTAAGATCTTTGATTTGGCAACGTCGACGTGTGTGCACCGCT
CCCTTCTTGAAGGAGTTGCTTTTGGAGAATTGTTATGTTTCCTGGATGTTGTATTTGGTG
GTGGTATGAGTGCTGCTCTTGAGCTGTTCCTGCCCTAGTCCAGCCGGAATGGTTGATGCA
CCAAAGGGATTACAATGTGCTCCTTGAGTTGNNNNNNNNNNNAGGAAGAAGGAGCTGTCG
GCTCGCGTCTACCTCTCTTGTATGGGTGTGTGTCTGAGTAGTTGACCGACCCTCTGCATG
GAGGGGGTCGGAGGGTTTTATAGACTAACCCACCAACTTACAATAAGGATAAAAGTACAA
AGGAGGGACCCGCCTGGCAGCCTCGCCGGCTGGTGAGGGGGTCCACAGTGGTCTTGTCTT
GTCGTTGGTGGGGCCCGCCAGCTGCAATTGTCCCATCTGGCAATGGGACCCTCCGACCAG
CCAATGGAGCTCTCGCGCGAGGCCGACGCAGGACACGTGTAGTACATCCAGCGTTGTCTT
GCGAGATTCGTCATGGGTCGCCAGTACGGCCGTCTCCACTGTTACCACGCCAAGCTCGGC
AATGGAGTGGATGCTGACGGACTGGTACTGTGCGGGTTTGACATATCGGAGCCGGAGTAG
GGCCGCTGACACTGTATCTGCCGCGCGCTCCAACCTTGTACCTGTGCTGACGCGTATTCA
CCTTTAATCGTAGAGTTCTGTCATAGCCTGGGATCTGATGTGACTAGAGCTCCCTGGTTG
GCTTGCCGCCTCGCTAGCCAGCCTAGGAACGGCCGTCTCGCTCCTAGCCGACAGTCGCTT
CCGAGACGGTCAGAGGGAGGTAGCTGTCTCGCTCCTATCCGGCACGCGATTCCCAGCCGG
CTAGGAGGAGCTCGCTGCCTCGCCCCTAGCCGGCAGGGGCTTTCTAGCCGGCCAGGAGGA
TTTGGCAGTATGGAGAGAGTTGCAGTTTTCCTTTACTCTTGAATGCAAATGAGTAGGCTC
GATGAGCCTATTCCGGAGTTATCCCCCCGTCACTAACCTATCAACAGTGGCGGGAAATCT
CCCATGGTCACCTGCTGGGCGTCTACTCCAGGAAAGCCTGCCACTAAGGGTCTTTTTACG
TCCTCCACTACCAGGCATTCATACATTAGTGTGTCATAGCCGGCTGCCGAGACTATTGGC
TAACATGAGGAAGACATGTCATGGGAGAAGAGCGCGGTGGTGGCCGGAGATCTTTTAGAC
TAGGTTAGATTAGCCTAGTCCACTACAGTCTAATTGAAATATATAAAAAATGTAATGAAT
TTGCTCCTATTTAGATGACAATTATCCGATTTTATGTAAAAATTATCTTAGTTTAAATGA
AAGTTTTCAATTTTGTTTAAATTTGCATCAGATGTGATCCAACATTTGCCGCTAGTTTTG
GATGGCGGACTCCTGTATGAGTGTCCGTAGACTGGTCCCCTCACGTTCATGGATGGACAC
ACTATCAACGTTGGAGATGCCCTAATAGTGTTAGTCTTTGGATAGGTTGTGATTAAGTAC
TTGTGTGTATAATTAGCTTATTATTGGGAAAGTCACCTTTTCGGCAAGAGATCAAATGAG
CTCGGGTGAATAGTAAAATAAAAAATAATTGAAGAAAGATTCAACAAAATCTGATAATTT
TTGTGACAAGCATTGAAAAATGTTCCAAGAGCTTGAAAATTTTCATGATGAAATCAAAGT
TGTGGAAGTCGTGGCCAAAAAAAAAAATCAATGCTCCAAAATGCTTTGAAAAGTAGTACT
TGTAGAGCATCGAGTTTTTTTTTCACGCGTTAGAGAAATGTGATTCCATGATGAAATTTT
ACGAGCTCTTAAAACATTTGTCAATATTTATCATAAAAAATTCAAATCCTTTTGAATTGT
TTTCATTTTTTTATTTTAATATTCATCCGGGTTAATTTGAGCTTGGGCTGAGAAACTCCA
AATCCTTGTGATCATTAGTTTATAATTACTTGACTACACTATGTACATTTCTTGTTTTCT
GGAACTGCAAATAGGTGCATATGCCAGGCAGCTTCTCAAGAAACAATTGCAATTCTCCTA
ATAAATAAATAAATAACCTAAACTAAATCACCATTCCTTTCCCTTTGCAAAAAAGTAGAA
AGCGGGGATGCAGCAGAGTGTTGTCACGGGCGAACAAACAAGTGGTTCGATTGTTAAGAG
AAAAACAATATACCCAGCTCACTGGGTTCAAGTTGACCGATGCTTGTATTTTTGTAAATT
TATTTTGAACATTTTTATGATGTGCATTCAGTGAAATGAGAAATTTTTATTGACTTTAAA
GGTATCAAAGACGACTTCGTCTATTCTAAAATGATGTGTTGATTTAGTCTATTAGAAATT
CTCACCGAGATAGTATGTACATGTGTTGATAAAGATGGGTGTATATACATATGTACCATC
GTTTAGGTCTGTATTGTATTAAAAAAATGTTTGGCTAATCTCTGGCACTTTGGACAAAAA
CTACCAGTGTGGAGCTATACTACTAGGGTGTTTGGTTGGGCTTCCAGCCAGCTTCCGTCT
ACCGGCTTCTTAGCCAAAAGCTTCTATTTAGAAGCTTTCGGTTGCAGGTGTGGCTTTTGA
CCTTGTCACAGCCGCAGCCGAAAGCCACAGATGCAGCTGGAAGCCCCTAAATAAGAGCTT
TTGGCTTCGAAGCCGGAAGCCGGAAGCTGGCTGCAAGCACAACCAACACACCC