Map Locations of contig_41619 (6511 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_41619

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_57298 2 1865 bp MLOC_57298.2 Available Available LOC_Os06g48750.2, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13106.m05188 protein DEAD-box ATP-dependent RNA helicase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_57298






Contig Sequence (6511 bp)

>contig_41619 6511 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGGTCAACAACCTCTCGGAGTTGGTTTAGNNNNNNNNNNNGCGCGACGTCCTCACACGTT
CTTAGTTGGATCGTCAAAGTCTACTCNACCAAAACGATAACCACCATCTCATAGAAAGAC
ATGTACAACTTTGCCTCTATCACGGTGCGTCGGCTGCTGGACGCTTGCTTACTAGTTGCT
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TGTTGTCGGCACACCTGGTCGTGTGTTCGATATGTTGCGCAGGCAATCCCTCCGCCCAGA
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ATGCGTTTTTATCTATTGCAGATCTATGATATCTTCCAGCTTCTTCCATCAAAGATTCAG
GTTGGGGTGTTCTCTGCTACCATGCCTCCTGAGGCTCTTGAGATAACCCGCAAGTTCATG
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TTTTTTTCTTGTTATGCAATGTCCGGAAATTTTTGTAGTGCGTAGGCTGTGCCAACTCCC
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TATTGCCCCTCTGTTTTTACATGCTCGAGCTCATTCCTTTTTGCTTCGTACTCCCTCTCT
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TGTGAAACCTCAGACTTATATTTAGAAACCGAGGAAGTATATGTGAGATCATGCCTGATC
CCATGACGGAACTGTACAGCGTTCTTGTCATGCAGCAGCTATTGGCTAGCCCTTCAATAA
TCAAGTAAGAAACTGCAGTTGATTTGTGAAAGTGGCAACCACCGAGCGACGCATGCTAAA
CGAATCCTTCAATCCGGATGAGGCGTATGCAGGATTGGTAGTTGCTCTACCTGATGCTGG
TGCAAATTCTCACCTGTAACAGGTAGATGCATTAGGGACGGAAGCTGCGGTATCTACTGC
TGCTGATATGAGCCATTAAGGGTGACATTTGAAACGGATACTCAACTCCTTGCTGAAGCG
TGAACTCCTTTCTGAAGCGTTGGACCTGCGAAAGGCTGTCATTGAAGACATCAGTTTTAG
TTGGCTTTTCAATCAAATCGTCACTGTTTGTAGGTGTGATGTAAATTTGGTAGCACACAT
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AGGAAAACGTTTCGTCCGTCGTGCATCTTTGCGAAAACACCCTTTCGTTTCTTCTAAATA
AACCCGCAGTCCTTTGCAGCCCTCCCTCCCC