Map Locations of contig_41395 (9703 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_41395

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_57071 1 555 bp MLOC_57071.1 Available Available None
MLOC_57070 1 653 bp None Available Available None
MLOC_57069 15 4798 bp MLOC_57069.4 Available Available LOC_Os04g20990.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13104.m01936 protein tRNA-dihydrouridine synthase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_57071






CDS Structure of MLOC_57070






CDS Structure of MLOC_57069






Contig Sequence (9703 bp)

>contig_41395 9703 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CAATAAATGTAGCATCCTCCTTCTCATTGGACTTGGATAGTGGATGTAGAAAACGATGTA
TGCATAACCACTCATCTCCTTTCTCTAAACTCTATGTATTAAATATGGCTTGGGACTCAA
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AGTACCTCGATTTTCCATTAAAGTCTTCCAGATATTAGGAAATGAATTTGTGCCGCAATC
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TCTTCGCGTCGCCAGGTTTAACATTAAGCAGAGTCGATTTTTTTTGTTTTATGACCTATT
CTTCTATTGACTGAACTCTGCTTTAGATCCTTGAGAGCTACCAAGTTTATGGTGATTCTA
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TCTTCTTTCCGCTTTCTGCTTTCATACAAAGAGTTGATCTACATTTAATGACACAGATAG
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TTAGGTTATAGGGGTGGAAGGAGGGTTGGCGCGGCTGGGGTGCGGCCGGCGGCGCTGAGG
CGCAGTGATCGCGCGAGGGGAAGGAGCCATTGCGGCGGCTAGGGTTTCGGGTTTGCCGGC
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TCTGTATTTTGTTGAAGTTCTCTTAATTTGAGGGCTTTAGTGCAGTCACTTTGTAATAAT
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CGTTTGCTTCTATGCATTAAATAGCAGTGCATACCTTAAAATAAAAACAGAAAAAGAGAG
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CTGCTATGTCACCTGTATTAGCATTTTCATCATTTTGTACATGATAGTCCCTCCGTTCCT
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TAGTTTGTGGAAACGTAGGGCTGATTCTACGTTGCGCCATTGCAAGGTAAGCTATCAAAA
TGAGTAAACTCTTTGCTGGCCTTCTCTAATAATAGCAATATCCACACCGTAACACGTTCT
GATGCTGCTCTAAGTAAAAAATGATGTTGTGCTTCTCAAACTTTAATAAACATCTGCATC
GTTTTGACAAGACAACTGCGCCGTTTCTGAAATACTCCCTCCACCCCATAATATAACAGC
GTTTTTGGCACTACACTAGTGTCAAGCATGCTTTTATATTATGGGACAGAGGGAGTACTT
GTTTGGATCTTTAAATCATTTGCTGTGCTTTTTGGATGTGCAGACACTTGCACAGTTCTT
GGAGGAAACTCTTGACGCCATTCCTGACTCTGTCCTTGACGCACCTGTATTGAGGGAGCC
ATCCAGGGAACAAGACTACTTCGCCCATGTGGATTCCTTATTGCCGCCAAGATACGCAAC
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AGAAAAAGCTACTCCCTCTCATCCATATTAATTGGCGCCGCGCTCTAGTATAACTTTGTA
GTTTTTCCCAACTGCAATTATTTAGGTATAGAGGGAGTAATATGGATTGGAGCGGGTAAA
AGATAGGGAAAGCTGCATGCTGCCTTCAGTCATGTCGTCGATACTTTCTTCTTCTGGGAT
AACAAGCTACACATTACATTACTTAGGAAGAGGATTACAATAGTCTCGGCAAATACATTA
CGGAACTTATAAATCCCGAACTTGCCACGTTTTTGTCTAAGGGTTGCAGCCGTATTTTAT
TAGAAAGGAACAGAGCTCTTGTAAGGTTTTATAGTCTACTAGATGACCCGTTGCGCCGAT
GGCGCAAAGGGCTAGGGCAAACCAAGCATTCAAACCATGTGTGTTACAATATTTAGATGC
CGCTTGGATCAAAAGGAAATAGATATTTAGGTATGAAGTTGATACATAGCATCATAAGAA
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GTAGAAATGCCCATAGATAGCTTCAATCATTTAGCCCGCGATGAGTAGTGAGTAGTGATG
AATATCACGTGGAGTCATGGTTGCACGTGCCACCATTGCCGATATCATCATCCAGACCTC
AATAATACTTGTTTGCATCGTGTAGAATCTGCTCTGATGTTAAAATAGCATCATTAAGAT
GATGTGCAACATATCTTATCCACGACAGAGTATGACCCGTTGCGTCCCTGGCGTAAAAAA
AAGCGAGAGCAAACCAGGCATTCAAACCATACAAGTAAGATTAGTTTAAACTGATAATAA
AACATGAATATATATGAGCAAGGCCTTATGAACATCAATTAACTAAAATATCTTTGGTTC
TAATGGAGGTACTGTCAAAAACGTAGCAAGCAAACTTGAGTGG