| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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 |
No map location |  |
Predicted Genes from contig_40444
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_55975 |
2 |
3741 bp |
MLOC_55975.1 |
Available |
Available |
LOC_Os02g53330.2, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13102.m06092 protein 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative, expressed |
| MLOC_55977 |
1 |
512 bp |
MLOC_55977.1 |
Available |
Available |
None |
| MLOC_55976 |
1 |
4267 bp |
MLOC_55976.1 |
Available |
Available |
LOC_Os02g53320.1, FRAME:-1, EVALUE:9e-92, 13102.m06088 protein universal stress protein domain containing protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_55975
CDS Structure of MLOC_55977
CDS Structure of MLOC_55976
Contig Sequence (12526 bp)
>contig_40444 12526 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GATTTCAGACCTAAACTTATTATGTTATCTTTGAATATGAAAATTGTTTAGATCCTATCT
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ACATTATTTTCGGTGATTGTCGTAGTATGAGGANNNNNTGTATTCACTATGTGTTAATGA
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AAATACTTCTCTCGATTGAGAACGAAGGTTTATTAACCTAGTAGGAATTCTCTCTACAAC
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CGGTACATGCCGTGGGGCTAGCCAGGGGCCTTACACGGCCAGGGGGCATCCGCATGGCTA
GGCCAAGTGCCCCCGGTCCCGTGCACCACCTTACGCCAATTATTTAGCCCAAAAATCATA
TTTTTCGTGAAATCCTCCGTACAAATTTTCTCTGATTTTTTCGCCTCCGCAAGTTCGTCT
TCTGAGGAGATCCAACGTGGAGGCTTGTGGAACACTCTGCCGGAGGGGGGATCCAACATC
AAAGGCTTCTTCATCAACCTTGCTGCCTCCATGGCAACGTGTGAGTAGTTTCTTTAGGAC
CTTAGGTTCCATAGAAGTAGCTAAAGGACATCCTTTCTCCATTGCGGTTCAGTACAAAGT
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TATGTAACAATTTACTTCATTTGAATAATTCATTTCATGGCATAACATGATGCGTTGTGG
AATCTTGTTGTATAATTTATTTACCTTGGTCTGAGATTGATATATTATGAACAGTTATGT
CAAATAAATAATATTTATTGTAATTAAAAAATAAGATTGCTTTATCTCAACTTCACATGT
ATCTACTTGCTAATATCAAATTTGATTTTTGTGTTACTGTATTTCAATGAAGAAACATGA
CCTTCCCCATTGAACTTCATGTCTTACAACAAGACGAAGACTTTGTTCCCTATTCATATG
GACCATTACATAGAAAAGAAATTGAAGCATTGTAATATCAAATAATTATTCACTCATTGG
TCAGCAAAACTGCTCAAGTATATGATAGATATGGTATATGAAGCTTTTGTTTGAATCTTA
TTGTTTGCGAGAAATGTCACTACCGTTGAGTTTCCAACCATCGTGTATAATTTTAAAGAC
AATCAAATATCAATTTTAGATTCATGACTGGCCTTTTTTGGGTGGATGCGTTTGGTCTCT
TTTACCATTTATTACGATCACAACTTTTGTGATTATATATTTATATCATATTTTCACTGT
ATTTGATTATTATTATTAAAAAAATTAATCCAGTTCTTTTCAACAACAATTATTTAGATA
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TCCCCGTCGCCGTCAGTTCCACTCCCCCACTCTTCTCCCGTCTCGCCGCCGTCCGCCGTC
GGAGCTCGATCGCCGCCACCGGCATGGCAGGGGTCTCCGCGGCCTCTCCCGCCGCAGCGC
AAATCGGCAGCTTCCTCTCCAAGAAGCCCTACGCGCCGCCGTCCTGGGCCTCGCACCTCG
CCCTCGCCCCTCCCCACACCTTCTCCCTCGGCCATGTAAGCCTTCACCGTCTCCACCACC
GGACCCCTACTCGCTCCGATGGCTATCTGGTGGCTTCAAAGTCAAAGCAGCTTTAGATTG
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CATGTGTAATTCGTAGCTTTGTTTCTGTGTTCCAAACAGTTCCCAACCCCGATTCACAAG
TGGAACCTGCCAAATCTGCCGGAGGGCACTGAAGTATGGATCAAGGTGATGCGCGAACGA
CACTATTCTGTTCATTTCCTAGTGCTGTATAAGGGTAGAAGATAGGGTGCTTATTGTCAT
TTATGTCCTGATACGGGAGCTCTGCGGAAATTGCAGCGGGATGATCTGTCCGGTATGCAG
CTGAGCGGGAACAAGGTCCGGAAGCTCGAGTTTCTGCTGTCAGATGCCGTCGCGCAGGGT
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GCTGCCAAGTATCTCAATCTTGACTGCTATTTGATACTGCGTACTTCCAAGGTAATCCGT
GTGCTTGTGAGGTGGAATCGATAGATTACTGTGTGGTAATACAGTTGGGTTGACCTTGTT
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GTTGAGAGACTGCTGGGAGCACACATTGATCTTGTCTCAAAAGAAGAGTATGGGAAAATT
GGCAGTGTGGTATGCTCTTCTCCATGATGCATCCTGTTACTGATTTTTGTCTTTTCATAG
TTCTGTCAGCCCATGTGTAGTCAAAGCATTGTTCATACACAAGTATTACTCATCATCCAT
GCTTGATCAATTATCTTGGTTGTCAAAAGATCATCCATCAAGTATTTCATGCAGCAATGT
TTGTTCATATTTACTAGGGTCATCCTTTCCCTCCATTGAAACTATTTAGGTAACTTCCTG
TTCATTGGTTGCAACCTGCAAGTAGATAAAATGCTTTGTGCAACTGCTTGTTAATAGCTC
CTCATTGACTTGTTTTTTTCTCTAATTATTTTAATTATGTTTGGAGCTTCCATATTGGCT
AACAGGTTTCTAACCACATGTTGATTTGTTTTTTATAGGCTTTAGCCGACTTGCTTAAAA
AGAGGCTTTTGGAAGAAGGACGGAAGCCATATGTGATTCCTGTTGGTGGATCCAATTCAC
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TTATTTTCTGTGTTTATAGCATAGTTTGATTTCTTCAAGGAATAGTATCCATGGCTTGGT
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TTCAATGGCCAGAAAAAGTAGTATATTATACCAAAATTATTATATGATGAACAAACATTA
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TCCCACACTAGATCCGCCCATGTCTCAGTCCATCGTGAGCGTAGCTATCACTATGTTGAA
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AGCGTAGGATACTATGAATAGTGTTCAATCTGCAAACATAGGCTAAAGAAAATGTAGTGT
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AGATGGTTTGGAGTTCAAATAGGTCTCATAAATTTATGCAAATGATATTCACTTCAGAAT
GTCGATCCTATGTTTGTAATGTACGTCACGTCTTCCTTCTATAGGGGATATATTGAAGCA
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GTTGCCTGTGGCAGGTAATTCATCAACACCTGTTATTCTGTCCTTTTCTATGGAGATAGT
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TGCTGAAGTTTAAATACTAATTATCCACTTGTAGGATAGGTCCATGCATTCTCTGTTTGC
GATGACCCTGAATACTTCTATGATTATGTTCAAGGCCTGATTGATGGACTACAATCTGGC
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TTATGTGCATATGACATAGTTTTTTCTGCATCTTTTTTGTTCATTTCTTATTTTCTTTAG
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TATATGCAAGTTGGTTGAATTTGTGAATATTTGCTTGCTCACAGCAACTTCTGCTTGACA
GGCTAAGGGCTTAGGTTATGCCATGAACACAGCTGAGGAGCTTAAGTTTGTTAAAGATAT
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GAAGGGAGCATATGCAATGCTGAAAGACATGGCTGCTAATCCTTCCAAGTGGAATGGGCG
GAAAGTCCTCTTTGTCCACACAGGCGGTCTTCTTGGGTTGTATGACAAGGTTGATCAGAT
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TGGCACTGGTAAGATGTTTTGATTGCTATGCTCCAGAAACCGCTTCCATTATGCGTTGGA
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CCCCAATATATTTTTGCCAGTATTTCCACCTGATTCAACCAACGTGGAATCGATCTCTAG
TTAGCAGCACATTTTCATTGCCTGAACTGGCCTTATGAATTCAACAAAGATAATTGCATC
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TGCAGGATCTCCAGCACGTCCTTGTCGGGGTTGACCCCGTACCTCGCCTGCACGTTCATC
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CTGGGTTAAGGATTGTGCCCCAAGCAGCGGTATTTAAGGTGGTTGGATCGGATGGAGTCC
AGCAAAATAGCCTATGATGATTGCGAAGTTGCAGACTAGGTTGGCTTTTGGTTTTATTCG
CTTTTTACACACAGAGAGAGGGGAGGGCGGGTGGCTTTATTCCTTGGAGCAAAACTGTTG
CTGGATGGATTCTTTCCTTTTCCATGGCCTTGCCAGATGGACAAAGCTATGATGGTTGAT
CGAGGTCCAGAAGGCTCTCCGCCTCTCTGGAAAGCTCGGGAAGGGAACGGAACCGCTCAT
TCGTCCAAGTTTGGTAAAACCCGGGCCGGAAACCAGTAATGTTTCCCACTGTAGTTTTCG
CCCCGTTTTAATGTTGGCGTAGCGGGTGAGTGTGAGGTTCTGGAAATATTAGTGGCGTGT
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ATAAATATTCTACTACATTAGCCCGTGATTATCCTTTCCATATTAATTTGATTGTGTAAA
TGTATGTTCATTGAATCGGGACATTAATTTTCCTACCTAAATAAATCTTAGGATTTTATT
TGGCGATCACTTATTTGGTAAGAACTTACTGGCTTATCAAAGAAAAATGTACCGTATTTT
TTTAGTCAATAGTAAGACAGTTAAGACGGCTTTCAAGTAAAACCGATTGAAAAGGAAACT
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AAATTAAAAGATTGGTCGCCTCGGTGACCGTTGGATGAAGCTGGCGATGGTCGTATGATC
TACCCATGTGATCCGATGAAGCTGGGGATGATCGTGTGATCTACCCACGTGATCCGTCAT
CTTTGTAATAAATATTTTGTTGTAATATTTTCTGTAACAATGGTCTAGTTACAATTTTTT
TTCGCAACATAGGGACTTGCAGATTAATTTTTATAACAAAGATCATGATGCAGAAATTTT
TAAAACTGTTTTTTCCTATGAACCTTGCAGCAAGCAACTTTTTGCAACATGTGTCTTGCT
ACAAAACTCCCTGTTGCAAAAAAATAAAAATCAAGTGCGGATCCCACTCCATGTTTTGAG
ATCGACGCAGATCCGACGGGAGGCTGCTGGGGCGGGGTCTTGGGACAGCCGATGGAAAGG
TGATCGATGGCTGAGAAGATGGAGCAGGAGAGAGAGTCGGACCCGATGATGGAAGAAAGA
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AAAACCACCCCCGGCCCCTGCCTCGCAACCACCCTCCCCCTTACTC
