Map Locations of contig_43054 (10578 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_43054

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_58851 2 2870 bp MLOC_58851.1 Available Available LOC_Os09g29190.1, FRAME:-3, EVALUE:0.0, 13109.m02891 protein phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase, chloroplast precursor, putative, expressed
MLOC_58935 2 2167 bp MLOC_58935.2 Available Available LOC_Os05g27304.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13105.m02805 protein peptide transporter PTR2, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_58851






CDS Structure of MLOC_58935






Contig Sequence (10578 bp)

>contig_43054 10578 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGGCAGGTGTTGTTACTTGATAACGGTATCACGTCATTAGGAGAATNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNAAACTATGAACGTAGCATAAGATCGTGTCAGGTGATGAAGACAGAGTGGGATAGA
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GCCCAGAACCTCGCCTGAGCCCGGTCGTGGGGGTCGGCCGGCATGATGGGGTAGCCGTCC
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GGCGAGGAGGGAAGGGGCCGCGCCGCCCCCGCCGGCCGCGGCGAGAGGCGTGGCGCGGGG
ACGAGACGGGGTCGACATGGAGAGGCGGGGGGAGCGACTGGAGGACGGTGGGAGGGCCGG
GAGGAGAGCTTTGGGCGGGCTCGCGAGGCGGAGGGCGGCCGGCGGCGCGGAGGGAGACAT
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CGTGGCGGCTGTGCGGCGCGGGGTTTGGGCGAGCGGACAGCGGCGGAGTGCGATGGGTCT
GAACAGGACCTGATTCTTTTCGAGACTGCCGGTTGATTGGATTGGGCCGGTAGCACTGTT
TTGCTTTCACCTTGTTAGAATTTCAGTAGAGTTTCAACTTTTAAGATATTATATTATTAC
TACTTGATGAGTATTTGAATAGAGAGGGGATAAATGGCTTTCCCGACGTGCTTCATTTGG
ATATTGGATGCATTTGAAAATTTATTTGGGTTTCAGAATATCCAAACAAACGGTTTCCAA
TTCAAACATGAAAGGAGATAAGGTGACTTCTTCGAAATAAAACGGTTGGAAATGTTTTTT
TTTTGAGTAACCACATATTTCATTAATCGAAAAACAAGTTATAATAAGCAACACACGTGA
AAACTAAAAGATAAACCGGGATAAAATGATTATCCTGAATTTGCAGATAAGATCCTAAAA
GATCGAGAAATACAAAACGATCCCTAGGGTTTTCTGCAACCACCGTAGCGAACGGCCGCC
GCCCAACTCCAGCGCCGC