Map Locations of contig_41270 (8402 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_41270

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56945 1 2334 bp AK357263 Available Available None





CDS Structure of MLOC_56945






Contig Sequence (8402 bp)

>contig_41270 8402 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCGCCCCCGCCCAATCCATCCGGTCGCCATTTCGGTTCCCCAATCTGGGTTGATTCG
ATAGAGCGTCGATTCTATGGCCCTAGGTTTCGGTTCTAGGTTAGATTCGGGGTATGCTGG
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GTAGTAGCACATCACTACATCTAATCTAATACGGCAGTACATCACTACATCTAATCTAAT
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TGGGGACGCCATGGACAGGGAAGCTACCGGAGGCTGCTGCTCAGGGAAGGGATGGCTCCA
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TATGCTATTGAATTATACAGTACCGAATATGTTCATCAGTTTGAAATGGTAATAGCAATA
GCAATTGTAGGCAAGCAGAGCTTGTGTGACAGTCTGACCTAGGTCCTGCTTGCATTGTTT
ACGCTTGAACACGATACCAAATTTAGATTCAGAGACTTCTATCTGATCTTAGCTCAGAGG
TGAAAGTAAAATTGAACTAGGTACAGTGCAGCTAGATCTTTTTGGAAAGATCAAGGATGA
GGTTTGTTGATCTATTTTCTTTTGTAGGCATTCATTGACAAATTCCGATACAATGCAAAG
AGAGCATCACTTGTTCAATCAAGAATCAAGGTACATTTTCTTGCTCCTGTTTCCATGACC
TCATCGTACAATGCATAACTTTTGTTGTTGTTTCACTTTACAGATGATTTAGAGCACCCA
ACTAATATTTTTTTACATACTTGTTCAGTGAATAAATTGATATTTGTCTTCATCTTTTTT
ATTTGCATTATCTCAGGCATTGGAGCGAATGGAACATGTTGATGCTGTTGTTAGTGACCC
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ATTGCCTGGTTAATCATTTGCAGCTATAAATTCGAATTTCCAACTCCAGATGACCGCCCT
GGACCACCAATCATTAGCTTCAGGTTTCAGTTCTCATCCCTTGCCATTTACCATTTATGG
ATGCTTGTTCTGCTCTTCCCATGCGAACCTCATGGGTCATGGCTTCTTATTCTTTTACTC
CCTTTTATTTTTTATCAACCACTCTACCATTTCTGTCAAGACATAGCAGTTAGTTGTATA
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GATTTTATCTGTTGAAATGAATGTTTATATGTTTGATTTGTGCAGTGACGCTTCATTTGG
TTACCCTGGAGGGCCTATTTTGTTTAAAAACTTGAATTTTGGTATCGACCTCGACAGCCG
CATAGCAAGTAAGAATCATTTGTTCCAGTCATATTTTATTTACTGTAAAGAATAAAATCT
AGCTTTTGCTTCAGTGGTTTGTCCATTTTTTCCTCACATTTGATTTACTATTTCAGTGGT
TGGTTCAAACGGTATCGGGAAGTCCACTATACTGAAATTAATATCTGGAGACCTACAGCC
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GATATTTTACCGCTATATAATCGTACCCACACCATGTTAATTTGTTCTGCACAATTGTAC
TGCGTTCTCCTTGAGTGTTTAATAATTGTGTAACCAGCTGCCAGTGTCGGCATCTCCTGC
TTCACTTTTCTACTCCCTCCGTTCTCAAATATAAGACCTTTTAGACATTCCACTATGAAT
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TAGTCCATAGTGTAATCTCTGAAAGGTCTTATATTTAGGAACGGAGGGAGTAGGTGTTAT
GATGTTTGCATCCATGCCATTGTGATATTATACAGAAATTTTTGAAACATGCACATGTGA
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GCTCTATTTGGTACTACCTCCGTCCCAAAATTCTTGTCTAAGATTGATATGGATGTATCT
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ACGGAGGGAGTATTTAACTTGAATATACATTTCAGCTCTGATATGAAGAAAGCGTATTAT
GGTCTGTCTGGTATTTTTTTAATTGCATATTTCAGCTGTAATATAGAAAAAGAAACATTA
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AAATCTTGCCCTCCAATCTATGTACACTTTATCAGGTATGTAATAACACAACAGTCTCCT
GGATGGATTTAGCTGATAGCTCATTGGCAGCTGCGACGAGTTGAAGCTTTCCTCAGCTTT
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GATCCTAGTTAATGCACATTTGCAATGGCAGGTGGTCAGAAGAGTAGGGTTGCGTTCGCG
AAGATCACCTTCAAGAAGCCGCACATTATCTTGCTTGACGAGCCTTCTAACCATCTTGTA
AGCGAACCACCTCATCTTCCCTCCTTGCCCCATACCTCCTTGTATAAGCAGAGATGAGAA
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ACATTGCCACCACGTTGCATGTTGTTCCTTTTCGTGTGGTACAGCATCACCCTAACCAAA
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GATGCTCACGACATAAACCTGGAAAAAGGACAGGACATAAGGGAAGATGCCCACACAGAC
ATACAGAGAGTATATGTATGATATGTACGCCCTGGCATGGGAAACTGATGTAATCTTATG
CTTATTACCTACCTGAGGTTCGAAGGTTCGACCGGAACTAAGCTACTACATACAATTTTG
TTTGATCCAACCTGCCCGACAATTTGTATCGAGCTTGTGCTTTTCTTGGACAAGCTTTGG
AGTTGGAGGTGGTGAAAGTATGCAGTATGGGTACATACCTCTACTTGTTGTACAACACAT
GCCGCCAACACAGCAAGTAGATTTTTCATTTTTCTGACCAAACCGACGTTGCTGCTTGGC
CCTATCAGACGTCCCTATTGGTTGAAAACTAGATTAGCCCAAAAATATGGAAAGTGATAT
CATGAACAGTCCGTTACTTACGGCCCAGTCAGCCCATCAGCTTATAAACGGAGTGAAACA
TTATCGAGAGTCACTAGTTAGCGAGCGCTCTTTTCGGAGCCTTCCAGAAAGCACTCCCGC
GTGCTGTCGGCAGATAGAAGGCATATGGTAACACAACTAGACAAAAAGAGATCCGGAGGG
AAAAAGGCGAATAAAATGGTAAATTGACGAAGTGGGGAAGAGAAAAATGAACGGCAAATA
ATGTAAATGCAATAGATGAGTTTGTGATGGGTACTTGGTAGGCTTAATCTTGCTATATAT
CCTCTCCAGCAACGGCGCCAAAAATCCTTCTTGCTACCTTTTGAGCTTGCGTTGATTTTT
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