Map Locations of contig_41750 (8984 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_41750

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_57437 3 2882 bp None Available Available None
MLOC_57435 3 1425 bp MLOC_57435.2 Available Available LOC_Os09g27060.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13109.m02626 protein SNF2 family N-terminal domain containing protein, expressed
MLOC_57436 1 639 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_57437






CDS Structure of MLOC_57435






CDS Structure of MLOC_57436






Contig Sequence (8984 bp)

>contig_41750 8984 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTGATCATCGTTGATGCTGCAAAGTTTCAGATTTTTTTGATTTTGTTTTCTATTTTTTT
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AGGCGATCTGGTTGGCTCGCCTCCTCAACGAGATGCTAAACCAAGACAACACCCTTGCAC
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CAGCCTGCAACTCTCCAGGATGTCTCATCAATGATAGCCTCAAACTCCGCATCAACAAAA
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ACCTCAACCAGCCATTTTCGCACATTTTGGGGATCACGAGCTAGTAAGCTACACATGCAA
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GTCCAACCTTCATTATAAAATGAGTGCCTTTTTCACTTCTGAATGTAAACAATTGTTGCA
TCTTTGGAATGAATAGTGAATAAGCATAACAGGAAACCTTTTCATGTTGTGGACGGGTGG
AAGATCAGGCGGTGAACTGATTTCCATGTGGCAACCCAAGGGTATGAGTTGAAGAGGCAC
TGCATTTGCTATACGAATGTGTGCTTGTGTTTCTTCAGGTGACAAGTGACCCACAATATG
CTTCAGAGCTGCATTATCTCCACTTTTTGTGGAGCCAAATTGTGCAAATGATGTATGGTT
CCACCATGTATCCAATAATCTCTCACTCCATTTGCACCTCCTTATGAAGAACAATCCTGC
GTGAGGAGCATGGTCAATATTTGATGGACGAAATGTCTATCTTACTTTGTGATGAACCTC
CTGTCTATAAGAACGGCAATGTAAGATTGTGAACTATAGAAACGAAATATTAAGAAAAGT
GTAATGAATTATTATGGATGTATGTTTCCAAGTATGCTTCCCTAGGATATTAGTAAGATG
TGAATATCGGTGCATATTCCCTTGGTCGGTTTGCTCTAGCCCATAAATAGTGATGGATCA
GCCTCACTGCACAAATGAGTCATACTAAACTATCATATGCGTATTCTCAAGATACAGTAG
CANGTGAACAAATATTCAGTGTTAATGAGTGTGATATATCACAGAAATTGCCATTGCTTT
GCTTGTCAAATGATTTGGACAAACATAAAGTAAAAATGAACAATGTGCATGTTTCGCCTA
CCGGCATTCACCCCATTGATATCCTCTGTCAGAAAGAGATGAGGAGATGCATCAACATCA
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AACCAGTGTGTCCATCACATCACATAGTTTCTTGTGTAGTAGAACATGGAACCAACAGAG
AGTGGTGGTGAGTAGTGGGTAGTGACCCATGGTGTCGTTCCAGAAGAGCCAGTGGTGGCG
GCTAAGATGTGTGCGGAGGGCGAGGATCTTGCTCCAGGCGGGCA