Map Locations of contig_41169 (9361 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_41169

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56808 3 1635 bp AK355889 Available Available None
MLOC_56809 1 195 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_56808






CDS Structure of MLOC_56809






Contig Sequence (9361 bp)

>contig_41169 9361 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCTGCTCCTGCTGGTAAACCGCCTCCACACCCTCGCACGAGTGCCGGCGCTGCCGCTGT
TTGGGATTCTAGACTCTGACGACGCTTCTGCTGCCGGTTGTTTGTTTGCAGGGGGTGATT
ATTCTGATCGTCTATTTCAACAGCGGCTCAGGTGGGTTGCAAATTCCCAGCTTCGGTACG
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GCATTTGCATCCAGGTTCTTGCACATCAGAAGTTATCCAGGCACTTCCTTATCTTAAAAA
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AGATATTTTCCTTCTAATTTTTTTCATCAGATGATAGTTTTGTTAGACCTAAAATTTACT
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AATCTTCCACCTCAGCTCATAGTATCTTGCTGCGGATCGGGGCAGCGCCTATCCATGACG
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GTAGAGAGGCTTTACCAGCTGTTGCTAGATGATTCTTTCTGGAGATTAAATTATGTGTTA
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GTGTGATCTCCTCCTCCCATTGACTAATTCGTTCGGTTTGCAAGCTAAGCAAGGCCGTAA
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TCTTGGCGTGCGTGTATGGTATGGATGACCTCAGGGTGTTGTAGTAGTACTTAAGGTTTT
ATGGTTTCATACCGCAGAAAAACATGCTGGATCAATAGTGATCTAAACGTTCTTATATTT
TTTTTGTATATTCGTAGTATGTTCTTATTAAACAAAGCGATGATGTTGCTGGTGTGGCAC
CTCGAGGTTTCACTGATTTGGATTGAATTGGGAGCGTCGGCGGCAGCATTTGTTCCATTC
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TCATAATGAATGCTTAAGCCTTCTATCCCCTCTGTAAACTACTTCATTTGTAACAAAATA
TTTGTAATTTTAGTAGTTAGCCTAGCTACTAAAACTAAAATTACAAAATATTTCGGCAAA
AAGGAAGTAGTATAGAGAATAAACTCCCCCCCCTCCCTGCTTCACTCTCCCTGGCGATTC
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TCTTTGGCCATGGTGTGGAGGCCTGTGGCCGCTGGGCTGGCTCGATCTGGCTGCTTGGGC
TGCAGGCGATGTGGCGGCTGTCGTCGACGGTGGAAGCCGGGGCGGCGGCCCCGGACTCGG
TGGCAGCGCTGCCTCTCCCCTCCTGCTGTTGGGGGCGTATGGGGCAACGTTGGGGTCGGC
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GGGGTGCCTGGGTCCCTTCCCTCGACCGGGGGGAGCTGTGGAGGTGGCGGCGAGGTGCAG
ATTTGGATGGTGGCGCGGCGGTGCCACGATGGTGGTGGTGCGCCGGTGTGGAAGGATCTG
GACGACGTACTGGTGGAGCTACTGTGATGCAAACTACGACTCTCCCAGTTGTGGTGGTTG
ATCTGCGCTTGCTGCTTCGGTGTGCGATGGGTTCTACGATCTGGGTTGGCAGAAATCCCT
GCTTCGATGAGGCTGACAACGGCGACACCCGCGGGCGTCGTTCACTTCCTGAAGGCGTTG
TCTTGGACCAGATCGGACTACCTTGCTCGAGCTCGGGGGAAACCCTTGGTCCATCCTTCG
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CAGGAACATCGACGGTGCGACTCGAGTCAAGATCGACGGCTCTTTGGGCGTGGGCCTCCT
TGGCACAATGTACGCCATCTCCGGTGTTCTCTCGACGACACCTTTCCTTGGTCCGCCCAA
GCCTTGCCGTTCACTTGCCGACTTTCTTTTGGCGCAAATGGGTGGCGGTACGTTGGTTTG
TGTTGGCCTTTGGTATTGGTCTTGTTGTAGAGGTCTCGGTGTTGGTTGTGACGTGACTAG
GTTTCTATGTGGCTTTCCTTGTTGTCTTTGGCATAAGGTTAGACTTGGAAAGCTTGTATC
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CTCTTCCAAGATGATTTCCACACTTGAGAAGTGATCCAATCTGCTCTTTTTTTAGAAAGA
TTGAGACTTCACGTCATGTGTTTTTCGAGTGTGCTGTTGCCAGGGTTGTTTGGACATCGA
TTGGAGTGACCTTGGGAATAGATTTATGTCCCAGTAACTACTGGCAATTCTTTTCGTGGT
GCTTTACTTTACTTCTTGGAGATGAACGCTTCTATACCGTGGCTCTTGGAGCAGTAACCT
GGGCTATCTGGCTGGCCCAGTATAAAGCCACTTTTGAAAATAAATTGATCAAATCTCCTT
TCGAGATAGTGTTCACGGCCTATTCGTTTCTTTTATATTGGGCATGGCTTTACAAAGGCG
AGGATGTGAAAAGACTTCGCATTGGAGCCGAGATGATTCACAATGGGACCATGATGCTGA
TGAAAGTATGTGACAACTCAATGAAGATCGGTGCGGAGTGGTGAGGTCACCTCCGCCTGG
AGAGAACTGAAGTAGGTTGCCTGAGAAGCCGTTGAACGATGAATCTTCTCTTTCCCTGCT
TGTTGCTGGATTTCAATCCTGTGTGCTTGTACTTTTGTTGTACTGTTGGTTGCCTATGTT
TGTAATATGTCTAATTATAACTCTTCGTGTTGTCTAGGTTTTTGCCTCCATAACGTCTGT
TTCGATGACGGGCAGACGCGGTGGGTTTTCTAGCAGTGCTTTGAACTCGCTCTCTCTCTT
ACCTTTTTTCTTTCTAGGTGATGTAAGACTTTGTATTTCCGTTTTATTAATGGAAAGGGG
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CGTAGCAAGTAAAGCAATTGTGGGGGTTTCCTTTCTTGTTGCTGATTTAATTTGATCCTT
TCATTCGGGGCACACGCGCCCTTCCTTTCCATAGTTGCTCCTTCCTCGTGAGCTTTTACC
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ATTCTACTCGATCTTTTACATTAATTCATTTTATCTTCATTTTATATTGTCTTCAGTGTG
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GGCTTTAAAACTAGATCCTACATAAGATGTTCATACATTTTCCACCTTAGAAGACATCAC
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GTGTTGGTAATATGCCTATCGGATGGTGTGGCAACTTGTTAAAAATAACATGATGGCGGC
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TTCCTAGATCCAATTGATCCTGGGTTGACAAAATAGTTGAGCTAGAAAACATTTTTCAAC
CGAAAATAACTTTTACTTTCATGACATCAATATGTCATAATTTTTATCTCCGTCCTTGTT
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GAAATTGGAGTTGTTTTGAGTCGGTTAGTCTTCAAAATTGAATTTTGTTTCAATGCTTTG
TAGTTCCTATTAACTAGTTTTAGACTAGTAGCATTGGCACTTGTAGATACTCCCTCTGTT
TCTTTTTAGTCTGCATATAAGGTTTGGTCAAAGTCAAGCTTTGTAAAGTTTGACTAACTT
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