Map Locations of contig_40628 (6297 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_40628

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56202 1 882 bp None Available Available LOC_Os02g43540.1, FRAME:+3, EVALUE:7e-13, 13102.m04836 protein retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed





CDS Structure of MLOC_56202






Contig Sequence (6297 bp)

>contig_40628 6297 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTCGTCTCCCGGCAGGTCTCCTGCCCCCCTCTCCAAGTCTGGCAGGTTTCTTATGGTCCA
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AAGCAGGACGGTGGCGGCAAAAACTGAAGCCGCCCGTACTTGTATGGCTGTACCCTATAC
GTATGGTGTATTCCCTCCTTCCTAAATAGTTCTCTGTTCCTAAATAATTACTAGCAAAAG
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CAGTTCAAGATTTCATAAGTCTTCTATTTTAAAACGACTTGCATGTAGCTTTAATACGTA
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TATTCCCAATCCGGATTAGTACCGGTATGAAAGAAAGACGAATAATGAATTATTTATTAA
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ATGAGGGGGTTTTCTATAAAATAGCACGACGGACTAAGAATACCTATTTATTTTATTAGT
AGGTATAGTTACGGTTTAGAATATTAGAATATATGAGTATTTCAAAAAACATTTAATATG
TACTGCGGGTTTAACATTAAAAGTATCAGGGGTTTTCTATTTTTTCTATAAAATAGCACG
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TATATTTTTCAACTATAATTATTTAGGTACACAAGAATTATAACTTTTTTAAAACTTTTT
TTACTATAGGAGTACGTACAAATTAAAATGAGTAAATTTACGTCATAATAACTTCGT