Map Locations of contig_40741 (7306 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_40741

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56431 2 2215 bp MLOC_56431.2 Available Available LOC_Os07g06710.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13107.m00644 protein tetratricopeptide repeat, putative, expressed
MLOC_56340 1 631 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_56431






CDS Structure of MLOC_56340






Contig Sequence (7306 bp)

>contig_40741 7306 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCCACCACCGTATCGGCTGGGTTTTGCAAGCTGGCAATGGACAAAACGCATGCCTTTTAA
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GTGAAAGCCCGGTCCAACTAACTGAATTGGTGATAAAATTCCGTCTGTCATGTTCATTTG
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AACCACCTGCGATGGTTAGAGCTCCAGCGCCGTAATCGCAGCTTTCACGCGATGCCTATC
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CCGGCCCCTCTATCGCGTCCATTTTCGGGGCGACGCCTACTGGTGCAGTACAGCGGCCTA
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TGTTTCCCATGGTGGCTTAGCTGGCAACACACATGTGCGGCTGACATGCAGCACCAGCAA
CTCCCCCCCAGTGTTAGAGTGTGGCCATGTCGTTGCTCACAGTAGGGTGTCGACCAGCTC
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CGAGGTTGGCGACAAACAAGCAAAATCGAGTCATGTGTGTTGATTTGGGGAAGAAAGTTG
CGGGGGAAGAGAAATCCTACCGAGCGAAAAATAAGAAAGGGAGAGCGCTAGGATGTCGTG
GGCAAGGCTTAATGTGACACACATGACATTAAATCTAGGGTTTGATACCGAGTGGGTTGG
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CCCTTCTTTAACGAAACATAACATCGATGCAGTGTGGGCAAGTCTTATGATGAAGATTAG
CTTTGGTGTTTTGCCTTTCAAAGGGCAAAAGCCATCTTATATTTTGACCTTGTTGGTGAC
GCGAGAACTCCAAATGATGTACCACTGGGAGATGTCGGTGTACGCGCTATGCATGGTGAA
GCTTGATCGATCGAGCAATGTTCTAGAGTCTAATTCTGCTGGAACAACAGTACCCTGCAA
CAAATATTGAAGAGAAACAAGCTCATCGATAGTCATCAAGTTATAGCCGGCTACGCAAGC
TAAGTTGGACTCCATCTTACATAACCTACGAGAGTAAGGCATTCTGGTGCAGGTGTTGTT
TGAAGAGAGGCAGGATGACGGTGGTATGCGGATCTGAGAAATTAAATCCTTATTTATATA
GCCAAAAAAGGTGGACGCACAATTTTCAACTTTGCACCGGTGATATGTGCAATCTGTTTA
AGGCTTTGTGTTATTTTGGCTAGGAATGATGAATTCAAGACTTGGGAACTAGCCTTCCTA
GGTGGGATGAATACAAGAACTTCTAAGCAAACTTCAACTTTCGGAAGAAAAAATTGAGCT
CTTGAAATTTCAAGTTCTGTATATGTTGACTTTTTTAAATTATTTGAAGTTGTATACAGA
TAGGAATTGTTTGAACAATGAAAGACGTGTTGATGCCCACGTGGGC