| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_40628
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_56202 |
1 |
882 bp |
None |
Available |
Available |
LOC_Os02g43540.1, FRAME:+3, EVALUE:7e-13, 13102.m04836 protein retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed |
CDS Structure of MLOC_56202
Contig Sequence (6297 bp)
>contig_40628 6297 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTCGTCTCCCGGCAGGTCTCCTGCCCCCCTCTCCAAGTCTGGCAGGTTTCTTATGGTCCA
AGAAAANNNNTTCCGGAGATTTTATTCCATTTGGAGTCTATTTAATATTCCTTATCTGCA
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GGCGGTGGCGGAGGAAACGGAAGAACGTTTGGTCCACGCGATCGGGGGTACGGTGGACAT
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GAAGATGGTGGCGCTGGCTGGAACAAGCGCGGCGGATTCCGGGGTGGACGGACGGAGAAG
AAGCAGGACGGTGGCGGCAAAAACTGAAGCCGCCCGTACTTGTATGGCTGTACCCTATAC
GTATGGTGTATTCCCTCCTTCCTAAATAGTTCTCTGTTCCTAAATAATTACTAGCAAAAG
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ATGAGGGGGTTTTCTATAAAATAGCACGACGGACTAAGAATACCTATTTATTTTATTAGT
AGGTATAGTTACGGTTTAGAATATTAGAATATATGAGTATTTCAAAAAACATTTAATATG
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TATATTTTTCAACTATAATTATTTAGGTACACAAGAATTATAACTTTTTTAAAACTTTTT
TTACTATAGGAGTACGTACAAATTAAAATGAGTAAATTTACGTCATAATAACTTCGT