Map Locations of contig_41972 (9019 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_41972

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_57666 1 2115 bp AK376298 Available Available None





CDS Structure of MLOC_57666






Contig Sequence (9019 bp)

>contig_41972 9019 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATATATATATATATATATACAAACTCTATTCATCACTCGGGGTGCAGAATAAATTATTC
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AGGTCTGGAGCTTCTCCATGGCGATGCCTTCAAGAAGGTAATGACACAAAAGAGTGCCGT
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CTCCATCCATCTTTTGTGCACGGAACGCCGCCTTCTCTGTCGGAGACTAGACCAAAAGAA
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GTTTTTTTACCTTTTTCAAAAAATGTTATAAGTTTCAAATAGTGGCTGTTTTTCAAAAAC
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TTCCTATTTTAAGAAAAATGTTCTCGCTATCAAAAAATGTTCCAAATTTCGAAAAATTGT
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CTTCAAAACAATGTTTGGGATTTTTTTTAAAAATAGGGATTTTAAAAAAAGTTCTATTTT
TAACGAAGATGTTATTGTTTCGGTTTTCATTTTGTTTCTTCACTTATATTTTTCTTTTGT
TCCTTTTCCTATTTTTTGTATGACATTTTCTAAGTTTTGTTTTGAATTTGAAAAAATGTT
CTCGTGTTTAAACTTTTGATTATTATTTATATTTAAAAGTTTGTGCTTCAAAAAATAATC
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TCTGCCCTTGTAAAAATATGTTAACAAATTGAAAGCCTTTTCAAATTATGTTCATCAATT
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TCAAATATTATACGTAAGTTCAAAAAATGTTCCTGTTTCGAAAACGGTACATAAGTTAAA
AAAATGTTCCTGCTTCAAAAATTGTTCACAAATTTTAAAAAATGTTTGTGTTTCAAAACT
TTTCTAGTATTCAAAAAATGAACGATTTTTCAAAAAATGTTCCCGTTTGAAATAAGAACA
TTTTTTTGAAAAGAGGAACATTTCCCAAAAGAATGATAGATTTTTTTTCAAAAAATAGTC
TCTCAAAAAATTATATTTTCTTTTCAAAAACTGCAATTTTTTTAGCTTCTGAACATGTCT
CAAAATTTTGATTTTTTTCCTAAATTTCGAAGAACAAGAAAGAGAAGAAAAAGTAAATAG
AAAGAAAATAAAAACGGAAAAAGATTGGAGAAAAAGAATCAGAAAAAACATTTTGGGGGC
CGACCATTGGGGGGTATAGCCCCTGGTCCCCCCCTCCCCCTGTATCCGCCGGTGTCGCCA
TTGCCGGTTAAAGTTGTTGCCAGCCATGCCTGTTCATTGTTGAAACAAAAGTGCTTGCCA
ACCCCTCTCCGATGTGTAGCTGGTTGCAGCACCACCGGATGTCAGCATCTTGGAATGGTA
GTTGCAGCAAGCCGTCGTGTCCCAGGTCGCAAGCAATACCATGGCTGCTTTTTCAGGCTA
GGGAACAGGTGGCTACCGACTACCGAGCTTGTCCTTGGGCGAGCGATGCTCCCGGATGCA
ACCACTATTTGTTGCCGTTGTTGCCGTTGGGCAAGCCGGTTAAAGTTGTTGCCGTTGCAT
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AGGTACAACGAGGGAGAGAAAAAGAACAAATGGATGAGAAGGGACGAGAACAGACAAGGG
AGGAAGAGAGTCGTGCGTGGAGGCCGCGGAGACACACGACACGATCCAAAACAAATCACA
CGGCTTGCGTGGGACTTGCACAGCTTTCGGCACGAGACGTTTTGCTTCTTCAGTTGTATC
CCTGCACTGCGAGTGCACGTGCCCGACACGAACAAAACACGATGTCCCTTGCAGCTGCAA
GTTAATTAGCAGCCGCGGTTAAGTAATCAGGGGCCACAGACTCGTCTCGTGGTGATCCAG
CCAGCTTTGCATGGCACATGCGCTCGCGTGGCTAACTGCGTGTACGCACTGTCAGTCAGT
CGCTAACCTTATACTAGGCCACTTCTAAGCTTCTACTACTACCACCGTGCATTTATCCGT
TAAACAAACTTATACTCCGTGCAATCACGCGGCTTACAAGGAGTACGATCCTGTCAAGCT
GCGCTGATGGCTGTCTTGTCTGGCAGTTGGCCTAGTTTTGTCCGGCCAAATCTGCCGCTG
CCACCGCTCGTTCATCCGGATGATTTTTATTCGATCTGTTCGTTCGGCTCCGGACAAGCT
GCGTTTTTATATTATCCACACATATATAGTTAAGTGCAACTAGAGCGTACGTCCTGCACA
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GCGCGGTCGGGCGTGGGAT