| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_41994
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_57691 |
2 |
1890 bp |
MLOC_57691.2 |
Available |
Available |
LOC_Os02g35060.1, FRAME:-3, EVALUE:0.0, 13102.m03797 protein RNA methyltransferase protein, putative, expressed |
| MLOC_57690 |
1 |
1839 bp |
MLOC_57690.1 |
Available |
Available |
LOC_Os11g04860.1, FRAME:+1, EVALUE:1e-153, 13111.m00448 protein anthocyanin 5-O-glucosyltransferase, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_57691
CDS Structure of MLOC_57690
Contig Sequence (12438 bp)
>contig_41994 12438 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CATGTCATAGTTTGGTGAGTGCTCACAATTGTTTTTGAGCTAAATGACCCTGAAATTGTA
AAACGCTGCAAATCAACTCGAAAAAGGCTGAAACTTGGCATGGTATCATCATTTAACCCA
CATGACATGTGCTAAAAAGTTTGAAGAGTTACTCCAAAAATAGGATGCACTTTGTGTACA
AAACTGGATTATCTTTTTCGAAGTATGAGGGTTCTCGACGAATACTCATCTCTTACAAAT
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GGTGGCTTATATAGCCGAGCGTCGCTGCGTGGTGGGCGGAGCTCACGACCGCAGCGTGGG
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TGAGGTTGGTCGTTAGCCGAGTCGTGCGACGCTCGGGCATGCGTGGTTAGGGCAAGGGAG
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GATGCGTCCACCCTTGTCCACTCGATGTTCGGTGTTCTAGAGATGCCTTTTACGGGCTTA
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TGAGCTCAAGTGGTGACACTTGGTAATGTAAAGTTGTTCAAAGTTGAATCTGAACAAAGA
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CGTCGTTCTGGGAAGTCTTATAGATAATACATTCCAAATAAAATCTTTGAGGCAAAACAT
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GTGCTTCTTGAAGGGGTGAAGGTCTAGCGTTGGAATTGCCCTATGTCCGGCTAGTCTGGA
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AAGCTCCACCTGGCTCTCCGCTTGAATCCATTGCCGGCAGCTCATATCGGTCGGAGGTGC
AGACGTGCCCCAAAAGAACGGACAAGTCTCCCCACTTGAATTGAATTTTGCAGATTGGGA
TGGTTTTCCCCAATGTTTCAGGGAGGAGGGGTCGATTTTTTTTGGCTTGCCCGAGTAATT
TTTTGGGGATATGTTAAGAGTGCATGAACTTAAAAAATAGCGTGCTTTTGGTAGTGAAGG
TTTTTACCTTTTTGTTTTGAACACAAAATAAAGAGTAGCGCAACATCTACAAAGGCTTAC
TTAAAGATTTTACATATAAACTGATGTGTAGGATTATGATTGGTAATTGAGGGACGAAGG
GCCCACCCCACTGAAAATCAGGGGGAAGAAGAATTAGTTTGGAAGGTTAAGTAAATCTTT
GTAAGTCTAGCATTATTGCAGAATAAACACAGACACTCTTAAGACTGGAAAAAATGGCAG
CCAAACACACAATACCCAGGAAAAATTAGTAAAAAACCTACAGTGAATCAAAATGAGTTA
GCCTGGCATGACATCAAGTTGAGAGTTCAGCATACAATTACTTGCACTAATTGGCGCTAG
CTTGTAAAGCTAGAACAAGCCATACAAGAACCATCACTGAGAGATACAAACAACAGAAGA
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TTGGGCTTGGAACCTCTATCAGATTCAGACTTCTTATCATGCTCCGCCGGGCTGAACACA
GCAGAGTGCAGGTTGCCCTCCTCCATCCATTTCTGGTGATTCTCCCTGAACTCCTGGTGC
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AGAACCCGGCTGTACCGCAGGCTTAGGATCTGCTCGCAGGAGGAGACCAACTTGAAGCAG
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AAGACGAGCCTGCCGCCAACCACCAGCATTCTCGCAGCAAGGTGGAGCAGGTCATGAACA
CATTCGGCGAGACTATATGGCGCAGTTGATGGAATGTGGTTCTCTCTCTTCTCGTCCGGA
ACTGTGTATGGAGGGATGATGCCTTTTAGGAGCTTCCGGCCGCCAGACTTGCGCCCACCA
GCTCGGACACCATAGGGGGGATCGCAAATAATTGCATCAAAAATCTGGTCGACAAAAGCA
GCACTAGTTTATCATTTCTTGTGACTAAGATGGTAGAATTAGACAGTACCCAAGAAGTAG
CATGCAGCTTATACAGAAGATAACCTCATAATAATAGCATCTAAAGAAAGATGCCATGTT
CAGTTGTAGACCACAATCACAAAATAATGTTAAAATAGTACAATTATTCTATCGCATAAT
AGTCTAAAGATTTTTTTCACATAGTAATTCAGTTGATAGATCTCCCAGTGGTTTATACAG
TGTGCTCCAGGTACTGCTTTTAAGGAGTATTAAGCAAATAATAACCATCAATTATTTTCT
CATGGAACTAAAACTCAACCATTTTATGCTGATTTTGTTTCAAATTAAGATGGATATATA
CCATCCACATGAAGGTCATATAAACATTCAACTATGTGACTGAGTATCATATAAGCACAA
TTGAAATCACAATCACAAGTTAACATAATACAGTTGTTCTATCTCATAATAATCTAAAGA
TTTTTTCACATAGTAATTCAGTTGATATATAATGCAGTAGTTTATACAGTATGCGCCAGT
ACTACTTTTAAGCATAGTTACAAAAATCGCTAGGCAATTGTGCATTTTGCCACTGCCTTG
CGCTTTTCTAACCAAGGCGGACGCTTATGCGCAATTATGCACAGATTAAGCGCTAGGCGT
TTCGCTATCACCTAGAGCCTAGGAGTGACTTTTTTAACTCTGCTTTTAAGGAGTATTAAT
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TTTGTTACAAATTAAGATTGATATACCATCCATATGAAGGTCATATAAGCATTCAACTAC
GTGAGTATAATGTCATGTGTGTCCATGCAAGACTTCAAGCACAACTACAAACATTCGGCA
GCATGCATTTGTGCAAAAGGGACGTAGTTGCTGATGCTTTTCTTCATTTCTCACCAGTCA
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TGTACCTCCTTCAATCCTGGACGCCAAGGTGGCAGGTTGTTATCTGCTCGCAGCACACAC
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ATAGGTATCCACCAACTCACAAACTAAATAAGATGTACTACTTCAAGATCTAATAATGAT
GATTCAGACAAGTCTCATGGCAGGCATGCAAGAAGCTTCCCTGAACTGAAATTTGGTCAA
GTCCGCCTAATTACCTGCTCAAAGTTGCTCCAAATGTTGCAATCAGGACCACGCCCATCC
CGCACGACCCTTATATCAATATCTGCACCCTGAAAGAACTTTATAAGCGAGACATTGACT
AGCAAAAGAGTACAGCTATGTATTTATTTCTGCAATAAGCACAAACCATAGTCATGGCTC
CAAAATGCGCGGCAGCAACTAAAATACTCCCAGTGCCAACAAAAGGGTCATACACAAGTT
TCCCAGACCGTGCTAGCCCTTGGTTGGCCATGAGAAACGCCATTTCACAATCCATTGCAG
TCGGGCCAATGTACTTCCTGCTCTTCAACTGATACGTCGGCAATAGATGCCTATCTGCTG
CTCCAACCTCCCGGCCAAAGAACACCATCTTCTGGACAACTGGTGGGAGGCCATTTTGAG
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GGCCCTATAACAAGAGAAACAACACCCATCATAAGAGAAGGTACAATTGGCATCCACAAA
TGCCTACCTCTGGAATTAATAGTTAATAGTAGTAGTAGTACAACTACAAGGCGGTGGAAG
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TTCGAAGCTGATCACCTTGCCGAAGCTGTCGACGACAATCTTGAAGGAGCTTTCCGGCGT
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GGTGGCGCCATGTCCCCACAGTTCATAGATCCCCTTCACGAGCAGGCCTGCCACACGCGT
GCGGCGTCCGGGATAAGCGCGAGATGCAGGCATGGTACTGGAAATCGGTAAAGGATGGCG
AGGGGAGCTCGCTTACTGCGGTTGGCGATCTGCGCGGCGAGACGCTCGTCGCCGGGGAGG
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TCCCCGGCGCCGGGGCCACCGAAGAGCTCGGCGAGCGATTGCACCTCCGGCCGCCGGTAG
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TACGGGCTCATTCATGGCCCGGCCCGTTATACTGTGTGCACCGTAGTTTACTGCCATGTA
GCGTTGATACTGGTTTCCGACTGATCAAATACTCATAAGTTTACAAAAACACTCGTACAC
TTTTGTTAATAAACTTACAAGTTTGAAAAAGTTTTCTGACAGTTAAAAAATGTACGTACC
AACCAAACCAAATTTTCACCATATTAAAAATGCTCATGACGTTAAAAAAATGGTCATCAT
GTGTTTTCAAAATGAGAATTATTTGTTAAAAGTTGTTCATCGTGTATTTCAAATAAGTTC
TCCATGTATTTTAAAAGATTTACAAGTGTATTTTGAAAATGTTCGATGTGTATTTTAAAA
ATGTTCAATGTGTGCTTTCAAACTTTTAATTGTGTATGTAAATAATATTCACCATGTATT
TAAATAATTCTGAACAATTTTTTCACAAATGTTCAACATCTATTCGAAACATGTGCAGCA
TGTATTAAAAATATTCCATGTGCTGTCAAGTATCTATGTATATTTTAATAATAGAATAAA
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AAAACTAACCCAATCTGTAACCCACTGATCTGTATTCTGTACCATAATAGTACAGCTTAG
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CTAATTTTTGATTAGTAGGCTTTTAAAAAAAAATTGATTGGGCTTATAGAATAAGCTGGG
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TCCCTTCATTTCAAAAAATAAATAGGGGCATAAAACTCCTTGATTTCGAAAAAAAAAACT
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ACAGCCGCAACGGCGGCGTGCACACCGGCCACCACTTCCTCATCGTGGCCTACGGCATCC
AGAGCCACCTCAACCCGTGCCGCGTCCTCGCGCACCGCCTCGCGCGGCTCCACGACGGCT
CCGGGCCCGTCCTCGCCACCGTCTCCCTCCCGGTGTCCGCTCACCGCCGCATGTTCCCTT
CGTCCCGAGCCGTCGACAACGATGAGGATACCGCCACCGACGGCGTCGTCTCTTACGCTC
CATACTCCGACGGCCTCGACGACGGCTCCATGGCCAGGGACGGCGAGGCGAGGGCGCGCA
GCCGCCACGCCACCTTTGAGAGCCTGTCCGCCGTCGTCGCCACCCTCGCCGCACGTGGCC
GGCCCGTCACGTGTGTCGTTTGCAGCATGGTTCTCCCCGCAGCGCTGGACGTCGCGCGTG
AGCACGCCATCCCGCTGGCCGTGTTCTGGCTCCAGCCGGCCACCGTGCTCGCCGCGTACT
ACCACTACTTCCACGGCCACGGCGACCTCGTCGCGTCCCGCGCCGCCGACCCCGCGTACG
AGGTGTCCCTGCCCGGGCTGCACCGCCCGCTCCGGATCCGCGACTTCCCGTCCTTCCTCG
TCGACACCACGGGCAGCATGCTGGCCAAGATCTTCAACGAAGCGGCCCGAGAGCTGTTCG
AGCACTTGGGCGATCATGGCCGCACAAAGACGAAGGTTCTTGTGAACACTCTCGACGAGC
TGGAGCCGGCAGCGCTGGCAGCCATGAAGGAGCACCTCGATGTGTTCGCCGTCGGGCCGG
TGATAGGGTCCTCCTCCTCGGCCGAGGCGCGCATCCACCTGTTCAACCACGCCGGCGCCG
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CGTTCGGGAGCGTATGGACGTACAGCGAGAAGCAGATGGAGGAGATTGCCGACGGGCTGC
GGCGGTGCGGGCGGCCGTACCTGCTCGTCCTGCGCAACGACGGGCGGCAGGAGGACGTGA
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AACCAAAGGTCCTGTCGCACCCGTCCGTGGGATGCTTTGTCACGCACTGCGGCTGGAACT
CGGCGCTGGAGGCCATGGCGCTCGCCGTGCCCGTCGTCGCCGTGCCAGGCTTGTTCGACC
AGCCGACGAACGCGTTCTTGATAGAGGAAGAGTGGGCTGCCGGCGTCAGAGGGGAGCGCA
ACAGCGAGGGCGTCTTCACCGGGGAGGAGCTCGCGAGGTGCGTCGAGCTGCTCATGGGTT
ATGGCCCGACGGCCATTGAGGTCAGGGAAAGAGTAGAGGCTCTGAAAGGGGTGGCGCAAG
AGGTGGTGGCTTTGGGCGGGCCGGCGGAGCGGATCCTCCGAAGCTTCGTCCAGGAGGTCG
GTTCAAACGCCGGATGAAGTTTGCACGAATGTACACCACCAAACATGTCCAAGTCGATTA
AGTACGTACGGGACACCCTATACATCAGGTGTTCTTAGAAAACTTTTGTTTTTCAGATCA
AGGCTGACACATACATTAAGGACTTGATAGTGTCCATACGTGTGGGCCTTAAGGAAGTCT
TGTCATACATTTTGGATGATGTGTACGAAGAACATGCGTGGGTAAAACAGTTAACGCCCA
CACGTCCGGCCTCCTGCCTCGCGGCCCGCACGTTCGGCCTGCCACATCGCGGTTCCACGT
GCCCCCGCGTGACAGTTGTCATGGTTGCTGAACAGTGGTAACTGTTTGTTTAATTACAGT
TGTCATGTCAGAACAGCTACATTTGTCATGGTTATTCAACTGGAGTCGTTATATCTGAAC
AACTGCATTGCCATGTAACACTAGAAATACATGACAACTGACAGACATGTGGACACAGGA
CGGCAGTTCCATCCAGTTGCCATGTAATAATGAAAAATGGCAACTGACAAGTGTGTGGAC
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CTGGCGGGGCGTGTGGGCGCGACGCCAATTCCACCATACGTCGGGTTGGAGCCGCGAGGT
CTGCGTGCGTGAAACAGGCGTATAAACGCCCAGACATCAGCCCCTTCTTACGTGACATAA
AAAATTCGTCAAAAATTGCCTAGATTTATGCAAATACGCATGGGCGACGATCCACGTGTA
TGGACGACTTACAAAATGCTCATACGTATGGGCGTTATTTTTTCCTACATTAATACTTAC
TCCCTTCGTTATTAAATATATTTTTTTTGAAAATTTACACTATAAACTACACGCATATCA
AAATAAATAAATATATACTTTAAAATATATATCTACATACAGTCGTAAGTAGTTTGTAAT
GGAATATATAAAAAAATTATATTTATAAATGGAGGAAATACAAAATTCAACCTTATACCT
ATATATGAGTCGCTTTAAAATTATTTTATGTCGGTCAATTCTTTTGACCGTTGATTCCTG
CTTTGCGATTAGTGTTTTCCCTTTATTTCTTTTAGACTGTTTTCAAAAATGGGTTTGGGC
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TCTCTTTTGTGTTCATTTTTGTTTTCTGTTTTATGTGTTTCTCATTTTGTAGTTTGTTTT
TCTATAAGTTTGTTTTTCTTTTTATACATACAAATGCTATGTAACATGTGCGAAAAGTAC
ACTATTACTTCCTCCGAATATTGCTTTTGGCTCCCGAGCTCACTGGAGGCTTTTAAATTC
AAACTTTAAATTCAGTGAAAATTTGTATTTTAATGTGTCAAAAAATTCTGAAAAAAATAC
ATAGATAAATGAAGGTAT
