Map Locations of contig_42586 (5697 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_42586

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_58354 1 367 bp None Available Available None
MLOC_58353 2 1540 bp MLOC_58353.1 Available Available LOC_Os11g10420.1, FRAME:+2, EVALUE:7e-143, 13111.m01104 protein phosphatidylinositol kinase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_58354






CDS Structure of MLOC_58353






Contig Sequence (5697 bp)

>contig_42586 5697 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACTTTCCTTGCACCTCAAGTCATGTGTAATATATATATGCCCCTTGGGCATTCAATATAG
ACAAGTTGCTTTCCTAACATATATAAAAGCATATTTAAGGAATCACATGATACACATTGA
TTTTATTTGTACTCAAACTGGCATGCAAACATTCTCGCACATAAAAATAGTACTATGGCT
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AATCGCACTATTCTGAACTTGAGGAAGAGGTTCCACTTGAGTCTCACTGAAGAGGTTAGC
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ATTTGCTTAGCTTGGGCAGGGGTTTAGGGGAGGACCGAGCCATACATGAAGTGAACAAGT
GTAAATTAAGGACGCATGGAAGCTGGGAGTCACCTGGGGCAGCAGCAAGGGTTGTGTTTG
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TTACCATTACTGTACAGGGCCCATACAATAGGAGCTCATTGTCCCGTTTTTTCAGACTTT
CGTTTTATTCACCAATAGTACTAGAGTTGGCGCCAGAAGTTGCACGTAAGTGATGCTTAG
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TCATGTCATGGTTAATTGTTTTGTTTGTTGGGTGAATTACATTTTTCTCCTGATAAAGGG
TGTTTTTATTAACTCAAAATGTAGTAGCATCCTGTACAGTTTGCATAGCTAGGATGCACA
TGACAATACACCAACAGTTTGACGGAAAGAAAACATACTCTCTCCGTTTCAAAATATGTG
TCTTAAACTTCGTACTCTCTCCGTCCCAAAATAAGTGATTCAAAAATGACTCAACTTTGC
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TAATTTTGTATTAGAATTCATATAAAGTTGAGACAGTTATTTTGGGACCAGAGGGGGTAT
ACTACAAGGCAACAGAAAAGCAATATGAAAACCTTTCTAGCTATCTGCTTCTTCAACCGC
GTACGCACAACCTTCAATAGTGATGATAGTCACATGTTTTGTATGCCTGGACAACGCTCT
CGCACTAACTGAGCACATGCTCCAAACAGTCCATATCCTGTTTGCCTGCTGGTGAAGCGT
TTCTGTCCGGCCAATCAATGGGTCACGATCTCTGGATCTAGTAGCACGTTCCGGCTTAGT
GCTTTAGTTTTTCTTTTTTCTTTTTTGCGAGTGCTTTAGTCTTTGGTGCTTCTTCTGTGG
CCGAAAATAGCAGCAGCTGTGGGATGGTCCCATCACTTCGGTTGCGACGGCTACGGCAGG
TCCTTAGGCCCTGTTTGGTTTCAAATAAGTCATCAACTTATAAGTTAAAAAGTGCAAAAA
GTGACTTATTTTGCCAAACAGATCCAATTTATAAGTCACCCCAACTTATAAGTCATA