Map Locations of contig_42226 (10047 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_42226

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_57938 4 2284 bp AK355313 Available Available None





CDS Structure of MLOC_57938






Contig Sequence (10047 bp)

>contig_42226 10047 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTACGAGTTTAATGTCATAAACAGTAAGGGTTTTTTTGTAAAATCACCTCGGTGGNTTTT
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TGTTGGTTTTTCGTGCCAGGAGACCTGAGATACCGTTGTCATTTCCCCACTCACATCCTC
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ATCAATCTAGAATACAACCATGCACATTAATGTGATAAAAACCAACATGTACAACCACAA
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ACAACCAAGGTCATATTATATATATTAAAAGAAAAACAATACACCACGTCAAGTGGGATG
CTTGGCGTGCAACCAAAGACGGTATATGTGGGCGTAATAATCACTCGGCTGAACCATATC
ATTTTTCATAAAAAAATCTTGGCTTATAAATGCTTATGGATATCTTACAGACCTACTCTC
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GTAAAACAAAAGGAGTATTAAACCCGCCCCTTGAATTTTATTGCATGTGATGAAGCCACG
GGGCCATCTGAATCTGATCAGTCAACTTATGAATCGGGAGGAGCGATGGATGCCACCTGA
TTAGGTGTCTTGTCATCTTGCTTCCATGGTAATTATCTGGACGTGCTGGTGCATTGATGA
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ATAAGAGTTATTATATATTTTTATTTTTTTAACTTTGATCAAGTTCAGAGTCAAAAATAA
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TGACTTAAAAAAAAATACATGACATATTTTGAAATAAAGTGAGTAAAGAAATTTAAGAAT
CCCAATAAATTAAATGGCGCAGCGAAGCACGTTCAACCCTTCTAATAACGAAAGTAAATG
GGATCCGACCCATTGCCATGCACCACCGACCTGATTGAAGCTCATGAAGCCGAGGTCGAG
CTGGAGGCGTCCGGCGCCGTCGTCGACGGCCACCGTCCTCGCACGCCCTCCGAGGCTCTC
CTCCTGCTCGTATAGGGTGACACGCACGTCGCCTCCGCCGCTCGCGGCGAGCAGCTCGTG
CGCCGCCGCCAGCCCACCCACCCCGCCGCCGCCCACCTCCACCCTCCTCCGCCCACGCCC
ACGTCCTTGGGCGACGCCCCCCCCCCT