Map Locations of contig_43076 (8914 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_43076

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_58879 2 2433 bp MLOC_58879.2 Available Available None
MLOC_58880 1 741 bp None Available Available None
MLOC_58881 1 224 bp AK355574 Available Available None
MLOC_58882 1 203 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_58879






CDS Structure of MLOC_58880






CDS Structure of MLOC_58881






CDS Structure of MLOC_58882






Contig Sequence (8914 bp)

>contig_43076 8914 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAAGTGACCAAAAGTTGAATTAGTAGGATCGTNNTCCTACTAATTCAACTTTTGATCACT
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TTAACATATACTATATTCCGACACTTCTCCAGTCCAAAATTAATTGATTCTGCATACCTG
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AGGAATTTGAATTTGAATTTGAAAAATAGAATAAATTATTTTGCAGCAGCATGTGAGTTT
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CATACGGACATACTCATCAACGAGATCACCGGGCACGCCGTATGCTAGCATCTCAATGGT
GCAGGGCATTTCTGAAAAGATGAGAAGCCAATCTTTCCAAGGGCGTCCCCTTTGCACTCG
AAATAGTTATCGTATCCGATCACCCCCTCTTTAATACGGTTGAAAACATGCCTAGCCATA
CGAAAACGCCGCCGGAATTTCTGATGTTTGAACAACGGATTGGTTGTGTCAAAGTAGTGC
TTCCAAAGAAGGAAATTATCGCTCTCTCAATCAATGGAACAATGGCAGCTGGCTATTAAG
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CGTCCGTTTGGGTCGGCGCGTTGGGTCGACTTTTCTGTCTGCCACGACCCAACCGGACAA
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CTTTGATGTGTAGGAATGTAAAAGGATATGATTTGTAAAGGAAAAATTCCTGTGGATCTC
TTTGGTTTGTAGGAATGGATTCCTATTCATATGTAGGATAGGAATCTATTCCTATTCCTA
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GGGAATTGAGATGCATGTCATCTCACTTCCTGTGTTTTTTCTATTCCTATGAAATTTCTA
TCCTATAAATCAAAGGAGGCCTAAATGTTGGTGTTGCTGCCGCTGCCTGATCGATCGATC
GCACTGGACACGATCACACCATACCTGACCCGATGGTTGAGACGCACCGCAACGCCTTCT
CATCCCTGTACCACCGCTGCAGCACGAGATGCCCCTCGCCGCCTTAGCCCGACATGCTAT
CGTCGAGGGCGTGAGTCCTTTCCCGACCGTCAACGAGTTTGTCATCCTCCACCGAAAGAA
TGTCGAGCACAGCATGACCAATAGCGACATTGTGTGCCGCCTCATGCTGCTCGGTGACAA
GTGGACTCATCGCTAACGAGATACCCGTTTCTGCCTTGACGAGCAGACGACCTCGAAGGA
GAGTGCGCCCAAGCAGCTCGTAGTCATGCTACCAAATAGCATCTTCGTTCATTTGAATGA
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GGTACAAATGTCTAAATTAGGGGTATAAATTGAGAATTGACTCAAAAAGGTAACTTGTCA
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TATGTTTAGATGGTTGTTACCATTTTTTCGATAAGAGTTTTCCAACTACTTACTAGGAGG
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TCTTCCTCCTCTCTTTTTTTCTTTGCAATAAACGACCTTGTATTATTCAATCATAGGTTC
ATTCCAATCTTGCTTCGCAATCTCTAAGACTTCAGGGGACCTGAGCCAAGCCAAGTCATG
GTCATGTTCTCAACTCTAGCATAATTTGCCAACCTATCTCTAGCATTATTTTGAGAACCC
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TAGCCGTGTCAAATTCACAACGGTGACTCCAAGACACAAAATCTACAAATAGGATGCGGA
AGATGGACTGGATGGCTGCCATTTTTGTAAACATCTATATTTTGACCAGTTCGTAGGCGA
ACTTTTCATCGCTGCCCTCTTCAATGACAATACCGAAGCAATGACTGAGTCATGTACTAA
CATGTACACAGTACTAGCTAACACCTACAATCCTCCTCATAGTGTAATTTGTGCATTTCT
TTTTTATTTGGAATGAATCAGTTATTTCAAACTCTTAGCTGATGGTATTTCCTTTTGACG
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GTGCTAGTTGTTAATCAAAGAAAAGCTACCATAATACCTTGTATTAGTGATTTTGGGATC
CGTCAAATCTCTAAGGGCAATGTACAATGATTGATAAGATAGTTTTATCTTAAATCTTGC
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CTATAATTAGTTATACCTAAAAATATGGTGAGACATATTGTGCTTAAGAGAAGACAAAGA
CTTTTTTTCAAGTTCTCTCTCCTCCACCTCATCATTTATCCTATGTGGCACTCCTAAAAT
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CTTATTTTTCTTTTCTACTCCCTCCGTTTCTAAATNNNAGTCTTTTAAGAGATTTCATTA
AGGGTCTACATATGAAACAAAATGAATGAATCTANNNNNNNNNNNNNNNNTATATACATC
TGTATGTGGTCCACTAGTGAAACCTCTTTAAAGA