Map Locations of contig_42722 (11812 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_42722

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_58494 6 1704 bp AK354828 Available Available None





CDS Structure of MLOC_58494






Contig Sequence (11812 bp)

>contig_42722 11812 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCGGAAGAGGGCGCGGCGGCGGCGACGACGACTAAAACCCTAGGGTTTGCGTCAAGAGG
ATGATACCATGTAGAGAGAGGAGTTGGCAATACAATAGTTGATGTATTGATGGATTTTTT
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CTGTCCCTTCCGAGGATTTTCCTCTCGAAATCTCCTGAATCCTTCCGTGTTAAATGAGCC
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TATTCTCACATAAAAGATCACCAGCTAATCTCCTGACCACAAAAGATCCAAAAGCAAAGT
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GATTTGCGATATCTTCATAAAAACATCCATGACCTAGCATCAGAGACATTCAAGTGAAAG
AGAAACCAGGTGAGTTTGATCATAAAGTTACCATGTGAGTCGACAACCCAAGTTTACAAA
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GGGTTCGCCATTATTTTCGATACAACTTCCTCAGGAGTCATGCCAACTTGCGCTGTACAA
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TCTTACAGCAAAAATAAAAAGCTGATTTGGGGAAGAATGAAGTCGTAACCCAAATCTCAA
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GAGCATGCATCGACACTATGCTAGGCGTTTAGAAAGAAAATGGTAATGATATTAGAAGAA
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AATTGCACTTTGTAGTGACTAGTGTGTATCAGCACCCGTTACCGATTCTGGTCCTGCGCC
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GCACACACGGTAGTCAAGGGCATGATGGATGTAGGAGGTAAGGGGTGGAGAGGAGGAAGC
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CTCCCTCTTAGGCATCACGTGGTGTCGTGCCTCGTGGTTATATTGTTCACCGAGGGACCT
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TGCTTGTGGTCCTGCATGAAGATACATAAATTTACACAACAATTTTCAATATACGTTGAA
CTGTCTAAATCCACATAAATTTTTGAAAACGTTCACGTTAACCTCTTCAAAGTACACAAT
AATGAAAATAGAATAGATATTTAAAATACACAATAATGCCCTACCGATAATTACTGTATT
TTTTATTTGGTAAAATTTACATATCATGAAAACTAAACAAGATCTCAATTTTTTCTATAA
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TTATCATTCCCTCAGTCAAAAAATTACCGCGATATTTGTATATGAGTTATCAACTCTCAT
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GGAATTGTACAGGGAGCCTATTACCAAGCTTCTGAAGGAAACTTACTTGTTGTTCGGAAT
CATCCTTCGTTTCACTCCCAGTGCTATCACTTCTTATATCTACTGTCTCCAATGAAGATT
GAAGCTCCTTCTGTTTTTGCAACTCTTCGGGAGAAACATCAACAAAGGCTGCAAACATTT
TGTTAACAAAAACACAATCAGATACAGATGCCAAATATCTGAAGGATATGATGTAAGCAC
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TGTGTGTTTAACTGTTTATTTCCTAATGTTGTGCTACAAAAGGAGACCTAAATAGGACCA
GAGAAATATAAAATAGATGTATCAAGATGTATAATTTCAGCATTTTATAGCCAATTTGGC
AAATAGAAGAGCCCATTCACCACTCAACTGTAGTTCGCAGGAAAAAATCCGGATATGAAA
GGTCATACCAAATTTCTTTGAAGGCTTAGATGTTTCGGCCACATCGGCTGCTTCCGAAGA
TCCAGTTGCTGCCACATCACTAGCTGAAACATCAACAGTTGCACCTTTTGGCGTATTTTT
CCTTGGCCCTGAGTATGGATAACTACTTGGTGCCGTGGAACCTGCCTGTGGTGGCATGGA
GAATGGGAATGGCGAGTTCGCACCAAATGTGTTTGGTGGTGCCTGGGTCATCATTGACTT
GAATGCTTGTTCCATTGCATATTTCTGCAACAAACAAGTAACACGTTAAAACAGGAATAG
GCACTAGGCAGGCAAGTAAATGGTGGTCATGTACAGCTAAATACATGTGTTTTTAAGTTG
ACCAACCAGGACTAGGCCTTGATGGCCTTTTTTTAAAGAAGAGGATACTTGTGCAGCAGG
TAGAGCCTCAAACGCAGGCAGCAGGGCTAGATACACCAACCTACTCAAGCTAGCAACATA
TGCTAACACAGAGCTATACAAGAAATACCGTAATGGCAACAGTAAAGTGTACATGACCAA
GGCGACAAACAAAATATTGAATTACTTAAAGCCATGCAGCAACATACTAAGCCATGCAGA
AGGGGTTTATCATAATACTCCATCCGTTCTTAAATATAGATCTTTTTAGAGATTTCACTA
GGGGGCTAAATACGAAGCAAAATGAATGAATCTATACTTTGAAACACATCGGCACCCTTA
TCAGGCCATAAAAAAATCTTTGAAACAGCAAAGTGAACTGATATAATAAGATGTGTCGGA
AGGTTAAGCAGGTTCAAGCAGAAAAAGGCTCAATAATTTTACCTCCCTGACTCATGTACT
ATTATACAAAGGTACACAATGGATTATTCTGAGGAACACTGTGCAAATGATTGAGGATAC
ATACTCTTTCTCGAGTACAGAAACAAAGAATAACTGTGAGCTCACCTTTACCATCGAAGA
GACCTGATACACCAACCACCAAGTATTAATAATTTATAAAGAGAAGATATGCACAAAAAT
AAACTAAAGCATAACAGGAAGCAGAATTTCACACCATGGAAAATGCCGCGGACAATGCTA
CACCAATGCCAATCCAGAAAACAGGTGAACCACTGCAAAGATTTTGGAACTCGCCATCAT
GGGAAGGTCAACTTGAGAACACGAAATGTAGGCAAACAAAGAGAGAACTCACATATATGA
TGAGGGGGGCGGCATGGGAGGCAGGGTACCAGTTCCCGTCGATGTATTCTCGCTGCTGGT
TGAAGAAGATATGCTGGCAAATCCCTTTGTGTACAATCCATCTGAAACTGATGTGGCAAA
CATCATATAGTATGTAAAAAATAAGAACAAGAATATCAAAATGGGTGCAAACTAAGGCCC
TGTTTGGAACCACAATAGATTATAATAATCTGGATTATGAAGATAGATTATA