Map Locations of contig_42210 (8515 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_42210

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_57918 1 957 bp None Available Available None
MLOC_57919 1 158 bp MLOC_57919.1 Available Available None
MLOC_57917 1 1008 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_57918






CDS Structure of MLOC_57919






CDS Structure of MLOC_57917






Contig Sequence (8515 bp)

>contig_42210 8515 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CACAATTTGGGTTTGAAGCAAATTTGAACAAATTCAAATTTAAACCAGTCAAATTTGAAA
ACTAATTGCAGAAACAGAAACTAGACAAAATTTTGAATCTAGTGCAAAAAGAATCGCTCA
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GGCGAACATCGGCATCCGCGGTGCGGCCGTGGAAAGAACCACTTCCAAAGGTTCGTTTGC
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GGGAGGCTCGCCTAAACGCTATCCTGGGCCAGGCTGGGCTGACAGGTCAGAGCGAAGGGC
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TTGACAAGTGAAGCACCAGGAGCAGACACATATGCATGATAGAAGTGTCTATTGTGGTCT
GCTTTGTTAGCTCACCTAGATTATTTATATTTTCTCTAGGTGATGACGTTTGCTTTAAGT
TAACTCCGATATTTTGAAATTTCTTAGTGCATGTCCAAAGAATATGTAATCTCTTATCTT
ATTCTTGTCATGATATGTCCAGAATGATATCCTTGGCATGTTGTCGCATATGACGAATTC
ATGATATGGCTGCTCATATATAGTTGTTCTTGCAAATAGATAAATTGACTCGGTTTCTTG
GCTGGTGGCTTACCTGTGCATTGTTCGTTGGCTGTAAGGAGGTACTGTGAACCTCAAGTG
TTGAATATTGATGTCTGTCAGTTCATCAAGAGAATGCTCGTTTCCTTGAAAGAATGGTTT
AAATTTTAGGCCAAAGCTGCATATGTTGCACTCTCTATTGTTTACTATGCATTGCACAAC
AACATCAGTCATGTAAATTCCCTCGTGTATATAACCTTTATCAGCATGCCAACCAGCAGA
CCAATTCTGAAGGTAAGTATGGCAAAAAAATTATTTCCTTCGATTCGATTACATCTTCGA
CATGTTTCACTTGAAAAAGCTGGATTTTACGTTTGTCTGTCTTTTTGCCTTGCACATGAA
CCACATCACCATGATTGATCAGATACCTTATATCTATGTCGCTGACTCGTACTTCATGCA
CAAGGGCTTCTTGACAGTCTGCCCAAAGCACCGTGAATACGCGAGTAACTACATCGCTGA
TTTCATGGTTGCCAATAAGGACAAGGAGAGGATCCTCGTGCCTTATCATCCCATGTAAGT
CATCCACAGATATCTTTCCTTCGATTTCAATCATTAATTTGCATGCGTGGAGGCTAATTT
GAGGTNNNCTTATTTTGCGCAGCGACGGGCGCGCCGTCCTCGTCGTCCTTTACCCCCTGA
TTCTCCCACGCTCTTTACTTGGACTCGTCGAAGGACATGAAGAAAAAGGATTACACCCAC
ATCAAGTCTGCTCGCGACAGTGCTGTATTTTTCTATGACCTACGGGGTGGAGAGATCACG
ACCAGGAAGACAAGGAACTGTGCGCCCGCCTTCGGCCATAAGACCGGCTTCTGCT