Map Locations of contig_42809 (7092 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_42809

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_58595 8 1457 bp MLOC_58595.3 Available Available LOC_Os02g43480.1, FRAME:+1, EVALUE:4e-142, 13102.m04829 protein expressed protein
MLOC_58594 1 1174 bp AK359707 Available Available None





CDS Structure of MLOC_58595






CDS Structure of MLOC_58594






Contig Sequence (7092 bp)

>contig_42809 7092 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGGACGCGTGCCGCCGCGCCGGCCGGCGCGCGCGGGCGGCGCCCCCCGCGCCCCGCCCGC
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CGACGATGAGCCGGCGACGGTCGCGGACGGCGCCTCGGGGCCGCCGCAGGAAGCTTCCGC
GCTGCTTCCTCCCCCTCCCCTCGACCTTCTCCAGTCCCCGAACTTCGTAGGCATGTTTTT
TGCCCTTCTCGAATCTATCCCGGTTGTTTTGGGGTCTCTGGTGATTGCTCACGTTTTGGA
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CCCATGTGGAAGGCAACTACGCGCTGCATGTCTACATCCCTGGTCTGTTTGTTTCTTTTG
GCTATTAACGTACTAGTAATATCTATCTACAGTTATTGATCAGGGCCTGCTCCGGGTGAT
GCTGCTCCCACGCTTGGGCTCTGAATTAATCTTATCTTTTCAGTTTCAGTACCAAAATCT
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TACATCCAGAAGCTTTTTCGCTCTTATGACTTATGCCTAGCCATCTCATAATGCAGTGGT
CATTCCTTTCAACGCAAGGAAACATCTGACCCTCGTTATGAGAAGAGTAGCATCACTTGT
GCCAGATCTCTATGCTGTAGATGCGGATTACGCACTTTCGGAGTTGTGCAAAGATGAGCA
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AATTCAGGTGCATCAAATTGACTCCCTCGTCGCAATGCTTCGTCAGAAGTTTCAGTCACA
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ATGTGTCATGATCTGCAGTTATGTAAATGCGTTTGTATTTGTGTAAAGCAGGTACTGGAT
GGACTTGAACAAATGGGAGCATTTTGTCAATGATGATTCTACACGATCATTTCTTTCACT
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AAGCAGGCAACTAAGGAGATTGAAAAATTTGAAAACAGCATCAACTTATCTAAAAACTAT
AATCTGAGGTGCAATTTCAGTCGTATATTGTGTAAAGTAGGCAAGAAGGTCTACGATATC
TGTAAAATTGGAGACTGAAACGACATTTTTGTACACTTACCGAGTTTTGTAGAGTCAATA
CCCTTGGTTGTAACAAGTAACTAAAAATGTTATGTGTTTCAGCAGCATTTATTGTTTTGA
GAACTACATGTATCTTTGGATTACAGATAACTAGAAAAATTAATCCCTCCATTACAAATT
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GGAGAGTGTCGGTTGCGGAGAAGAGCCGCTTGACGGTTGGGGAAAGAAGGAGATTTCCCT
AATTACATCAATTTAATAAATCTTAACACTCCTCCTAATCTACGTTTGACTATGTAGAAT
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TCATGAAATCTTCGATGAGAACTTGAAACATAAACTCACAAAGAGATGACATAATGTGAT
GACTCAAACAAGTATATCTCAAGAAGAGACATCCCCCCCCCCCCCCCCCCCNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTGTTTTTTTTTTTTTT
TTTGTACACTCT