Map Locations of contig_40630 (10251 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_40630

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56203 2 1036 bp MLOC_56203.2 Available Available None
MLOC_56204 4 1435 bp AK359460 Available Available None





CDS Structure of MLOC_56203






CDS Structure of MLOC_56204






Contig Sequence (10251 bp)

>contig_40630 10251 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGGAGGGGAGTTGTAGTCAGATTGCACAAAGTAACCCTAGACGTCACAGTAGTCGGATGT
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AGTCCAGATTTAGTACACTGAACCCACAAAAACATGCAGAGAGAATTTCTATCATGCTTG
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AGTACATGAACTAAGAACAGGAGAAATTAGAGCATACACAACGCACATATTCAGTGTCAG
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GCAGAATTAGATGCAATGAAGACCAAGTATATGAATGTGATATTTGAGTTCATTGTCTTT
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TGTATGGAAAATGCATAGAAATCTGTCACAGTGAATTTGTATGCAAAATGCATAGAAATG
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GCGACAGGCGGGGTGATCTTCCGCAATGGCGACGTTCGAAACGGAGAGCGACAGTGAGCA
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CTCTAGCCCACCTCTTCTCCCTTGAACAACAGAGCTTCGAGGCGCAAGGAAGCAACCCTC
GTCGGCGTTGTCCTGCACCTTCCCTCATCCTCTGACCCTCGCCGCCGCTCCCCTTCAGAT
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GGCGCGTGATTTGCCACCGGACGCCTCAGCACCGGCGCCAACCAGCCCGATGGCGCAACT
CCGGCCAGAGGGATCTGTTCCAGCTCGTCCCATAGATCGTCGGCCTCCCCTGCAACCACG
CCCTCAAGTGCCTCCTCTGCCTCCCTCCACTTCATCCACAACAGCAAAAAGGTATAATTT
CCCCCCTATTTTCATGGATTTTGTCATTGCAAGTGCAGGAAATTTTGTCAAAATGCTGTC
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TGAAATGTATGCTTGGGTTGTGAAAAGGTAAGAACATGTAAGTCTTTTTTGAATGGTGTT
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ACAAGTTGGTTTTTCGTAGTGATATTTTGGCAAGTTCGATTTCTTATAGTGGCATTCTGG
CTATTATCTCCTTGTTATCCTTTATGTCGACTATAACTCGTGCCTCTTCGACTCCGACGC
CGGCCGCTGCTTCTTTTTCTTCGACGATTAAGACCATCCACCGGTCATGAATGCCTACAG
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TGAACGTTGAGTGGTTTTTAGAGATCCATATGTAATCTTTTAATGATCGAAATGTGTATA
TTTAGCTTCGTTTTATAGACCCTACGATAATCAACGTGATTTATTTGATTAACATGTGCA
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GTTAGTGTTGACGACCTTGCAGGGCTGGATAGCCCTTGTAGATACGGCGCGTCTCGCTAC
GGATAGGGATCGCAAAGACGCCGGGCGCGGTGACGCGGCGCGCAGCGACAGCGCTAGGCG
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TCGCGTGAGCTACCAAGAGTGGCGACAGTAGTGGAGAGTGGCAGAGAATGGTGGCGCCCG
GCCTGACCAGAGCTGAGCTGAGCTGAGCTGAGATCCTCCTTTGCGCATGCTTCCTTCTCC
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TCCCCGTGCGCCTCCTCGCCGCCGCCGACAGGGAGCGCAAGGTGACAGTCCTCCGCTTGG
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TGTCTTGGTCAGTTGGACCGGCTGGTGGGGGAGATGCAGGGGCAGATGGAGCGGGTGGTG
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GGCATGCAGCTCAAGGCGCTCAAGAAGGAGAACATGCGGCTCAAGGAGCAGAGGGGCAAG
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CTGGCGGTGGGCGGGATCGCGTGGTCCGCGGACAAGCCATGCCTGCCGCTACTCGCGGGG
CTCGTCGCCGTGGTGGCCATGTCAATGTGCAGCGTGTCGCGCCTCTTCCGCGCGCCCGCG
GACCGCCGCGGCCTGCCTCCGGCGTCCGCAGCTTCCGACGGCGCCGTGGCGCTGCTGAGC
CTCAACTGGTTCCTGCTGGGAGTCCTCACATACCCGATGCTCCCGGGCGTGGCGCGCGCC
GTCGTCCCGCGCGCCGCTCGCCTCGCCGGGCCCGCCATCGCGTGGGTCGCCGCGGCGCTC
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GTTGCTTGAGCTTGTGTGGGTGATGTAGCCGCCTCTCTGTTTTCTTAAGTTGTGCGAGTC
GTTATTGTAGTAAAAAGAGGCTTTATTCTCCTAAACTTGAGCATATACAAAACGTAGAAT
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GCACATCCGCGACACCGGCAGACGAGCAGCAGCACCACCAGTCCGCCTCGGGCCACAGGC
CCGCCAGCCCCCCGTGTGTGCTGGCCGACCTCCAGATTTGGCAATCAACCAAACAACTAC
ACACTGGTCCCGTAGCCCCCGTTGCATCCAGCCACCCACTGGGTTTGTCCCAACACACCA
CGCCACAGGATTGTTAGCCATGCTTCACGCCAACTTTTATACCTTGCTTCCTTCAGTTTT
GCTTTTGATCTTGCATCTTGAGCTGCCGCTACTGCTATTAAGAAAGGGTCTGGCTACGCA
TCAGTCAACTAAGACTTGATAAAGTCTTAGGCCGACGTCATGTGGGCCTTTTTTCTAACA
ATATCATCGTGGCGCTGTATGTTTTCCTTCCGTCGGCTTGTATCGACCTAGGGATTATTG
TTGCTTTTCTCTATAAGTCATCATGTAGTTGCTCATGGGCTAGGAATCAGCCTGTTTTTT
CTTTCATTGTTCCCTTCGGCGGAGCATTACTACACCTTCTATTTCAATCCATTTTGCTAC
CATTTTATATGTATTATTTTTTCTTACATTTTTAAAATTATTTTGTATTGTTAATATAAA
ATGAAAAATAAAAATAAAAAGTTGATCTACTGAAATTGAAGTTGCATGCGGGTTGCGACA
CATGCACTTATAATTCTAATGATGAACATGCAACTAGCGGACATCCCTCCCCCTCCAGTT
GCAGTCCCCTTGTACCGTTTGCAGTTACAGGCCGGTTGATACACGTGCAGTTGCAATTCT
AGTCATGTACATGCAACTGGTCGGCATTCCTTCCCCTTCAGTTGCAACCGCGTTGTACCC
CTTGCAGTTGCAGGAGGGTTGCGACACATGCAATTGTAACTCTAGTGATGTACATGCAAC
TGGTCGACATTCCTTCCCCTTCAGTTGCAGACGCATTGTACCCCTTGCAGTTGTAGGAGG
GTTGCGACACACGCAGTTGTAACTCTAGTGATGAACATGCAACTGGCCGACATCCCTTCC
CTCCAGTTGCAGATGCATTGTACCCCTTGCAGTTGCAGGCGGGTTGCGACA