Map Locations of contig_41802 (14393 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_41802

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_57500 2 1710 bp MLOC_57500.1 Available Available LOC_Os03g55040.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13103.m05979 protein UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_57500






Contig Sequence (14393 bp)

>contig_41802 14393 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTTTTCGTCCGAAACCGTGATACTTTAAAAGAGATTGTCCAATTTGTACATAAAGTGCAT
CCAGTTTTTGTTGTAACCCTCTTGACTTTTTAGCACATGATATGTGGATGAAATGATGAT
ACCATGCCAAATTTCAGCCTTTTCAGAAAAAAAATTTACAGTGCTTTTCAATTTCACAGT
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GGACTCCTTTAGTCCCGATTCCACACTCCCACTTGGGGAACTGGTACTAGAGGCCGTCCC
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TACTTGTGATGAATAGTAAAAAGATAGTATTTTCTAAAAAAATAAAAAACAAGCAACAAT
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AATAATCGAACTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTCAATTTGTTCTGGAGGGAGCATTTGAGCT
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ACCCTCCATCTGCATTCGGATGGGTGCCTCGGTCATTGCTTTGCCACCCAATTGGACACC
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CAGTGATAACGACATGGACATGGGCACGTCTAGTTTGGTGACCACCACCACCCGTTCGTC
ATGGTCGCAGAAAGGTAGAACCCGCTTGCACAACCAAGTCCCTTCGCGCCTCCCAGTTGC
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CTGCAATTCCAAAGCCAATGAACAACGTTGGGCAACGCCGGTGTTGGGTATGCCTGCATA
CTCTTCGATAATATGCCCCCAACAAGACCCAATACATTCTTTGCCCCATATGCCATTTTG
CATTGCTTGCTTAATTTGTTGCACTTGGATGATGAAGACAAAACGTGATTGATTGTCACG
AAGAAGATGATCAACGAGCGTAACAATGGAGGTGTTTGATTCATTCATGTATCATATATC
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TTGTATCGTCAAATTGTTTAATTAATGATTAATTTGTGTTATATGATGGGCGTCCATGGA
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GGTCAGTTGGTGCTGTCCGCAAGCGCGTCCGCGTCGGATTTGTCCAGTGTAATTGTAGAT
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TCGCGCAAATAGCATTTGAGACCTTTTTTCAAGGCCAGTGCTATGCGCCGACGCCGGTCC
AAACTTTCGGCCGACCGTGCGTGGTCCGTACGATCCACCAACCCCGCGGGTCCGTACCGT
TAGATTTTCATGCAATATTTTTTTCGATGCAACAAATTTCGGCGCGATGCAACAATTTTT
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AAAAACGAAGCTGATGGTGCATGGTAGCAAAAGTCAAACGCTGGTTGTAACAAATATCTA
CGTGAACGTGTATGCAACTTTTTTAGCGAATGGTTGCAGCAAAAAAATGATGCCGGTTGT
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CGAACTGAAGTTGCAACCAAACGTATATGCAGCTTTTTTAATGGAACAAATGTAGCAAAA
AAAAAACGCTTACACCAAATATGATGCTGGTTGCAACAAATTTAGACGAAAAAAGTTACA
TGCCAAGTCAGCGGGGCGCACGCTATGGTTGGACGACGCACCGGCCAGAAACGTTTTTTT
TTTCAAACTTGCATGGATAATTTTGCTCCTCCCATACCGTGAGATGATCCAAATCTGATG
AAAGTTGTTGACATGACGCCAACAGTGTAGTCAAGTACAGTTTTGGTGATGCATGCTCTG
ATGCAAATGTGCGGCTATATGGCTGGCCTTGATAGGCACCTTGGATCGGCAATTTCAATT
GGCTATCTCCATCCATAAAGCAGTGGCGAACTAGAAAGGTTCCGTATATCTATCTCCATG
TGTCGTACATCGATAGCGCCTGCCGTACTTATATATTCCTAGTAGCGCATGCGGTCGAAC
CACTCGCTTTTGGGATAGAAGTGTAGAAAGTACTGTATCCTACAGTACTGTATCTTGCAA
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GGCCACAGCCTCGAGGTGGACTTCGTGAACACGGACTACAACCACGACCGCGTCCTCAAG
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CCGGCGGCCATGCTCGGCCCTCTCGAGGAGATGGTCAGGTCAAAGAGGATCAAGTGGGTG
ATCGCCGACGTGGTCATGTGCTGGGCGACGGAGCTGGCCGCCAGGACGGGCGTCCGCGTC
GCCCTGTTCTCGACTTGCTCGGCCGCCACGATCGCGCTCCGGTTGCACTTGTCCAAGCTG
ATCGACGATGACGTCCTCGACGAATGTGGTAAGAGGAAACCGAAACAAATAGAGCATTCT
CTGTGTATTTTGGCGAGTACATGTGTGAAATATTGCAGCCACCGTGAGGAGGAACGAGAC
GATCCAGCTGAGCCCCAAGATGCCGCCAGTCGAGGCAGCCGAGATACCATGGGCTTGCGT
GAGCAGCTCGCCGGACAGACGCAGGGTGATCATTCAGATCTTGCTCAAGACCAACCCGAT
GATACCGCTGGCTGCCACCGTCATCTGCAACACATTCGAGGAGATCGAGTCGGAGGCATT
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TGCCGGCCAACTCTGGCCAGAGGAACTGGCCTGCCTCCCCTGGCTCGACGCGCAGGCCCG
CGGCTCCGTCGTCTACGTGGCCTTCGGGAGCTTCACCATCTTCGACGCGGCGCGGTTCCA
GGAGCTCGCCGACGGGCTGGAGCTCACCGGCCGGCCCTTTCTTTGGGCGGTCCGGCCGAA
CATCACCACCGGAATCGGAGAAGATTGGCTCGACGCCTTCAAGCGCCGCGTGGAGGGCAA
AGGTCTAGTCGTGGGCTGGGCGCCACAGCAGCGCGTGCTCTCGCACCCCTCCGTCGCCTG
CTTCGTGTCGCACTGCGGGTGGAACTCCACCATGGAAGGGCTGCGGCACGGCGTGCCGTT
CCTGTGCTGGCCATACTTCGCCGACCAGTTCTGCAACCAGAGCTACATCTGCAACGTGTG
GGGCACCGGCGTCAAGATCCACGCCGACGAGAGAGGGGTCGTCACCAAGGAGGAGATCAA
GAACAAAGTAGAGCAGCTGCTGGGTGACGCTGGGATAAAGGCAAGGGCGGCTACGTGGAA
GGATGCGGCGTGTACGAGCATCGCAGCGGGAGGGACGTCATATGAGAACCTGCTCAAGCT
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ATATATTCCTCTCGAGTAAGGTTTAATTCAACGTTTTTGCCAAAGTTGAGCAAGTGCAAA
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CCTCCCATTTGGGACGGAGGTGATCAAGCGACACGACTCCGGAGATAGGCCATGTTTTCT
TTGTGGTGTTTCGTAGAGGGGCACCCGCACCCTCCTCTTTTGCATGACGGCAAGAGTTCT
TTGAAATTTTGTCCGTGAGTCTTTTGTGGCTGATTGAAAGGCCTTGAACATGGCCGTGCT
CCCTCAAATCCGTGCTTGCCATACCGAGAAGAGGAGACTCTTCTTCTGGTTTGTGTTCGC
TGCGCTAGTTTAGACCTTTTGGAAGACGCTCAATAAAATGGTCATGGAGCGGGTCTTTCT
CAGCTGGGCCTCTCAGTCTATGTTTTTTTGGGTGTGTTTGTGCTGATGTCCCAACAAACT
ATTTTATTTATTTGCTACACTTGAACTTGTTTTTTGAACACGGTGGTTGCTTTATTTGTA
AAGCAGCAGTAAAAGCCTATTTCAAAAATGCGAAATTGTGAATTCAGATTTGATTTGTAA
ACCGCACGGTCTTTCATGACTCGTGGTCATCGTGCAAAGTCAGGATGACATGGGATGAGT
CTGAATCAAACTGCGGGAGGCAATGAGTCGAAGAAGGTGAGAAGAAAGGCAAGCCGTTGA
CCGAAGCCCCGGTTATCGACTACTCATGTGCGGTGCTAGGCTTAGGCAGAAGCATGCATG
GTTGGCTGGAGCTAGGAGAAAAAGAGGAACCTTTGGATTGGGATCAATAGTTTCCTGAAA
GGGAAACATTTGGGTCCAGCGTCGGTCAAACGCTTCGGTCGGTCTATCTACTCGCTCGCG
AAAGCGAATCAAATCGGAGGGCCCATCATGTTATCTTCTTCTTCATCCCCGCATCCCTCT
TCTTCCTTTCCCCAACCTTCCGGTTGTCATGAAAAATCCTACCCCGACAATCTCCTTTAG
CGAGCCACGTCTTCTTCTTCGGCGAGCACTCTGGAACTCCCCTCGATTTCCCCTCTCTCA
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TTACTACATGCTTCAACCGACGTCAAGATTTGCTACAACCGGCACCGTATTTGGCTATCG
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GTTTCATTTTGCTACAACCGGCATAACGTTTTGCTACATCCATCACGGCTGAGCTGCATC
TCGGACAGCGGAGAGGTTTCACGATCACCATGGCCAAGCTGGGGAACCTTGCTCGCGGTT
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GGTGTCCATCCCCGTCGGAGCTACGACCATCTTCACCGGAGTTGCGACCGTCACCACCGG
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CTGAGGTACATATCGGACAGATGCCGCATACTGAATCATACGGCTGCGCGGTGACCAGCC
GAAACGATTGGGCCGGTGGGACCACGCAGAGTATTGCCCTTCTTAAAATCAACTCCATAA
ATTTTCTTGTAATTGTACTCTAGGCGCTTTCTTTTATCTACGAAAATTATGTGTGGTGAA
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AAGCTTTGGCCAAACATTCGTAATGAGCACACCGACCTCGTATGTCTACAAGAAACAATC
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GGGTCATCACATCCGTCTCTTTTCTCTTAAATACCATGCCACATCAGATTTTTTGTGTAC
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GGCCAATGGTAGACACCGATTGTCACGGAGCAAAAATAATAATCGTAGACACCGAAATAA
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ATTCTCGGAGGAGGAAATTCACGATGTGATCTTTCATACGGAGCACAAAAGTTGTGGCAT
CGATGCCTTTCTAGTGGATTTTATCAAACTTTTAGGTACATTATTATGGTGGACTTGTTC
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CTCATAGCCAACACCAAGGAAGGAAATCTTATTCAACAATATCAATCGATTTGTCACCTA
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AACACCCCACTAAAACTAGTTTGATGCAAGGTCAGAACATATTTGATGGTTGATTTTGGT
GCCTAAAATTGCACATGGGATTCACCGGGGAAAGTTGAGGGTGGTCACCTTAAACATCGA
CTTCGGAAAAGCCAGCGCTAAAGTCAAGTTGCCCTTTCTTCTACAAACTCACTATACGAT
TGGGTTCTCGCCGAAATGGTGTAGGTGACTCTGTAGTGTAGTGGTTGTAGGATATATGGC
CTAGAGACAATACTAATAGTTATTCTCTATCTTCAATTTTGTAATGAATGTTTATGTTCC
ATGCTGTAACTGCAATGATTCCCGAGTCTACAATAACCATGAGGCTTTGAGGGAAACTCA
TGTGCACGTGTGGTATAATAAACGGTAAAATGTTTTCCTAGTTATGCCTCTAAGACTTGC
TCAAGTATTGCAAGGTTATCATTGTTTTCCTGGTCATGGGCAAGACTACGCCGACAATTT
TGAGGGCACAATGTTAGAAGAACATTTGTCTTGAATCGACCCAAACTGATGTTATGCTCT
GAGATACAGTCATCACAAGTAAATGGTTTATAATACAAATAAAGTTAACGTTTGCATAAT
TCCTTAGACCATGAGAGTATCGAGTTCCTAGATGCTTGCTTCATGAACTTTGGGGTTTGT
TAAACGTCGTTTGTAACAAGGTGGCTATTACGACTGCTTACGGGTTCACAGAAAAATATG
ACAAGTAACATGGTAGCTCAAGTTTGGTATTTTGTCCTCTGACAATGCAGAGATATTCTT
AGGGCCCTCTTGGTGTTACGGTATCGGTCATCGTATGGCCAGACACAATGTGATTCGATC
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GTGTGGGCATAGGGATCAATATGGGTGTCCATAGTTATGATATTGATCATTGATCGAAAG
TGTTTCGGGTCATGTCTATACTTCACCGAACCTATAGGGTCACACACACACTTAACGGTT
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AAAACGGAAAGGTACCAGAGAAAACACAAGAAAAATTCCGGGATTCTGGCAAAACCAAAA
GGTTGTTTTGGAGTGACCATTAAGCCAAAAAGGTTTGTGACATACATCTAGAAGTTTTTG
GAAGTGCCAAGATTGTTCTAGGGACTTTTGAAAAAATTTCACACTGAAAACCGAAAATGT
TCCATTCCTGCCGGAAATGTCTTGGTTGCTTTTTGCTCAAGAAAATCATTGATTTGCAAA
TTTTGGAACGCGTCCAGATTTATTTTAGTGGGCACTGGAAATGTTCTAGGCCTACAGAAA
AAGTTTCGAAATTTTTCAAACGTAGAAAAATGTTTCGATGAATAGTGAAAAGCATTGATT
GGTTGCTTTTGGGGGAAATATCTAAAGGGGATCTTCCGAGAAGTTCTATGGATGGCATGG
AAGGCTGGGAACCCCTTTTTTGGGGACCCCACAAGGGTTTGGACAACCAAGGGTGGTGCT
CCTCCATGGAGCTCCACTTGCCATCTTTTTATGCCTTTTATGTGTGACATAAAGTGTGGG
TATTTTGGTAATTTTTTGTGCCAACCATACCGCTTGGTTTTCCTATAAACAGAGGTGGAG
AGGATATCTCCACACTCATTGCGACTCACATACAAATGCAATGCATGATCTGGCTGTCTC
TCTCCCTTCCACCGAAATAGTTTCGTAGAGCTGAAATGTCGTCTCGGTTCTCGCAGGAAC
TAGTTCTTCACGATGAAGCCCTGCAGGAGAACTAACACTATACATGTGCAACCCCGTAGA
GAGATCGTAGTTTTGATTTTAGCTTGAGAGTACCTCCCTAAGGGCTGTCCGAGTGACCGT
TCGAGATTCTGTGAGTGCCTCCCGAAGGGCTATCCGTGAGAACCCCCGAGGGACTGTCCG
GATCCCTCCCAAAGGGCATGTCCAAGGAGCTGACGAGAGAGAACATCCTTGCGGTTGGTA
GGTTGTAAATCTTAGCTACTCGGATTTGCACCGCCAATCTTCATAGACTCTACTTCCACT
GGTTACGAGTCGGTAATGATCAGATCCAAAACCTTTTATGCATCTTCATAGTGATCCTGG
GTGTGCTCGGAGTACCGGAATTTTTTGTTTTGTGTCACATTCCCCTACAACGACATCATG
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TGCTAACAGTTTGTTCAATTTCACCATAGTTAGAGAAAGATCAAACTTCACAGACTAAAG
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CGAGAAGGAAGAGGTTGTACCATTGCTCCTCTTGCGCGCAGGGCCGGGCCTGCAAAATCG
AGGGCCTTGTGCGAAACTAAAAAGTAAGGCCCTATCTCATAAAAAATAAACTGATGATAT
ATTATAATGTATATATATCTCGCAAAAATATTATAATATATAATATAATGTCTTACATAA
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GACAAGTCGATGTCGACGAGTCTGAAATTTGAGAGATTTAGAAGAGGCGAGGAAGGCAAC
GACGACTTGATATAATGAGTAATGACGAGGGGCGAGGCGAGGACGGCTCGATCTAAGACG
AGGGACGAGGTAAGGAGACGAGGGCAAACTCAGAAGTCGCTAGGGCCGGCTGCTTTTCAA
GGCGAGGGCTTGGCCAAGATGACAAAACGAGGCGACGAGTGATGATATGAGGCGTCAAGG
CGACTTCCTGTAACCACAATCGATTATGTTGCCCGATGCCCCGATCCTATAGCCACGATC
AATAACTTCCTTTAGCCACGAACACCGGTAGCCTTTTTTTCTTATTTTGAGAGGCATGTA
CCCTTTTTTTGGTGGGGAATCCCGTCCAGATCGGGATCACGAGAAGTTCGTTCTATCGGT
CGTTGATCGCCTAGACTCTGAGATCTCCAGCCCACTCCGATGCCACCAGGCCCAGTAGCA
GTTAGTTTTTTCTATACTGGGCCTACATAAATAAATTGGGACCCCTCAGATTTTTGACCT
TTGTGCGGGCCACACTTTTGAAACCACTATGGGCTCGGCCTGTCTGCTGGAACACCAACA
TCGGTGGTAGCGCCGGCTGCTCCTCTGCCATGGCGTCGTTGATGTGTGCCTACGCCTGCT
CCGTGGTTAAGCAAGGATGGACCAATGCGAGCTCTGGTACCGAGTCATCGTCTGAACACG
TTTCCATAGTCGCGCTGCCTTCAGATACATCCAGGGAGTTGACCGGCATGCCGGCCTCTA
TCCGCCTAGCACGACGGCTCTACCAACCAACAACATGGGCATCCACCTTGTGATTTTGCT
TTGTCGAGAGGCTCTCCCACAATGCCATACTGCTCGTGGTCGTGGCGGGTGTGGTACACG
AGAGGAGGATGTTGAGCGGACATGACGTGGTGCACTTTGTGATGGGAGTGGCCTCATTTA
AATAGAGGATGTCTGTCAGGCCAAGCAGCACGGTGTGTGGAATACAGGTGCTGGAGTTGG
TTTCTCGGCCGATATGTATGTTTAATGCCGGCAGGTGAACATGTAGATTGTTGTTTGAAT
GTGGTAGATACTCCTCCCATCCTCTCATGTCACTCCGACATTAAATAGGTGTGGAGACCG
GGACGCAGCGTGTGCGGCGCTCTTGGCCGGCGCGTGTGTTTAACTTCATTGCGATGTGTG
AAAACGTCTAGGCCGGATGAAAACGAGGATGGCGCCCTCGATCGGCATGGATGTGCACGA
ACCACTTCTGGCGGGAAAGGGCGTGGGAGGGCGAGGAGGGTTTTGGGTCTGTCTGTGTAT
GTGAGATGGTCCGGACACATGCAAAGCTTCTCCCCTCTGTGTTTACAGGAAAATGAACGT
ACGGGCCGGTCCGCGGACAATTAAGGCTCCGTTTGGAATGTTGTTTCTTTGCCACCCTTG
TAACATTTTACACTTGTATTTTCATCCCGCTTCTAGCCTCCGCTTGGAATGTTGTTTTTT
TTGCCACCTTGGATTACATATCCGTATGTCGAGCGAGGGGGGGGGGGGGGGGG