| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_41475
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_57163 |
2 |
1247 bp |
AK371224 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_57163
Contig Sequence (9538 bp)
>contig_41475 9538 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GACCTCATCCATCACCAAGGCAAAAAGATAAGGGCTCAAAGTTGACCCCTGATGCAGTAA
TATGTGAAATTGAGAACGACGTGGATCAGTAAATATCCAAAGAACTAATCTCAGTGGTAA
ATACTGAAGGCCCCAATTTCACTAGTGTTCAAGAATCATGACCAACCTAAACAACTGAAC
AGCCAGCTCATTCATAAGTAATATAACCTAATAACTCCATCATGGTATCATACTATCAGG
AAAGCTTTAGGAGACAACGTTTCAAGAAAAATTAAGAGCAGTTGTGTAGGAAGTAACAGT
GAATAGCAGTCTAGAATAAAAAAAATCAGAGTTCAAAAGGATGATATAATCTGAGAAGGA
AATAAAAATTAAAGAACCTCAAGTGATAGTAATTCATCAAAGCAAAATAAAATAAAATAA
GTGCCCCTAAAAATGGTGGCAACAGCTTAAAAAATTTCTCTTTATGTTTCTTCGGACTGT
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TGACCTTGACTGATTGGACTCAGCTCCAGGATGAAAATGTGTGGTCTGGCCTTCAACGGT
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GGTAACCACTAAAACTCTACGGGGTTATCTTCCCATGAGATAAAGCAAAACTTAGCTTTT
AGTATGCAGATCAATTCACTCACTGATTAAGTACAAGTTCTACAAGATATGGCCAGCAGA
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TTAACTAGTACTCCGCTATGGTACTCCATGTGTTCATTATAAATTTTTGGCCTGGCACAC
ACAATTATTGGATTTGTCATGACAAAAAGATATTGCCAAAGTTGTTAGGTGTATTGATGT
TATCATTGAAATAGAAATAGTGACATTGGAAAATTAAAAATTAATGGTTAAAGACTTAAA
GGCGGGTATTGGTGACTTTGTTGATGTCTGAAAACACAAAGAAACGGTCCAGACAGTGGT
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AGTCACTACAATCCATTATCTTCTACCTTCTTATCCATGATTCCAACAAAAGCAAGAACC
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TGAGAGGTATCCAGGACGTATCAGGAAAGAATCAGTATAGGGTAAGGTATCATATACGGA
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AAATGAGGATTCACATCAAATCGGAATGCATCAGAACATTAAACCAAACCTGTCCATTGT
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AGTTCTTAGTGGCAGCAGCAAGCTCACGGAAAGTGAATGTGTGAGCTGCAATATGTTGAT
TGTTCCCCTCCCTTGGGATAACTGTATCCTTCTTAGATTCCAATAAACCCTGTGGTTTTG
ATTTATCTGAAGCAAAAGTTCATCCAGAGTTAGGGGCCATATATGAATTAGAGAATGCAA
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TATTTTGGGACGGAGGGAGTAAAACTAGCCATAGACCATGTGCAATTGTGCGACTGGTTT
GAACGCTTGCCTTTGTATCTAAAAGCACAACTTGATTCCTTTCAAAACTCTAATACCATA
ACACCAAATATACTTCTATCATTTATACATAAACATGATTAGTAGGAACTGAACTCAGTT
GGTCACAAGTGTGGTTGTGCACATCCACCACCAGATTTTGAATCCTCTTCAACTTGAGCC
TATTTCTTTCAATAACGGTTCCTCCTAAGTAACTTTGCTTTTCGATATTAGCAATAACAA
CCCTGATGTGTATGTATAACTGATCTTTGTCATCAAAACATGTAGTGACAAACTAAATCT
TTATTCATCCCCTGCTTAATTGAAAATTCCTAGCCTCTCAGAGTAAATGTGGTGTCAACT
ATTAACATCATTTAACTACTTAACAATAGATATCGAAAAGGAAGAGGTTGAGGTTATTGA
TGCTTTGGCCAAGAGCAACCTAAGATCAAAATTCAACTTGCCAAAAAAATCTAGATTTGT
CCTAGGCCTTCAACTTACCATAAAAATCAACAATGTTCATCTGGCCTGGTATTTGTCTTG
GTAAAAGAACAGAGACATATTGTCCTAGAGAATGTGTATAATGGCGTAAACAGTTTACTA
TCTGGGGTGAAGTGTGTAATACCATTTAATCCAGTCATTAATGGAGCTAGTAAAAAAATC
ACAGGCTTGCAAGCAAAGCTGGATGTTGCGATAGTTAAGACATAATTATGCCAGAAAAAC
TACAAAAGAACTTAGCTAAGTGTCCCAAAATGCATTAGAAATCAGGGCCATCACAAACCA
GTACTTCTTGGATAGTTTTGGTGGTAAGTTTATCATAGTGAGAGGAAAATAAGTACTCCC
TCCGTCCCAAAATGTAAGATCATTATTGACACTATGATAATGTCAAAAATGGTCTTAAAT
TTTGGGACGGCGGGAGTATCATCTATCACTTCTTTGATACAGTTTGGAGGTTGTACCAGG
ACCATCTACCTTTTTTCAAAACAAACATTGGTGTCCAATTTGTTTGTTAACAGAATTAAG
AGAATGAGTCAAATAGAAAGAATCCTTTCAAAGTTCAACATTTAACCATACGAAATAAAC
ATAAAAGGCACTTCCTAAAGGGAGCTAAACCTCAGTCATCCATCCTTTTTATTTTGTAGT
CCCTAGGGGATTCCAAGTAATAATCTAATTAAACGACTTAAGTCTCAACAGATGTCCTGC
CAGACAGTTTATAAGGCAGGCACGTTCAGACATCCTCAGCATATGGCACTTCTGTCACTC
TACCGAGTCGGAAATTGTAATCATCATAAAATAACCACACATCAGTCCATGAACATATAG
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TCTGAAGCTTCCACTACATGGAATACGTGTTAAAAAGATTTCTGGGGACAAGGGAGGTTG
GCACATTTCTTAGTCTGATCCACTCAAATCTTGACACTGTGAGCATCAGCTGATTAAACC
GGAGAAAATTAAGGACCATTTCCCAAAAAATAAACCAGCCCAAGATCCAGCCTTCCGCCC
AAGAACCACACCTGATCCGACCCCGGTGGCGCGGCGATCCGACGGAACGTCCTTCTGCGC
GGTTCCCTTCTTGACGGGCTCCCCCTTGCTGCTCGACCCGAAGCACGGCAGGCACCCCAT
CCAAGAACCTCCCCTCCAGGAAAAAGATCAAGAAAAGGACGGCGGGGACCGACCCACCAG
AGGAAACGGGGATCCCTCCCCGATCTGGGGGCGGAGGCACTCCGAAAATCCGATCTTTGG
AGGATGTGGAGGGATTTGGATGGGATTTGGGAGCGGTGGGTCGGGGAATTTGGGGGGAGG
GACAGGGACAGAACTATTGGGAGAACGGGCAAGAGAGAGAAAGCGAGGAGAGAGAACAGG
ATGACCGAGGTCCGAGGGCAAAAGTCAGCTCATGGCCGACTGAGGAGTGAGGAGAGGGAG
AGAGAGTAACTCTGTGGAATGCACCGTCCCTCCCCGACTTGCAAATTTGAATCGCTGGTT
CTTTTTCATCCGCAAGTTTTAATTTATTTATTTTTCGAGAATCAATGCATTGCATTAAAC
AGGAAGCAAAGACAAATCGCTCGCCACTAAACCGGATACATACGGATCGAGTCCGGACAG
ACTCTCCGACCATCAGTACACCTCATGCAGCAAAAGTATGAGCAACCTGATTGCAAATTC
TAGGACAATAAACAAACCTACATTCAATAAAATTACAGCGAATGAATTCCTTCAGTTGAT
CAACCACCATGCCAATACAAGAAAGGTCAGTCCCGTCTTCATCCAGGGCCTCCTTCAGCA
AAAGAGCATCCGTCTCCACATACACTCGCCCCATTCCCATCTCACACGTTATCTGAAACC
CAGCCACCGTTGGAAGTTTTGATTTTGCTAACCTGGTAATAATTCGTTCGGCATTTAAAA
TGGCATCTGGTTTTTATGTTGTTGTTAAGTAGTATAGCATACTCCTTCTGTACCATAATA
TTTATTGTCCTCAATAACAAATACTTTCTTCGTTCTTAAATATAAGTCTTTTTAGATGTT
TCACTAAAAGACTACATACAGATGTATATAGACATAATTTAGAATGTATATTTACTCATT
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GAGTATTTAGGAACGGAGGAAGTACAACTCTAACCGATCCCCTATATATAACCAAGTAAA
CCATTGATAAAATATTTGTATTCCACTAATATTTGACCAGACCTAATCGATCCCCTATAT
TTAACGGAGTAAAAGTTAAATTTACATAAAAGTTCAACCTATTTCTGATTTAAACAGCCA
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GCAAGGTCGAGCCAATCTTGCCTTGTCATCCCACCGTCCATTGGGTTGGGGTCGGTGTCG
TTGTTGCCGGAGTCGGAGAAGATGCACCACTAAGGGTGTCCCGGACTAGGGGGGGTACCA
GCCCGAGGTGTTTAGCCCACACGGGCCAAACTAGGGTCTCTCGAGCTACCACGTAAAGGA
CGGTTGAAGTATCAAGACTTGCTCGTGCATAAGATGGAAACTGCCGAAGACTTGATGTAC
ACTCCAAGGATAGTTTTGTATTCGGCATATCAGTAACAAACCTAGCATGTAACCTAGGTA
CCCCGGGAATCTACATAAGTTTGGGGGTTTGGTCCTACAGGGGACAATTACTCACTTTAG
AGTTTAGAGCTTACACAAACGATCTCGAGGTAGATCATCATCTTGTACTCGATACCCCAT
CATCAATACCAAAGCAGGACATAGGGTTTTAACTCTTCGAGAGGGCCCGAATCTGGGTAA
ACATCGTCTCCCTAAGTCTCATGTTACCATTGTTCCCAGATCCACACCTCGGGACCCCCT
ACCCGAGATCAGCCGACTTTAGTACCGACATTGGTGGCCAATACAGGTCCGCTATGTGAT
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GATCTGAAAAAGGAAGAGGAGGAACCCATACATGTGCTTCAAGCACCTTCTCCGGGCATG
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AAAGGATCCAAGGGTTCGGACATCCTGATTAATTCAGAAAATGCTACATTAGAACGTTCC
TCCCCGAATAAAAACATTGGATCCTCAAAGCCCACATCTGACCGAGGTCAAACTTTTGAT
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CGTGGCTTATTTAAGCAGAAAGCCGACGATACTGCCCGGCAATTCTGGTGTAGGTTCCTC
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NNNNNTTGTTGAAAAGCCCGAAGGCGAGCAAAACATCATTGGTATAAGGTGGGTGTTTCG
AAACAAGCAAGATGAAGATGGACAGGTTGTACGCAACAAGGCACATCTCGTAGCCCAAGG
ATACANNNNNNNNNNNNNNNTGGACTACGGTGAGACTTATGCACCTGTTGCTAGACTT
