Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_40746 (6596 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_40746

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56349 4 1640 bp MLOC_56349.1 Available Available LOC_Os02g44520.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13102.m04971 protein OsSub19 - Putative Subtilisin homologue, expressed
MLOC_56350 1 966 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_56349






CDS Structure of MLOC_56350






Contig Sequence (6596 bp)

>contig_40746 6596 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGTAGTCATCCATGTAAGGACGTGATAAACATGCTCCAAAGCTCATGCGCATGAGGCTAT
TACAAGTTAACAACTTGCGTAGATGGTGGTTGGAAGGTTTCTTCGTTTGGGGAAGAGCTC
AGGCAGGTTACATGGGTATAGCTCGAGTCTCGGACGATCTGTGATGGATCTGACTCTGGC
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TGTTTTTCTTTTTATTATATGTACTCCTTGTAGATTACACTTTGCATGATAGCTATTGTC
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GTAGTTACCTAGTTGTATACAATTACTGCTGCACCTCTTCTTCTGGTTGGAGAAGCTAGG
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ATTTGTTTTATTGACCTGCTTCCTTGAATTCTTGTATATCCAGCACAAATGCGATCTGAT
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GTGCCTGAGGAGAAACTGACAACTGGACATGGGCTTTTGCAAGTTGATAGGTTAGCACAA
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TTTGAGTACAATCATCATACCATTGCTGTTTTCTCAGGGCTTATGAATATGCGCGGCAAG
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TGCATCATATTTTCCCATAATAAATCTTCTTCTGAATAAACTTATGAGTTCCAACAGAAA
TTAATAAGAATGAAGAATGACCTCTACTGAACACTACAGCCACTCAATTTTTTCTGAAGC
ATTTTTTTTTTCATTCTGTTTTCTTCGGAAAAGCTCTTCTGAAGCATTTTAAGCACAGAC
AAGTCACATTCATCTAACATAATTGAAACATGAAAAAAGAAATCAATTTTTTGGCATGTA
CAAGTACAACTTTTTTACATGTACAAGTACATTTTTTTACATGTTTATTTACCTTAAAAT
GTTTTGTGGAATCAAATCATACTCCCTCCGATCCATATTACTTGTCGCTCAAATGGATGT
ATCTAGAACAAGTAACATGGAACGGAGGGAGTAATAAAAATAATGCAACTGTGCATACAC
ATTTTTTAATCCCCGTACGTCCGTCATCCTTAAAATGTCATATAAAACTAAAATATATTA
TTAGAGAAGTTCTGATAACTTCTCATCTTGAGAGCAAAGACATGAACTACCTTTTTGATG
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TTGTACTAGAAGGGTTCGTTGGTGTTGTTAGGTTTCTTAAAAAGATACTCACTCTGTTTC
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TTCCATCAGTTCGGACTTTTGGTTGCGTTGGCTAGTGCAATGAAGCTTAACATGGTATCA
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TCTCTTCCGGTTGCACGTGTTGACTTGTCTTTCCCGTCACACATGAGAGGGGGTGTTACA
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GCATGAAGCTTAACAATATCAAATCGGTACGATTAGATTCATCATGAAATGAATTTCCAT
ACTTTTTTTGTTCAATATTGCTGATGTCACTATATTTTGCTCTGAACTTGGTAAAAGTTT
TAGAAATTTGACTTCTCAAAAATATAATACCCTTATATTTTGGAACTGATGGAATATTTA
GTTTACCGGGTGGGGAGATGATGGAGTGTGTTTTATTTTCATTTATAATGTGGTGATTTG
GTGGGCCTTTCATGGTGATTTTGTGTTATCCGCTAACCAACCTATATTTATGTGGGGAAA
TTTCTGTGTTGGTGGCTGCATGTACTATGTTGGTGCTACAGTATCACATGGTGGCACTTT
TTTTTTCCAGGTGGAGGGAGGGTGCGCGGGGTTGATATGTTTTTATACCCCGATTGCTGC
TGATTGATTTGGAAAATTGTTGGCACGGTCAAAATCGTAAACCAGATCCAAAATTGAATA
CCTCAATTGAATGAAGAGCTTCAAAATTAGGGAACATAGTGAATTAAAAGAATTGAATGG
GAGAGCTCCTTGAGAAATTGTTGACCTGGTCAAAATCGAGTGATCCAATTCTAAATTGAA
GACCTCAATTAATTTTGTGGCCTTAAAAATTAGGAAGCATAATGTATAGTATAAAAGAAT
TGAATGAGAGCTTCAATAAATTGTTAAGTTGGTCAAAATCAGGTGACCCAATTTCAATTG
GAGACCTCAGTTGAATGTAATCTCTTTAAAACTAGGGAGCATAGTGTTATAGAGAATAGC
GGAGTGGAAATACTACACCTACTATACTCGATTTTCTTAATGGATGAACAATTTGAAACC
GAGACTCTCAAGGCCTTGAAATGTAGTGAACAGATGGATTAGTCACAGTTACAACTAATA
CTGAACAATATTGTATTGGTAATTTGATATTTTCTATTCCTCCGATCCATAGAGCTTCAA
ATCTAAGACAAGTAATATGGATCGGAGGGAGTATTGATTTTGGGACGCTGTTCTACTCTA
GAATAGCACTTTATAGTAAATCAGGCAAAACAATTGGGGAAGGGGGGGGGGGGGGG