Map Locations of contig_40657 (7940 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_40657

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56250 1 1376 bp MLOC_56250.1 Available Available LOC_Os06g48180.1, FRAME:+1, EVALUE:4e-138, 13106.m05121 protein glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_56250






Contig Sequence (7940 bp)

>contig_40657 7940 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGGAGTGGCGCCGCGAAGCCACTACGCAGGAGCGCATCTACGTCGAGCTCTCCTCCTCC
TCCGACGATAACTGAGCGCTGCCGCATCTACTACCGCACGAGCTCCGGTGAGCAAAATTT
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GAAGAAAACCAAGAGCCAGAAGCAAAATAACTGGCAAACAAAGCCGTGTGGTTTCTGATG
GACTTGATCGGGTCAGCATCGCCAGGCTATTGATCGATCCAGCTCACGTACAACCTTGCT
CTCTTTCTCTGGTCCAACCATCCTCGCCCCTACCCATCGAAAGGAATCGAAGGAATGGAA
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TGCTGCTCGCCGGCGTGGCCCGCGCGGCCGGCAACTTCTACCAGGACGTGGACATCACGT
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TTGCACGACCGCACGTGTGCACGTGCGTGTTGACTCGCATCATGCATGGGGAGTACTGTA
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CCACACCTACTCCGTCCTCTGGAACCCCACACACATCCTGTACGTAGTATGCAGACGGCG
TCGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCAACCTCTTGTCGACGCAGGACAAGACCTCATGC
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ACCGCAACCGGGAGGCGGCGACGGGGGTTCCCTACCTGCGGAGCCAGGCGATGAGGGTGT
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TAGTCTATATGAAAAGGCGTTCGTTATATAAATCAATGCAACCAGCTCGACGTCAAACCC
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CCATTGACGCGGCGTGCCGCTGCGCCTTCCACTTGCTAGTATAATTAGATGCATCATCAA
TTTAATTTTCATGTTATATATGGTATTGTACATGTTGATATTTTTTATATAAATATGGTC
AAATTTTATGGAGTTTGACTTAAAACAAAATCTTATATGAGAGTAAAAAGAACTTAAGGG
AGTAATCACTAGTACAAAACAGACCTTTCGTCCAGAGCTCTAGTCCGATCCCGACCGGGT
TTGAACCTAGGACTAATGTGAGCATTAGCCCCGGTTCCAACGGCTAGGAGCGGACGGGGG
CACAGCTAGGATTAGTCCCGATTCAAATGGGACCTCTAATCCCGGTTGGTAATATCAACC
GGGACTAAAGCGGTTACGGCAGGCTGGAGCCCCTGCGAGTCCCTTCACTGCCGGTTGGTA
TCACCAACCGAAACTAAACATAGACCTTTAGGCCCAGTTGGTATATCCAACCGGGGCTAA
AGTCTTCCCTATATAAAGCTGCTTCGTCCAGCTCGAGTGCAAGTTTTCTTTCCTCTATGT
TTCCTTCCCCAAGCTTGAGTTGATCTTTCATTTTTGCCAAGATTTGTCAAGATTGGCGGC
ACCCCATCCATCCAAGGGCTCTAAAAGGTTAGCACCTTCATCCTTTCATCTCTCATTGCT
AGTTTAGCTCGTTTCATGCTTTATAAGTATAGTGATTTGTGGATTTTATTTTGCGAGTAA
TTATGTGGGAGTTTTATTTG