Map Locations of contig_40984 (10681 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_40984

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56605 3 2134 bp AK360734 Available Available None





CDS Structure of MLOC_56605






Contig Sequence (10681 bp)

>contig_40984 10681 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAACATTTCCACCTCTTGCCTTGCACAAATGGGCTGCATGGGCCTCTAGGATTTATTAAG
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TGGAACATGGTTTCATGCGCACCAGTTAGAACAGTAGATAAAAACATACTAGAAGAAAAT
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TGTGGGGATCAAGATGGGGTTGGTTATGTTGGGATCGGCGAGCATTCTGATCTCTGCAGC
AGCATTGATTTGATCTCTGTCCGTACCTTTTTAAACCAAGTTATACTCGACTGTGTAGCG
CAGTATGTCGTCGACGTCGTCGTCGTCGTCGCCGTCGACCCGTCGTGTCGTCTGCAGGCA
GCGCGCGCACGCGTGCGTGCGTGCGTATATGCATATGCATACGTACGTGCGCGCTTTCTT
CCTCCTCCTGCCGCCTGCCTGCCTGCCTGCCCGCCGCTTTCTTTCCTTCTCTCTTTACCC
GTCCATCCATCCGTCTTTCCGTCACCCATCATCGATCCACCACACCACACCCCCCCTTGC
TTTCAGCTCTTGTTGCTAGCTAGGGTTCGTTAATGGTAAATTTCTCCTTTCCTTTTGGTC
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TGATTTTCATATCATGCCTTACTACTTTTTTCTGCTCAAATGATCCTTTTGAAACCACAC
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CATTTGTTCACAAATGTACGATTTTTGGCCGCTTATCGCATATAATATCTTAGTGGATGT
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GCTTCCATGTTACTACAACCTATGCAAATGAGCAGAGGGGGGAGGGAGGGAGATTACTGC
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TACTGACGTATTCTTTAAATAAAGGTTATGTTGTTTTGGATATATAGTTAGCACAATATG
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TTTATAAACATAAGCACAATAAAAATGGTTTTATTTGAGTAAAGACAAGGCTGAGAGAGA
GAGAGATCTTGCATAACTGGAATCATGCATTAGGTTAGTTGAAGCATAATTTTGTATTTT
TCCCCCCCCCCCCCCTCACCCTATGTTTATAATCTGTATTACTTCGTCCGACTCCCAAAA
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CAAAACATTTTTTACTGTGGTGTGCATATAACAATCAAAAATACTAATACTTGTGGAAAC
AATGTATGCATATGATTTTCAAGTTCCCAGCCCATATTGCAAAAACATATTGGTAAAAAG
AATATAAAAAATCCCAAATGTTATTTTCCCATGAAATCAAGAGAGCACTATGCTTTTTTA
TCCATCATGAACCAAGAGGATATCACTATATTTTGCTCTTCAAATATATAATTGTTAACT
AGTCCAGCACATTTTTTGTAATTGTTCTTAAATGTGGCACCTATGTACTAATAAGCGGAG
CTACTATGTGCGCATACAAATTATAGGCAACTTAATTCCATTCTCTTTCAAATGCTTTTT
GGAGCTCAGCCTCCATGGACGCCAGTTTTTGAAAAACCCAAAATTCATTAAAATTCATAT
TTTTACAATTCAAAAAATATGAAAAAATCCAGATATATATGGAGGTATAAAACACATGTG
TGTAATTTTTTAGGACGAAATACATTGAAATGAGGGTTCTGCAAAAAAGACAAATCTGAG
GCTTTTCAACACATGATACCATTCATCCTCAAAGTCCAAAAAATTGTGTTTTTTGTACAG
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AGTTGAAAAGTTTGAATTTTTTATTTTTTAAAAATAAAGGGCTCCATGAAGCTCGGTCAT
CAAAATGCCCTACTCATATTTACATATCATATAAGTATGCGCGCGGGGGGGGGGGGGGGG
G