Map Locations of contig_40547 (9206 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_40547

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_56093 3 3445 bp MLOC_56093.2 Available Available LOC_Os11g11960.1, FRAME:-1, EVALUE:0.0, 13111.m01266 protein disease resistance protein RPM1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_56093






Contig Sequence (9206 bp)

>contig_40547 9206 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CATATTCCACGAATATGTTTTTTTACGGGTCCATTATGCAGGGTCTGCATCCGCGGCCGT
GCGCGCCGGCCCGCAAAGACATTTTTCCGTCTGCTAGAGTTGCTCTTAGCCCCGTTGGAA
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TGGAGGCAACTATGCCCCCTCGGCAATAGAACATCACCCTCTTAACATCCCGTATTTCTT
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TCAAATGATTTTTGTAGGAACTTTGGAGGATTGGTATGTTTAGGAATTTATGAAAACAAC
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GATTCTAAACTCAGTTTTATGCACATGCCTAACTACAAAATATGGAGTTGTCCACTTAGG
GTGCTTGTGGTTGAAGGCTATATATGGATGGGTTCGGACCGCTTACTTTACCATCCAATT
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TTTTTAGCACTAACCTATGAACCTAGTGCCACTTGCTATTTTCTCTGTGTTTTTTTATTT
TTCAGGTTTTCAGTATCAAACAAAGTCCAATTGCCATGAAACTTTTTTATGATTTTTTCT
GGACCAAAGAATACATGGAAGCTTCGGGAGGAGACGTGAAGCCACACGTGGTGCCCACAA
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CCTCTTGCTCCGTTCTGTGGCCTATAAATTCACAAATATTCCACAAACCCTAAAGATATT
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TCACCACAGACCTACGTGTACGTGGTTAGTATCTACATGGCTATCTCTCTGGATCTTGAT
CTTCAATGCAATGATCATCGCACCTTCGGTTTGATGTATGCGATGTAATTCTTTTGTATG
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TTGAGTCCTCTCTGAGTTTTAGATTCTTATTTGCATGATCATCATANNNNNNNAATTCTC
TCTGATCTATTGAATTGCTTTGGCAAGTAGTTTGGTATTTCTTCAGCGAGAGGGGTGCGT
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