Map Locations of contig_41164 (13260 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_41164

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56803 4 2914 bp AK362010 Available Available None





CDS Structure of MLOC_56803






Contig Sequence (13260 bp)

>contig_41164 13260 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTACAGAGTGGATTTCAGTCGGTACGTTAAATATGCTCCGAGTGCTCGTCGCTGAGTGGA
TGATGGAGGCGTCCTTAGTTCATTCAGAACTTTCTAAGGGCCTTGTCCTCTATGANGGGT
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GGTAGTATAGGCTGATGTACATAGGGTTTCCTCGTTTGCATGTTTTGTATGAATTTAAGG
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TGTATGCACGAGAATCCTCTTGACTAAGTAAAACTATTCAATTAGAAAATGTCAAAAAGA
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CAAGCGATTTCTTGAAATGCCGATAAAACACGTCTAAAACTATTCACCCACGAGTGCATC
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GGTCAATGTCCTTGCGTTCCTTTCTAAAAAAGAAATGGAAAAATAATTTGTATCCCTGAC
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TGCTCCAGTGGCAGCGCACCGGATTCCATTTCCAGCCCGAGAAGAACTGGATGAACGGTA
CGTGCACGATCCATCCATGAATCCTTTCCTTTTCGGCTCGACTCAGATTCACATTCCATT
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GGCCTCCTCCACTCCGGCGATTTACATCTATGGATGGATGCATGCATGCAGATCCCAACG
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GTGTCTCGTGTACATCTACGCACTCCTTTCCTTCCGTTCCATAATATAAGAACGTTTTTG
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TGTTGTTGCAAATGCAAATTTGACATCCGTTCAAACTCGATCGATCCACCGGTCCTAAAT
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GTGGGGGCACGCCGTGTCCCGCGACCTCATCCACTGGCGCCACCTCCCGCTCGCCATGGT
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CGCGCTCGGCCCCTTCGGACTCCTCGTCCTTGCTGACGGTGCCCTCCAGGAGCAGACGGC
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GCAGCGGGACTATGATGATGATGATGATCATATTGATCAATCAATTGTAAATGGAATTAT
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GTTGAGCCATTGTCTAATCCTCAAGATTTTTTTGTTTGGTTGAGAAATGTCTGATCCTCA
GGTGCACTGTCCTGACAGATTTGTGGCGTTATTGGGCTGGGCCAGAAAGCCGATTTCATA
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ATTTTTTTTCTAAATCATGAACTTATTCCAAATTCACGCTCTTTCTTATATTCATGAGTT
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TGACGTGGATAAGATGAATGAGAGGACAACTTACCTTAAGGCGAAATATGATTTCATTTC
CGAGGCTACCATTTACAATGAAGTAGGTCACACATATGTTGCTTGTGCAAATTGGAGAGG
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TCATATGATAAATAAATTTGGGTGGATCTGGACATGATTCAAATTCTACCTTCTTGTGAC
TTTGTTAAATAATTGATATTTCTTATTTAAAAATAGTTGCTATTCACCCCTAACTTAATT
CGTTTATTTATAATTGAAAACTTAGTTTTTATCCTCAATAAATACATCGGATATAACAGA
CAAGACCTATTACACTATTGACTCAGAGCTTACTTGGGAGGGGAAGAATTATATTTTCTC
ATTTTTTAATGATGTCCTTTCGTTTAAGGGCACTTATGTAGCTGACCAAAATACTACGTC
CTCCGTTTTTAAATATAAGATCTTTTAGAAATTCTTAATATGGACTACATACAGATATAT
ATAGACATATTGTAGAGTGCACATTCACTCATTTTGCTCCGTATTAAATTTATATTGGAA
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AAGTTGAGCCATACTAACACAAGCTATGCCAAATGAGTCCATCATACCTACCTTTATGCG
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TCTGTTTTGTGTGCTCGTACAACAAACAATGGGTTTGTAAAGAGAATATGATGTTTAATT
GTTATCATACATATGCAACGAGAACAATTGACTTTGTAAAAGTTTTCTTTATCACTTTCA
GTTTATCAACTGAATTGCTTAAGGGCAAGCAATGGGTTAAGCTTGGGGGAGTTGACACGT
CTCAAACATATCTAGTTTTCCAAATATTTTTCCAAATATTTTTGCTCTTGTTTTGGACTC
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TGATGTTATTTTTATGCAGAAATAAAGTTATTGGAATTGGGCGAAACTTTTTGTGTTTTT
TTTGGAATATATGAACAATTATAGAGCGAAGACCTGCCAGAGAGCGTGCAAACCCCCTGG
GCGCGCCCTGTTAGCTTGTGGGACCCACATGGCTCCCCCGACCGTAATTTTAGTCCTATA
AATTCACAATCACGGAGAAAAAAAATCAGAGATCATTGCATTTTTAGAGACGAAGCCACA
TGCACCCCTTGTTTCTTCATTGGGAGGGGTGATCTAGAGTCTGTTTGGGGCTCTGAAGAG
GGGGATTCGTNNNNNNNNNCATCACCAACCCTTGTCCATCAACAACTCCATGATGCTCAC