Map Locations of contig_41168 (10452 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_41168

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56807 1 338 bp MLOC_56807.1 Available Available LOC_Os02g13140.1, FRAME:+2, EVALUE:5e-65, 13102.m01457 protein xaa-Pro dipeptidase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_56807






Contig Sequence (10452 bp)

>contig_41168 10452 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTGCCATTGTCAAACGGGCCCACGCAATGCCTCTAACCCTCGATTCAACAGGAGTCAAA
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GTGAATCTTGAATAATCTTTGTCTTGAACTTAGTTTTGGGATATAAAGGGGACTTCTTTT
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CTATGTTTTATTGTAATGTGATGCTAAAACTTCACAAAAGTATGCAATGTGCAACATCGA
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AGGGAAACATAGGGATCCACAGTTTCACGAAGAGAAACAGCTTCATGTCCACAACCGTAC
TCACCGTAACGATTAGTGTGCATACTTCAGAATTTGCATAGAGCCACCATTGCATGTAGT
ACTTGATCCTAATACATTTCTCTGTAACTACATGGGACATAGTGGCTAGTACCATTACCA
TACACCCATATATTCTGAAATTTGCAGAACTCTTCAAATTGTCAGTTGGACAGTTTTCTC
GGATGATGATCATGCTATTTCATTTTCTCATAACCGAGTTCGGCTTACCCTGGCATTTGC
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TCACGAGCCACACTTAAGATGTCTCCTCTTTCTTTGCATATGTGTAGGTGTAGTTTAATG
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GGTTCTAATGTGATGACACACTTGTATTAATTTGGTCATTTCTCTATTCATGATGTTTTG
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GTTGGACCAAGCACGGAGAAACAAGGGTTATGATGGAAGACAATGAAGAAGAAGAGGATG
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GAGAATGCGAAAGTAAAAGGGAGAAGTTGAAGTTCGANNNNATGTTAGAGGATCACAAAA
ATGGGTTGTACCCAAATTACGAAGATTTCAACACAAAGCTCCATATCAAACTGGAATTGT
TGCAGTGGAAGGCAGATAATGGTTTATTTGACAAGGGATTTGAGAAGCTATGGAAAATAA
TGGAGAAGAACCTTCCAAAGGATAACGAATTGTCTGACAGTACGTACGAAGCAAAGAAGG
TTCTCTGCCCTCTAGGATTCATGGTGCAGAAGATACATGCATGCCCTAATGAATGCATCC
TCTATCGCGGCGAGGAGTATGAGAATTTGAACGCATGCCCGGTATGCGATGCATTGTGGT
ATAGGAAGAGACGAGATGAACCTGGTGATGTTGATGGACAACACCCTAGGAAGAGGGTTC
CTGCCAAGNNNATGTGGTATGCTCCTATAATGCCACAGTTGAAACGTTTGTTCAGAAACA
AAGAGCATGCCAAGTTGTTGCGATGACAGAAAGAAGACCGTAAGAAAGACGAGATGTTGA
GAGTAACCGCTGATGGGTCGCAGTGGAGAAAAATCAAGAGAAAGTGGCCGGAGTTTGTAG
ATGAAGCAAGGAACTTATGGTTTGTTTTAAGTGCATATGGCATTAATCCTTTTGGGGAGC
AGAGCAGCAATCATAACACCTGGCATGTGACTTTATGTATCTATAACCTCCCTCCTTGGT
TGTGCATGAAGC