Map Locations of contig_42006 (10093 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_42006

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_57704 3 4248 bp AK362289 Available Available None





CDS Structure of MLOC_57704






Contig Sequence (10093 bp)

>contig_42006 10093 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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GCTGGTCGCAGTAGTTATGGCACATCACAGGGGTATGATCCTCGACGTGGAAGATCAAGA
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GCTCGCTGCTTATCTATAAGGAGGGGCGTTGAGATACCTTTGTGAGTACAAACTACTTCA
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CAACCTCCACAGCAAGATCTGTGGCATCACTGTTGCATGATGCATCTACGTTTTCTATTG
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CATTGCGCCCAAAGGCCCATCCAGTTGGGTTAGATTTCCTTGAGCTCAGCTTTACCCGAG
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GGATTTCGTTGGCAGCAATGGCATTTGTTGCCTCCTTGCCGGCTCATGATTCTGAATTAT
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TGGTTGATCTGGTGCGCTCTTCCTTATTTAATTATTATTCAAATGTCCGGCCACACAACG
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CTGTCCCTCTCTCTCCCTCTCTTCTCGTCTCTTTCTTATATGCGTGTCCTATTTCACGTG
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TTATGACTTCAGTCAGTACTCTCTTCGTTTTTAAATATAATTTCTTTTAAACAAAACAAA
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TAAAAAAGACTCGTACTCAGAGAGTATTTAGGAACGAAGGTAGTACGGCGACACGTTTGT
ACATGCACTATGCTGCCATCTTGTGCTCGTACGAACGACTGACACGCGAAAGAATATGCC
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GGCCTCCTTGGCATGACATGTAGTACTTGTTTGACTTTTCGGTTTTGACATGGATAAAGC
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TGTCTATGCGGCCACCGTGGCATGACATGTACCAATTGTTTCATTTTTTGACTTTATCAT
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GTTCTGTTCGATGTCTCCAATTGGCGCCGAACTGACAAGAGCGATTGGGTGTTCCTGAAA
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GTATCGCTGTTTGGACGAGGTTAGCACCTCACTGACGAAATACACCGGCCGCTGAAACGA
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ATCCATCTTCTTGAGCAATTGGTAAAGAGGTATGGCCTTTTCACCAAGGCGACTTATGAA
CCGGCTTAACGCCGCAATGCGACCCAAAAAAATTATTGCCTTGATTTTATCTAGGTTAGC
CTCAATGCCTCGCTCTGACACGAGGAAACCTAATAACTTTCCCGCGGGAACACCGAAAAC
ACACTTGGTCGGGTTAAGTTTCATCTGGTAGACTCGAAGATTGTCAAACGTCTCGTTGAG
GTCCTCCAGGAACGTCTCCTTCCATGACTTTACCACGACGCCCAATCTGACCGTATAAAC
AATTTTGCATGCAACATTGATAAGTCACCCCCGCGCTCTTAAGTCCAAAAGGCATAGAAA
CATAGCAGAACGCGCCAAGAGGGGTTATGAAGGCCGTTTTCTCCTGATTCTCCTTAGCCA
TCTTGATCTGGCGGTAACCTGAATATGCATCTAGGAAACACATGTGCTCACAACCCGGCG
TAGAGTCAATGATCTGGTTGATACGGGGGAGAGCAAAGGGATCCTTAGGAGAAACTTTGT
TGAGGTCGGTGTAGTCTATACACATACGAAAAGTGCCATTCTTCTTCAGAAGAAGCACCG
GGTTAGCTAGCCACTCAGGATGAAAAACTTCAATAATGAACCTGACATCTAGGAGTTGGG
CGACTTCTTCCCCAATAGCCTTGCGTCTCTCGTGTTAAAATGAAGGAGGTATTGTCGTAC
ATGTTTCATCTTTGGATCCACATTAAGGTTGTGCTCAGCGAATTCTCTCGGTACTCCAGG
CATGTCAGATGGCTTCCATGCAAAGATGTCCCGATTCTCACGGATGCATTCGATGAGCGC
GCTTTCCTCTTTG