| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_42961
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_58753 |
2 |
1827 bp |
MLOC_58753.1 |
Available |
Available |
LOC_Os09g20284.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13109.m01920 protein amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed |
CDS Structure of MLOC_58753
Contig Sequence (6928 bp)
>contig_42961 6928 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATTAAACGAATTTGACCAAAAAATTAAGGGGTTAAGTTGGGGATTAGTTCGAAACGACAT
ATTTTTAGAGGAGCAAATATACTTGTCTAACGGATACTCAGCCGGCCGTGCCCTCTTCTA
AATGTATAGGGAATCGGTTGGAGATGCTTGCACAATTGGTTAAACCATTTGTGATATGGT
CACACAACAAAGAGTAGTCTACCATATTAAACCCTCAATGTTCATATTAATCGATCTATG
TGGGCGCATAAGATGAGGTAGCTTATTCCAACGCATCCCACGGGAGTAGCTAGAGTACAA
TATTAACGACAGAAGGAAAAAAAAAAAGAATGGTAAAGTACTACTGTAGAATATTAACGA
CAGAATCAAAAGGACCCGCTCCCGTCGCTTCTGCACCGTGACTTTATATACACTTCCCGA
TGGAGCAGTATCGTTCAACACAAGCCTGTGAGGGACAGAGATGAAGCCCTCGACAGCCAT
AGTCCTGGTGCTCGGTGTGGTGGCACAATATGTCGCCCTGGCCACCGCGGCCGGTCCCAA
GGTCATCATCGTCGGCGCCGGCATGTCAGGTAAACTGTGCACTATACTATACTAGAGATA
TACTAGACACATACCATGGTGCAGGAAGTTTGTTTGAGTGCACGGCATAACACGGATGCA
AGTCCTTGTGCTGTATATACAGGGATCTCGGCCGGGAAGAGGCTGTCGGAGGCCGGGATC
ACGGACCTGGTGATCCTGGAGGCGACGGACCGCATCGGCGGGCGCATCCACAAGGAAAAG
TTCGCCGGGGTGAACGTGGAGATGGGGGCCAACTGGGTGGAAGGGGTGAACGGCGACGAG
ATGAACCCCATCTGGACCATGGCCAACGGCACCGGCGGCCTCAACCTCAGGACCTTCCGC
TCCGACTTCGACCACCTCGCCGGCAACACCTACAAGCAGGAGTACGTACGCCTGCATGCA
TGCCCGTACGTCGTGCCGTCGTTTCACAGGTAGCTGAGCTGATTGCTTCGATTCTTGTCT
TGCGTGGACGCGCAGCGGTGGCCTCTACGACGAGAAGGTTGTTGAGAAGATAATCGAGAG
GATGGAAGAGGTGGAGGAGAGCGGGAGCAAGCTCTCCGGCACCTTGCACGCCAGCGGCCA
GCAGGACATGTCTGTCATGGCCATGCAGCGCCTCAATGACCAGTACGTATATACGCACTT
CATGTTCCTCCTTGTCGTCAGTAGAGTGCTAGCTCCGAAGTGGGAGATTCGTTAATGCAA
GACATCAACACATATAGCTGTTGGATCCAGCCCACCCGATGGATCTGATGCTGTGATGTC
AAGAAAAATATTACCCCTGCTTGATCATGAGCATAGGGAAAAATACATACTCACTCCGAT
CCATATGAATTGCCGTAGATTTAATACAAGCGACAATTAACATGGATCGGAGTGAGTAGG
AATTTTCACCAGAGATTCGAATTGATGGAAACTACCTACAAATTATGCAAATGAATACTA
GGGAATGTTCCTATGAATTGCAATCTTCTCGTCAAACAACCCATGTGAAATTTTTCCATA
GAATTAGAATCATCCATCTTTTGACAATTCTTTGAATCAAATAGGCCCTAAATTGGACCT
GGGGATTGAATATCTTTTTTATGGCAACGCGGATTCAAAGTTTTATTTGCGCCTAATAGT
AAGTTGATAGCTCATGCCTAACCTTTTCTCTTGCCCCCTATATACATGTCTCCACCAAAC
CATGGATAAGTCTTAGCACATATATAATTCAAAAAAAAAGTCGTATCACATATCTATTCT
TGTACTGATGCATTCCCAATTATTATACGGTTCGCAATAAACCTTCAAATTAGTAAATTT
AGCAAGTGACAACAACTCCCCTTGTCCAACAGCCGCATTTGCTACATGAAAGTTTTATAA
AATGCCATGAGTTTTTGGTAAAGAAAATACTATTTTCTTTAAAAAAAAAGGTGAATCACC
AGTTAGCCCCCCTTTATATAATTTCGTACGTGGATTGTTAGCACGTCTAGCCCCCTTCAT
AATATGTTTTAATTAGAACTATAAAATAAATTACATTGGTCATACAAATATTTAGAAACT
ATTCTTTATGAAGTCCAATGCACTTGTCCATCACAACTCCTACGATCGTCCTATTGGTAC
ATTTACAATGTACCGCAATCCAAAGAGGCCCCTAGCTTCCTATAGAAAAGGTGATTAGAT
TACTGAAGTGTGATAACACTAACTATTTTACTTCACTCCCATCGATCTAAAGCTATCTTA
GCCACGTATTCCCGGGGAAACATAGAGCTTCTTCACAGAGTACACAAAATAACGTCTTGG
ACCAAGTGCTGAATTGTTTAAGAGAAACGATTCCTCCCACCGACCGATCCATCGATCGGA
TCGTCTGGGTACGCACGCATGCACGCGCTCTTCGCGGCTCTCTGTCAGCTTTCGGTTTTA
TAATAAGAGCATCTTCAACAGTCTGTATGTTTAATCGTTGTTATAAATGTCCATGTCAGC
AGCCAGCATCATATCATACAAGCTCTTCAATGGAGTGTATGTTAACCGTATGTAAAATAG
CCAAGCGGGTCTACTAGATATTGAAGAAATGACCATGCTTGTCTCGGAGCTTGTGCTTCA
TACGATTCCATTCTCTCTCTTTTTGTTTTATGTGTGATGTCATCAAAATTGTCTATATGA
CAATTTTAACAACGATGATTATATGACTATTGGAGATGCCCTAAGGCTGGTAGTATGGTT
GTATCATGCATGTCAATTACTCCCTTCGTCATGGTATAGAATGTGTGCTTAAAATTCTCA
TGACCTGGATGGTTATTGATTGGCTATGAGATGGGTTGAAAAATAGCATTCATACTATGC
ATGCATATAGAAGTAGTACAACCGAGTACTAATTAACTGTTAGGAGTAAATGCAATGCGT
CTTAAACCTTGTCTATTGTGGAAATGCACGTAAATTTAACTGTGTCTTCCAAACTGTGAC
AGAGGTAGTGGACAATTTTGACAAGACGACATAGAATTGAATAAAGAAAAAAAGTTTAGT
ATCATATCATGATGCCATATTATATTAAATGATGTATTATTACGTGTCATGTATGATAAT
AAATGAATTACCCTATAATACTAACATATAATACTACTCCCTCCGTCCCTGCACCATGAC
AAAGATGGAGAGGAAAACGAAAGAAATAAATGCTAATTTGCTAATTAATACCATTACATG
CAATGAATTGATCACTGCATGTCATGCTAGTTGGTCTTAAATCGTTAAAAACATACACGT
CACAGTCTCTTATTGATTGATTCATTTATTCATGTCAAAAAATACGAAACGAGGAAAAAA
TTAATGCATGGCGCCTAAGTGTTTTCGGTTTATTTGATTTTCGTAAGATGACTTATACAC
CGAAACGAAGAGAGTATATATTATGAATGTAGTAGCATACACTAATAACATGTGCATGAT
ACTAATATATGACACCCTTCATTACAACCAACCTAAGCTTTGAAAAATCTAAATCTAACG
ATGTTTTGATACACGGCACCTAAAGCGTCGCCCACGGTTCAAACCACAAGCGTTGACAGC
TTTAATTACCATGTGCCTCTTGCCGTAACATCAAGCAACAGCCACTTCGCAAGCAATCTT
TCCTATTTGTAGAAACAAAACAATAAATCATGGTAATTACTTACAATATGTTCTTGCTGC
CGATACAAAGTACCAACATTATCTGATGACATGTATTATACTTCCTCCGTCTTAAAATAA
ATGATTCAAAAGTAGCTCAACTTTGTACTAAAATAGTACAAAACTAAATTATTTTTAAGT
CACTTATTTTGAGACGAATGGAGTATATGCTATGGACTGAGTCCGATAAAAGATAACGGA
ATTCTTACATACTATTCTGTTGTTGTACCCATTTTATGCAGTTTATATTTGTTTCCCTGT
TCATTTAATATGTGCGATATATGCTCCCTCTGCAGTATGCCTTCGGGGCCCGCGACACCA
GTTGACATGGTAATCGACTACTACCAGCACGACTTCGAGTTCGCCGAGCCGCCGCGCGTG
ACGAGCCTGCAGAACACACAACCACTGCCAACGTTCAACAACTTCGGCGATGACGTTTAC
TTCGTGGCGGACCAGCGGGGTTACGAGTCCGTGGTGTACCATGTCGCGGGGCAGTACCTC
AAGACCGACCGCAAGTCCGGCGCCATCACCGACCCAAGGCTCAAGCTAAACACGGTGGTG
CGGGAGATCACCTACTTCCCCAGCGGCGTCGCGGTGAGGACCGAGGACAACAAGGTGTAC
CGGGCCGACTATGTCGTGGTCTCCGCCAGCCTCGGCGTCCTCCAGACCGACCTCATACGG
TTCAAGCCGCAGCTGCCGTCGTGGAAGATCGTGTCCATCTACCAGTTCGACATGGCCGTG
TACACCAAGATCTTCCTCAAGTTCCCCAAGAGGTTCTGGCCGGAGGGGCCCGGCAAGGAG
TTCTTCCTCTACGCTAGTGGTAGGAGAGGGTACTTCCCGGTGTGGCAGCAGTTCGAGAAG
CAGTACCCTGGGTCAAATGTGCTGCTGGTCACGGTCACCGACGACGAGTCGAGGAGGATC
GAGCAGCAGTCCGACAACCAGACCATGGCGGAGGCGGTGGCGGTGCTCAGGAAGATGTTT
CCTGGGAAGGAGGTGCCGGACGCCACGGAGATCCTCGTGCCGAGGTGGTGGTCTAACAGG
TTCTTCAAGGGCACCTTCTCCAACTGGCCCATTGGCGTCAACCGCTACGAATACGACCTC
ATCCGGGTAAAAATATCTACTACATTTGTCTTGCATTTGAGTCCTTCTCCGCTATCTGAT
TTTGTTCTTTGATTTAAATTAGGCTCCCGTTGGGAGAGTTTACTTCACCGGGGAGCACAC
GAGCGAGAAGTACAACGGATATGTCCATGGAGCGTATCTTGCAGGTACATAAAAACTAGT
TCTGCCTCTCTTTTTTAGATTCTCAGGCTCTGCATTGTTAAGAGCTTTTTAACTTCCCCT
TTTCCGTATCCTAAGGTATTCACATGTGATCTGACGCTGTTTTCTAGGTATTGACTCTGC
TGACATTTTGATCAACTGTGCCAAGAAGAAAATGTGCAAATACAATGTCAAGGGAAAGCA
TGACTAACCCAAAGGTAACTATACAAGTATTTCATACTAGTACTGCTAGCATTTAACCGA
TAAAAGTTGTTTCTAACTGTTGCTCCCCTCATATGGTATTCCGATCTTATCTTAATAATT
TTTTCCAGTTGCCTAATAATGGTATCATATTTCCCCCCGTGTTGCAGGTTATTAACCACA
ACAACAGAAACACCAGAAGTTGTGGGTCAATAAAACCGAGTTTGGGCGCAAGCATTATTC
CGGTGTTATGATTGTTTGGTCATTCTTCAACGGCTTCTTCGGATACCCATTTCACAAAAA
AGAAAATAACTCTTCACATGTGAATTGTGATTAAGCAAGCTACCAACTGGTTAATAAAGT
TGTACATTGTCGATGGCTGCTTTTTTTAACTCAATGCATTGCATTAAACAGTGTGCGAAG
TCAAATCGCTCGCCACGAGGACAAATACACACGGATCACATCCGTCAAATACATAGTCAG
GCCATAAGCGTTCCCTTCACAACCAAAGCATGCGCTACTTAATTACATATTCTGGGACAG
TGTTCAATCTTATACCTCACGAACTAACTACGAATAAAATTTCTAAGCCGATCAAATATA
ACAAACAGACAGAAGAAACTGACGCCCTCCTCTTGGATTGCTTCTTTCAGCAGTAGTGCA
TCAGTTTTTAAAATAATCTTCACAACCCTCAACTCCAACATTAGTCTAAGCCCAGCTTCG
GCAGCAAGCATCTTAGCATGTAAGGCACTTTGAATGTTTGGAAGGAAACATGCAGCGCAA
GATACCACCTCGTCGTCTTGGTTTCGGAGCACAGCGCCCCACCCGCTACTCAACTTTGTC
GCCTTAAAAGAGCCATCAACATTTATCTTAATCCGTGTCGATGGCTGCCTTGACTGGCTA
GGCTAGAGAATAATTGGGACGAAGGACCCGTATGTGCGTACGTACATATGCCGATCCTAT
CTGTACCCAGTAGTATAACGTGTAGCATGCCATGGTTGCCTACTGGAGTAGGTGAGTCGC
CGTGCTTCGCCGCGTCGGCTGTTGTCGGCGCTGATAGCTCATGACCAATGCAAACAGACT
CTTTGTTCGCAAACTTAGAACGAAAATCAAGCCCACACATCTTTTCTGACATATAATGAT
GAGACGAAAGCAAACAGCTTACGATAAAACTCATAAACATCAAGCAAAGTAGCATCGAAT
CCCACTAGGTTTATAATTCTAAGAAGACATGATCTTCCCGAAAGCTTACTGGATCGACCT
CGTGGGACATGCATGCCTTGGCCCAAGACCGACCGGGAGACATGATTCCACACGCCCTTA
TGGAGCATACTCCAGCTGCACGTTTACAAAGTGCAAAAAGAAGCACATATGATCTCAACA
AGGAGGCACCCATACACTATACTTCCATCTAGTGATCTCGTTGGTGCCAGGTCCGTCCAT
GGCACACTCAACGAACTTTCAAGCATGCTTCGGCTTCAGCCTAAACAGCGTGTCGCATCT
CCTCTTTTCGCACCCACCAGTTCCAAGGGCCATAAAATATGGTGCAATCCCAATGGATGA
ATCTGTTTTGTGTCAAAATAATTAAAACTGAGGGGCCGGCAATCAGAGTTTGATATGCCG
AAAGAGAAACCATTAGAGCAACTCTAGCGGATTCTTTGGATACTGGCTAATTTTTTTTAA
ATATTGCATTTTTTTATTCTTTNNNAAAAATAATGCACCAAATCAAAAAAATTGAAAAAT
ATACCTGCTTCGGCCTTGTTGTGGCCGA
